样本编号 SAMC069964
样品名称 Ss.lib1
样本标题 Hi-C of sugarcane: leaves
样品类型 Plant sample
物种名称 Saccharum spontaneum
描述信息 Sugarcane AP85-441, which is a haploid (1n=4x=32) of Saccharum spontaneum, contains 32 chromosomes and 8 sets of homologous chromosomes with four members each. Our previous study reported AP85-441 contig level assembly with assembly size 3.13 Gb and N50 of 45 kb by incorporating 35,156 BAC libraries and ~80 X Pacbio reads.
样本属性
栽培品种 Wile species
实验材料提供者 Haixia Institute of Science and Technology, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, Fujian Province, China
组织 leaf
生长时期
细胞系
细胞类型
采样单位
取样时间
收集/保存方法
发育阶段
疾病名称
疾病分期
基因型
培养方法
高度/长度
取样来源
经纬度
表型
数量
类型
性别
凭证标本
培养温度
处理方法
发布日期 2019-05-31
项目编号 PRJCA001420
提交者 Jing  Lin  (lolyemily@163.com)
提交单位 Fujian Agriculture and Forestry University cs, Chinese Academy of Sciences
提交日期 2019-05-14

样本包含数据信息

资源名称 描述
GSA (1) -
CRA001597 ALLHiC: assembly of allele-aware, chromosomal scale autopolyploid genomes based on Hi-C data