Accession PRJCA002188
Title Chloroplast genome of Chinese medicinal materials
Relevance Medical
Data types Whole genome sequencing
Genome sequencing and assembly
Organisms Stephania tetrandra
Cistanche salsa
Impatiens balsamina
Vincetoxicum glaucescens
Vitex rotundifolia
Bassia scoparia
Aconitum brachypodum
Ligularia rumicifolia
Citrus wilsonii
Tetrapanax papyrifer
Xanthopappus subacaulis
Cephalotaxus fortunei
Clematis mandshurica
Lantana camara
Lysimachia candida
Angelica sinensis
Zanthoxylum echinocarpum
Chaenomeles speciosa
Buddleja davidii
Lilium pumilum
Achillea millefolium
Pyrrosia sheareri
Lagotis brevituba
Uncaria yunnanensis
Typhonium flagelliforme
Aconitum flavum
Achillea wilsoniana
Euphorbia sieboldiana
Carpesium abrotanoides
Codonopsis pilosula
Luffa aegyptiaca
Justicia gendarussa
Sinosenecio oldhamianus
Crataegus cuneata
Pistacia chinensis
Zanthoxylum armatum
Illicium micranthum
Fallopia multiflora
Hemsleya chinensis
Elatostema stewardii
Cuscuta japonica
Gentiana manshurica
Malva cathayensis
Thevetia peruviana
Oxalis stricta
Achillea alpina
Urtica cannabina
Cyathula officinalis
Carya cathayensis
Ranunculus chinensis
Machilus leptophylla
Saposhnikovia divaricata
Alkekengi officinarum var. franchetii
Daucus carota
Delphinium yunnanense
Clematis finetiana
Hydrangea macrophylla
Lophatherum gracile
Periploca forrestii
Raphanus sativus
Cinnamomum tamala
Delphinium anthriscifolium
Ilex cornuta
Anemone rivularis
Hansenia weberbaueriana
Cirsium setosum
Impatiens leptocaulon
Urena lobata
Aconitum tanguticum
Stephania cephalantha
Psammosilene tunicoides
Cynanchum ascyrifolium
Claoxylon indicum
Aristolochia kwangsiensis
Ligusticum sinense
Alstonia scholaris
Plumbago zeylanica
Vincetoxicum hirsutum
Solanum capsicoides
Ligularia tsangchanensis
Clematis glauca
Metagentiana rhodantha
Akebia quinata
Nardostachys jatamansi
Achyranthes bidentata
Lonicera hypoglauca
Osyris wightiana
Pedicularis resupinata
Glochidion puberum
Chonemorpha megacalyx
Datura metel
Clematis apiifolia
Nerium oleander
Solanum coagulans
Solidago decurrens
Anemone hupehensis
Lobelia seguinii
Actaea heracleifolia
Persicaria perfoliata
Rhus potaninii
Melodinus suaveolens
Aconitum naviculare
Phlomoides rotata
Heynea velutina
Berberis bealei
Euphorbia prolifera
Allium macrostemon
Clematis florida
Verbena officinalis
Arcangelisia gusanlung
Girardinia diversifolia
Lobelia taliensis
Atractylodes lancea
Iris japonica
Murraya euchrestifolia
Coptis deltoidea
Dictamnus albus
Hypericum attenuatum
Petasites japonicus
Gladiolus x gandavensis
Dracaena cochinchinensis
Pyrrosia lingua
Kitagawia praeruptora
Gentiana scabra
Lepidium apetalum
Dianella ensifolia
Erycibe obtusifolia
Rauvolfia verticillata
Hansenia forbesii
Eupatorium fortunei
Celosia cristata
Hypericum perforatum
Lepidium virginicum
Aglaonema modestum
Rhamnus ussuriensis
Hemerocallis lilioasphodelus
Rosa laevigata
Aconitum carmichaelii
Descurainia sophia
Gynura pseudochina
Iris collettii
Clinopodium polycephalum
Erycibe schmidtii
Crotalaria assamica
Phytolacca acinosa
Iphigenia indica
Anisomeles indica
Campsis radicans
Dioscorea spongiosa
Piper kadsura
Zanthoxylum nitidum
Gentiana triflora
Abrus precatorius
Citrus maxima
Eleutherococcus nodiflorus
Thalictrum minus var. hypoleucum
Crinum asiaticum var. sinicum
Convallaria majalis
Hydrangea strigosa
Rheum officinale
Zanthoxylum bungeanum var. punctatum
Mirabilis jalapa
Scrophularia ningpoensis
Atractylodes koreana
Millettia pachycarpa
Sigesbeckia glabrescens
Aquilegia incurvata
Isodon rubescens
Saussurea medusa
Ficus hispida
Persicaria filiformis
Callicarpa formosana
Persicaria tinctoria
Cuscuta reflexa
Zanthoxylum molle
Berberis vernae
Changium smyrnioides
Styrax japonicus
Tetradium glabrifolium
Lycium chinense
Adonis amurensis
Lablab purpureus
Acmella paniculata
Wikstroemia nutans
Dregea sinensis
Uncaria sinensis
Polygala japonica
Solanum aculeatissimum
Celastrus hypoleucus
Geranium wilfordii
Polygonum aviculare
Iris speculatrix
Euonymus grandiflorus
Hymenidium delavayi
Hemerocallis minor
Zephyranthes candida
Crotalaria sessiliflora
Piper hongkongense
Cuscuta australis
Isatis tinctoria
Uncaria rhynchophylla
Laportea cuspidata
Phellodendron chinense
Narcissus tazetta subsp. chinensis
Pieris japonica
Benincasa hispida
Artemisia finita
Hydnocarpus anthelminthicus
Neopicrorhiza scrophulariiflora
Leuzea uniflora
Adenophora stricta
Inula hupehensis
Cinnamomum wilsonii
Papaver nudicaule
Aesculus chinensis
Meconopsis integrifolia
Ilex latifolia
Trachelospermum axillare
Gentiana rigescens
Abutilon theophrasti
Valeriana jatamansi
Eutrema scapiflorum
Ardisia crenata
Daphne retusa
Angelica dahurica var. formosana
Prunus mume
Sanicula astrantiifolia
Saxifraga mengtzeana
Clematis uncinata
Euphorbia esula
Meconopsis horridula
Aconitum scaposum
Imperata cylindrica var. major
Sophora tonkinensis
Prunus armeniaca
Senna occidentalis
Chloranthus multistachys
Tripterygium wilfordii
Callicarpa nudiflora
Commelina communis
Pedicularis oederi var. sinensis
Saussurea costus
Trigonella foenum-graecum
Urtica angustifolia
Syneilesis aconitifolia
Sinomenium acutum
Alyxia sinensis
Bergenia purpurascens
Erythrina variegata
Buddleja lindleyana
Inula helianthus-aquatilis
Helwingia japonica
Melia azedarach
Physalis pubescens
Aglaomorpha fortunei
Ligularia nelumbifolia
Vincetoxicum floribundum
Pedicularis dissecta
Sinacalia tangutica
Coix lacryma-jobi var. ma-yuen
Citrus medica
Hydrangea paniculata
Clinopodium chinense
Morus alba
Drynaria sinica
Vigna umbellata
Anemone rivularis var. flore-minore
Fritillaria delavayi
Zanthoxylum dissitum
Arnebia euchroma
Corallodiscus lanuginosus
Crotalaria pallida
Glechoma longituba
Nothosmyrnium japonicum
Solanum septemlobum
Medicago sativa subsp. falcata
Picrasma quassioides
Aconitum scaposum var. vaginatum
Vincetoxicum pycnostelma
Alpinia hainanensis
Phlomoides umbrosa
Typha latifolia
Oreocharis benthamii var. reticulata
Solanum violaceum
Dracaena cambodiana
Selliguea mairei
Lycianthes lysimachioides
Epilobium royleanum
Rubia cordifolia
Alisma plantago-aquatica subsp. orientale
Papaver rhoeas
Wikstroemia dolichantha
Phlomoides melanantha
Panax japonicus var. bipinnatifidus
Boenninghausenia albiflora
Strophanthus divaricatus
Vincetoxicum amplexicaule
Citrus x aurantium
Cremastra appendiculata
Oxytropis ochrocephala
Capparis acutifolia
Mosla chinensis
Panax major
Vincetoxicum versicolor
Aconitum hemsleyanum
Arisaema heterophyllum
Epimedium pubescens
Phyllodium pulchellum
Aconitum taipeicum
Urtica lobatifolia
Aristolochia championii
Helicteres angustifolia
Embelia scandens
Oxytropis glabra
Gypsophila vaccaria
Zanthoxylum ailanthoides
Inula caspica
Asparagus cochinchinensis
Potentilla chinensis
Abelmoschus manihot
Zanthoxylum austrosinense
Citrus maxima 'Tomentosa'
Typha orientalis
Nicandra physalodes
Dioscorea polystachya
Hydrangea febrifuga
Solanum erianthum
Thymus quinquecostatus var. przewalskii
Lycoris radiata
Rumex japonicus
Abrus pulchellus subsp. cantoniensis
Cnidium monnieri
Daphne feddei
Stephania dielsiana
Cyrtomium caryotideum
Pyrrosia subfurfuracea
Pedicularis davidii
Dioscorea panthaica
Jacobaea argunensis
Saurauia napaulensis
Catharanthus roseus
Tacca plantaginea
Tamarix chinensis
Ampelopsis aconitifolia var. palmiloba
Stemona sessilifolia
Magnolia coco
Eomecon chionantha
Mosla scabra
Viscum ovalifolium
Solanum lyratum
Campsis grandiflora
Daphne acutiloba
Akebia trifoliata subsp. australis
Euphorbia pekinensis
Tetrastigma obtectum var. glabrum
Hoya carnosa
Malva verticillata var. crispa
Broussonetia papyrifera
Siphonostegia chinensis
Lycopus lucidus var. hirtus
Paris polyphylla var. chinensis
Lonicera fulvotomentosa
Neocinnamomum lecomtei
Trachelospermum jasminoides
Urtica laetevirens
Buddleja asiatica
Smilax glabra
Senecio scandens
Tetradium ruticarpum
Trichosanthes rosthornii
Polygala tenuifolia
Callicarpa kwangtungensis
Centella asiatica
Ardisia japonica
Inula linariifolia
Eupatorium chinense
Sanguisorba officinalis var. longifolia
Dolomiaea souliei
Vincetoxicum atratum
Cissus repens
Uncaria macrophylla
Hyoscyamus pusillus
Macleaya cordata
Clematis chinensis
Daphne papyracea
Vitex negundo var. cannabifolia
Picria felterrae
Selaginella pulvinata
Celastrus orbiculatus
Achillea acuminata
Inula salsoloides
Corchorus capsularis
Ipomoea mauritiana
Taraxacum sinicum
Cornus controversa
Saururus chinensis
Acmella calva
Stephania delavayi
Zanthoxylum acanthopodium
Vincetoxicum stauntonii
Piper hancei
Vitex trifolia subsp. litoralis
Chamaenerion angustifolium
Uncaria hirsuta
Gymnaconitum gymnandrum
Triplostegia glandulifera
Persicaria orientalis
Corynandra viscosa
Toxicodendron vernicifluum
Ranunculus japonicus
Bolbostemma paniculatum
Phlomoides szechuanensis
Rhaphidophora hongkongensis
Aconitum nagarum
Mosla soochowensis
Decaneuropsis cumingiana
Dianthus superbus
Achnatherum inebrians
Euonymus yunnanensis
Crataegus pinnatifida
Flueggea virosa
Gelsemium elegans
Crataegus pinnatifida var. major
Geum japonicum var. chinense
Celastrus angulatus
Viscum coloratum
Clematis montana
Munronia pinnata
Pterocephalus hookeri
Pueraria montana var. thomsonii
Blumea balsamifera
Gardenia jasminoides
Prunus japonica
Pleione bulbocodioides
Hemiboea subcapitata
Oxytropis kansuensis
Lysidice rhodostegia
Juniperus chinensis
Anisodus luridus
Ligusticum chuanxiong
Choerospondias axillaris
Laggera crispata
Micromelum falcatum
Murraya microphylla
Apocynum venetum
Actaea dahurica
Chaenomeles thibetica
Echinops grijsii
Syringa reticulata subsp. amurensis
Bupleurum chinense
Atractylodes japonica
Centipeda minima
Zizania latifolia
Plumbago indica
Medicago lupulina
Zephyranthes carinata
Erythrina arborescens
Santalum album
Arnebia guttata
Kalopanax septemlobus
Mimosa pudica
Urceola micrantha
Alpinia officinarum
Piper wallichii
Erodium stephanianum
Periploca calophylla
Schizonepeta tenuifolia
Rheum tanguticum
Rotheca serrata
Trachycarpus fortunei
Iris tectorum
Murraya exotica
Lysimachia christinae
Biancaea decapetala
Potentilla discolor
Callicarpa kochiana
Cinnamomum aromaticum
Hypecoum erectum
Syzygium jambos
Cotoneaster perpusillus
Rhamnus davurica
Gymnema sylvestre
Bambusa textilis
Momordica cochinchinensis
Ligusticum jeholense
Sphaeranthus indicus
Mesostemma dichotomum var. lanceolatum
Clematis intricata
Prinsepia uniflora
Achillea ptarmicoides
Aristolochia debilis
Actaea cimicifuga
Gynochthodes officinalis
Phragmites australis
Agastache rugosa
Albizia julibrissin
Daphne giraldii
Daphniphyllum calycinum
Canavalia gladiata
Odontites vulgaris
Alyxia siamensis
Litsea cubeba
Paris verticillata
Zanthoxylum stipitatum
Skimmia reevesiana
Coriaria nepalensis
Scutellaria barbata
Eleutherococcus senticosus
Laportea bulbifera
Panax japonicus
Valeriana hardwickii
Delphinium candelabrum var. monanthum
Reynoutria japonica
Turpinia arguta
Viola philippica
Physalis peruviana
Actaea japonica
Fibraurea recisa
Uncaria scandens
Malva verticillata
Prunus sibirica
Solanum pseudocapsicum
Senecio asperifolius
Microcos paniculata
Oroxylum indicum
Berberis poiretii
Houttuynia cordata
Pterocephalus bretschneideri
Xanthium sibiricum
Chlorophytum laxum
Hedysarum polybotrys
Plantago asiatica
Hibiscus syriacus
Catunaregam spinosa
Murraya paniculata
Pueraria montana var. lobata
Clematis hexapetala
Uncaria sessilifructus
Veratrum nigrum
Impatiens pritzelii
Berberis diaphana
Breynia fruticosa
Perilla frutescens
Wikstroemia indica
Mentha canadensis
Scurrula parasitica
Iris uniflora
Senna alexandrina
Hibiscus rosa-sinensis
Eupatorium lindleyanum
Zanthoxylum multijugum
Sinapis alba
Carpesium cernuum
Hibiscus mutabilis
Stachyurus chinensis
Uncaria laevigata
Aristolochia fordiana
Dicranostigma leptopodum
Dysphania ambrosioides
Angelica dahurica
Brucea javanica
Corydalis pallida
Murraya alata
Viscum liquidambaricola
Barnardia japonica
Stauntonia chinensis
Dioscorea hispida
Chrysanthemum x morifolium
Lycopodium japonicum
Rohdea wattii
Croton lachnocarpus
Papaver nudicaule var. aquilegioides
Aconitum sungpanense
Stellaria vestita
Cirsium japonicum
Glaucium squamigerum
Symplocos paniculata
Dryopteris crassirhizoma
Orostachys fimbriata
Gynandropsis gynandra
Conioselinum acuminatum
Citrus medica var. sarcodactylis
Osmunda japonica
Pedicularis decora
Piper longum
Convolvulus arvensis
Polygonatum odoratum
Alpinia galanga
Heynea trijuga
Bistorta officinalis
Alyxia balansae
Prunus armeniaca var. ansu
Strychnos nux-vomica
Echinops latifolius
Periploca sepium
Trillium camschatcense
Aesculus chinensis var. wilsonii
Lagopsis supina
Melicope pteleifolia
Paraprenanthes melanantha
Adenophora triphylla
Conioselinum pteridophyllum
Ranunculus sceleratus
Bupleurum scorzonerifolium
Chloranthus spicatus
Ilex asprella
Lysimachia lobelioides
Physochlaina infundibularis
Rhamnus parvifolia
Melilotus officinalis
Viscum nudum
Daphne genkwa
Gynochthodes umbellata
Berberis fortunei
Anemone vitifolia
Euphorbia hylonoma
Tephrosia purpurea
Breynia retusa
Meeboldia yunnanensis
Cryptolepis sinensis
Tussilago farfara
Pyrrosia petiolosa
Aconitum pendulum
Senna tora
Scaphium affine
Angelica biserrata
Bambusa beecheyana var. pubescens
Buddleja albiflora
Fraxinus chinensis subsp. rhynchophylla
Ranunculus ternatus
Tribulus terrestris
Viscum album subsp. meridianum
Flueggea suffruticosa
Rohdea japonica
Chaenomeles sinensis
Silene viscidula
Celosia argentea
Triglochin maritima
Polygonatum kingianum
Phytolacca americana
Zanthoxylum oxyphyllum
Torilis japonica
Ormosia fordiana
Sigesbeckia orientalis
Epimedium brevicornu
Hydrangea chinensis
Ranunculus amurensis
Bistorta amplexicaulis subsp. sinensis
Wikstroemia canescens
Malva pusilla
Taxillus chinensis
Ilex rotunda
Murraya kwangsiensis
Euphorbia fischeriana
Dianthus chinensis
Typha angustifolia
Atractylodes macrocephala
Tabernaemontana bufalina
Pentanema britannicum
Strychnos ignatii
Inula helenium
Alstonia mairei
Aconitum hemsleyanum var. circinatum
Duranta erecta
Cullen corylifolium
Cynanchum otophyllum
Ophiopogon japonicus
Anisodus acutangulus
Ajuga decumbens
Alnus lanata
Chloranthus serratus
Citrus reticulata
Inula japonica
Maytenus hookeri
Sigesbeckia pubescens
Valeriana amurensis
Pleione yunnanensis
Rhodiola crenulata
Salsola collina
Fallopia multiflora var. ciliinervis
Ipomoea nil
Cynanchum officinale
Dactylicapnos scandens
Stachyurus himalaicus
Machilus japonica var. kusanoi
Verbascum thapsus
Vincetoxicum mongolicum
Cotoneaster microphyllus
Daphne odora
Rhamnus crenata
Teucrium viscidum
Derris trifoliata
Levisticum officinale
Corydalis racemosa
Mosla dianthera
Sambucus sibirica
Daphne kiusiana var. atrocaulis
Strychnos angustiflora
Solanum procumbens
Dolomiaea souliei var. cinerea
Senecio nemorensis
Euphorbia pulcherrima
Alocasia cucullata
Cuscuta chinensis
Euphorbia tithymaloides
Bistorta coriacea
Conioselinum vaginatum
Geum aleppicum
Magnolia biondii
Senecio nudicaulis
Buddleja officinalis
Calanthe alpina
Clematis armandii
Gynura divaricata
Murraya kwangsiensis var. macrophylla
Pyrrosia bonii
Swertia pseudochinensis
Alstonia yunnanensis
Angelica acutiloba
Atractylodes carlinoides
Pachysandra axillaris
Euonymus maackii
Persicaria sagittata
Vitex trifolia
Iris domestica
Description The chloroplast genomes of Chinese medicinal materials
Sample scope Multispecies
Release date 2021-12-28
Grants
Agency program Grant ID Grant title
Ministry of Science and Technology of the People's Republic of China (MOST) Special project on basic resources of science and technology 2018FY100800
Submitter Ziyuan Chen (c_ziyuan@163.com)
Organization National Resource Center for Chinese Materia Medica, China Academy of Chinese Medical Sciences
Submission date 2020-02-03

Project Data

Resource name Description
BioSample (974)  show -
GSA (2) -
CRA004065 Genomes of traditional Chinese medicine plants
CRA004029 Cynanchum mongolicum G620621LY0179