| Accession | PRJCA006183 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Title | The role of protein machine in tumorigenesis, development and metastasis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Relevance | Medical | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Data types |
Whole genome sequencing
Exome Transcriptome or Gene expression Variation Genome sequencing and assembly Genome sequencing whole genome sequencing |
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| Organisms |
Mus musculus
Homo sapiens |
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| Description | This project aims to clarify the mechanism of tumorigenesis and development and the impact of microenvironment, find new protein machines related to tumorigenesis, development and metastasis, reveal the impact and regulation mechanism of tumor microenvironment on protein machines, and provide a basis for the development of new tumor diagnosis and treatment methods. The following key scientific problems are to be solved: 1. The mechanism of protein machines related to DNA replication and transcriptional regulation, and the influence of tumor microenvironment on these protein machines; 2. The mechanism of tumor suppressor protein and immune protein machine in the process of tumorigenesis and development; 3. Regulation of tumor microenvironment on tumor metastasis related protein machine; 4. The interaction mechanism between tumor cells and immune microenvironment, and the strategy of activating immune protein machine to carry out tumor immunotherapy. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sample scope | Monoisolate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Release date | 2021-08-16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Publication |
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| Grants |
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| Submitter | Yuxin Yin Yin (ly0629@bjmu.edu.cn) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organization | Peking University Health Science Center | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Submission date | 2021-07-30 |
| Resource name | Description |
|---|---|
| BioSample (21) show | - |
| GSA (4) | - |
| CRA004961 | ATAC-seq analysis of CD8+ T cells responding to sustained viral infection |
| CRA004957 | ChIP-seq analysis of wild-type or PAC1-/- T cells with anti-H3K27-ac |
| CRA004956 | Global analysis of CHD4 targeted genes in Wild-type and Pac1-/- exhausted T cells |
| CRA004955 | RNA sequencing analysis of CD8+ T cells sorted from WT and Pac1-/- mice post infection with LCMV Cl13 |