Accession | SAMC2520043 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Accession in Other Database | GSA-Human: HRS510163 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sample name | SARS2-huh7-DMSO_rep1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Title | SARS2-huh7-DMSO_rep1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sample type | Human sample | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | icSHAPE of SARS-CoV-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Attributes |
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Custom attributes |
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Release date | 2023-01-06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioProject Accession | PRJCA014248 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Submitter | Qiangfeng Cliff Zhang (qczhang@tsinghua.edu.cn) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organization | Tsinghua University | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Submission date | 2023-06-18 |
Resource name | Description |
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GSA-Human (1) | - |
HRA003742 (Open Access) | we resolved the RNA secondary structure of SARS-CoV-2 infected in Huh7 cells based on in vivo click selective 2'-hydroxyl acylation and profiling experiment (icSHAPE). We built RNA structural model of SARS-CoV-2, found some functional structural elements, analysed the RNA structure conservation among different coronavirus. Also, we predicted RBP binding sites and identified some potential drug for CoVID-19 therapy. |