The input sequence data files

EMBOSS 软件包序列分析程序应用实例

补充材料 2 – 输入序列文件列表

编号文件名说明类型程序
D01Z84721.FASTA人 alpha 血红蛋白基因家族DNAcpgplot
D02V00714.GB小鼠 alpha 血红蛋白编码基因DNAcoderet, extractfeat, showfeat
D03V00714.FASTA小鼠 alpha 血红蛋白编码基因DNAfreak
D04AF164138.FASTA河豚鱼基因组序列片段DNAdottup
D05ECOLI_K12.FASTA大肠杆菌基因组序列DNAcompseq
D06MYCTO_H37.FASTA结核分枝杆菌基因组序列DNAcompseq
D07CALSU_MB4.FASTA泉生热胞菌基因组序列DNAcompseq
D08EF565211.FASTA果蝇性别相关基因 DNA 序列DNAeinverted
R01Y12618.GB豌豆开花后特异表达基因mRNAseqret, showseq
R02Y12618.FASTA豌豆开花后特异表达基因mRNAgetorf, sixpack, getorf, infoseq
R03Y12618_CDS.FASTA豌豆开花后特异表达基因编码区mRNAmsbar, cusp, chips
R04AF164138_CDS_1.FASTA河豚鱼基因组序列编码区mRNAdottup
R05AF164138_CDS_2.FASTA河豚鱼基因组序列编码区mRNAdottup
R06ATH-MIR172C.FASTA拟南芥 microRNARNApalindrome
P01HBA_HUMAN.FASTA人 alpha 血红蛋白蛋白质needle
P02HBA_MOUSE.FASTA小鼠 alpha 血红蛋白蛋白质needle
P03HBA_RAT.FASTA大鼠 alpha 血红蛋白蛋白质needle
P049HUMAN_HB.FASTA9 个人源血红蛋白蛋白质emma
P05PPF1_PEA.SW豌豆内膜蛋白蛋白质seqret
P06PPF1_PEA.FASTA豌豆内膜蛋白蛋白质tmap
P07PPF1_PEA_H1.FASTA豌豆内膜蛋白第 1 个跨膜螺旋蛋白质pepwheel
P0812HUMAN_CEA.FASTA12 个人源癌胚抗原蛋白质infoseq
P09CEAM3_HUMAN.FASTAIII 型癌胚抗原蛋白质needle, water, antigenic
P10CEAM4_HUMAN.FASTAIV 型癌胚抗原蛋白质needle
P11CEAM5_HUMAN.FASTAV 型癌胚抗原蛋白质water
P12AF164138_PRO_1.FASTA河豚鱼基因组序列蛋白质产物蛋白质dottup
P13AF164138_PRO_2.FASTA河豚鱼基因组序列蛋白质产物蛋白质dottup
P14SLIT_DROME.FASTA果蝇体节发育相关基因蛋白质dotmatcher
P15Q1PIH9_ORYSI.FASTA水稻落粒控制基因蛋白质产物蛋白质pepstats, wordcount
P1617ARATH_SPLD.FASTA17 个植物特异 SBP 转录因子蛋白质fuzzprot
P171MBN.FASTA抹香鲸肌红蛋白蛋白质garnier
P182QSQ.FASTA人源癌胚抗原 N 端结构域蛋白质garnier
P191UBQ.FASTA人源泛素蛋白蛋白质garnier
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