| Accession | SAMC2520047 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Accession in Other Database | GSA-Human: HRS510164 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sample name | SARS2-huh7-DMSO_rep2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Title | SARS2-huh7-DMSO_rep2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sample type | Human sample | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | icSHAPE of SARS-CoV-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Attributes |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Custom attributes |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Release date | 2023-01-06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioProject Accession | PRJCA014248 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Submitter | Qiangfeng Cliff Zhang (qczhang@tsinghua.edu.cn) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organization | Tsinghua University | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Submission date | 2023-06-18 |
| Resource name | Description |
|---|---|
| GSA-Human (1) | - |
| HRA003742 (Open Access) | we resolved the RNA secondary structure of SARS-CoV-2 infected in Huh7 cells based on in vivo click selective 2'-hydroxyl acylation and profiling experiment (icSHAPE). We built RNA structural model of SARS-CoV-2, found some functional structural elements, analysed the RNA structure conservation among different coronavirus. Also, we predicted RBP binding sites and identified some potential drug for CoVID-19 therapy. |