The output result data files
EMBOSS 软件包序列分析程序应用实例
补充材料 3 – 输出结果文件列表
| 编号 | 文件名 | 程序类别 | 程序 | 格式 |
| G01 | AF164138.svg | 点阵图 | dottup | 图形 |
| G02 | AF164138_GENE.svg | 点阵图 | dottup | 图形 |
| G03 | AF164138_CDS.svg | 点阵图 | dottup | 图形 |
| G04 | AF164138_PRO.svg | 点阵图 | dottup | 图形 |
| G05 | SLIT_DROME_W10T23.svg | 点阵图 | dotmatcher | 图形 |
| G06 | SLIT_DROME_W24T20.svg | 点阵图 | dotmatcher | 图形 |
| G07 | SLIT_DROME_W38T20.svg | 点阵图 | dotmatcher | 图形 |
| G08 | SLIT_DROME_W38T30.svg | 点阵图 | dotmatcher | 图形 |
| G09 | Z84721_CPGPLOT.svg | CpG 岛识别 | cpgplot | 图形 |
| G10 | V00714_FREAK.svg | 序列组分统计 | freak | 图形 |
| G11 | PPF1_PEA_TMAP.svg | 二级结构分析 | tmap | 图形 |
| G12 | PPF1_PEA_H1_PEPWHEEL.svg | 二级结构分析 | pepwheel | 图形 |
| T01 | v00714.coderet | 序列提取 | coderet | 文本 |
| T02 | v00714.cds | 序列提取 | coderet | 文本 |
| T03 | v00714.mrna | 序列提取 | coderet | 文本 |
| T04 | v00714.prot | 序列提取 | coderet | 文本 |
| T05 | v00714.noncoding | 序列提取 | coderet | 文本 |
| T06 | V00714.INTRON | 序列提取 | extractfeat | 文本 |
| T07 | Y12618_CDS_NEW.FASTA | 序列变换 | msbar | 文本 |
| T08 | Y12618.INFO | 序列显示 | infoseq | 文本 |
| T09 | 12HUMAN_CEA.INFO | 序列显示 | infoseq | 文本 |
| T10 | Y12618.SHOWSEQ | 序列显示 | showseq | 文本 |
| T11 | V00714.SHOWFEAT | 序列显示 | showfeat | 文本 |
| T12 | HUMAN-MOUSE.NEEDLE | 双序列比对 | needle | 文本 |
| T13 | HUMAN-RAT.NEEDLE | 双序列比对 | needle | 文本 |
| T14 | MOUSE-RAT.NEEDLE | 双序列比对 | needle | 文本 |
| T15 | CEAM3-CEAM4.NEEDLE | 双序列比对 | needle | 文本 |
| T16 | CEAM3-CEAM5.WATER | 双序列比对 | water | 文本 |
| T17 | 9HUMAN_HB.ALN | 多序列比对 | emma | 文本 |
| T18 | 9HUMAN_HB.DND | 多序列比对 | emma | 文本 |
| T19 | 12HUMAN_CEA.EDIA | 多序列比对 | edialign | 文本 |
| T20 | 12HUMAN_CEA.ALN | 多序列比对 | edialign | 文本 |
| T21 | ECOLI_K12.COMP | 序列组分统计 | compseq | 文本 |
| T22 | MYCTO_H37.COMP | 序列组分统计 | compseq | 文本 |
| T23 | CALSU_MB4. COMP | 序列组分统计 | compseq | 文本 |
| T24 | Q1P1H9_ORYSI.PEPSTATS | 序列组分统计 | pepstats | 文本 |
| T25 | Q1P1H9_ORYSI.WORD3 | 序列组分统计 | wordcount | 文本 |
| T26 | Q1P1H9_ORYSI.WORD4 | 序列组分统计 | wordcount | 文本 |
| T27 | Q1P1H9_ORYSI.WORD5 | 序列组分统计 | wordcount | 文本 |
| T28 | Y12618.SIXPACK | 读码框分析 | sixpack | 文本 |
| T29 | Y12618_ORF.FASTA | 读码框分析 | sixpack | 文本 |
| T30 | Y12618.SHOWORF | 读码框分析 | showorf | 文本 |
| T31 | Y12618_AA.FASTA | 读码框分析 | getorf | 文本 |
| T32 | Z84721.CPGPLOT | CpG 岛识别 | cpgplot | 文本 |
| T33 | Z84721.GFF | CpG 岛识别 | cpgplot | 文本 |
| T34 | Y12618_CDS.CUSP | 密码子分析 | cusp | 文本 |
| T35 | Y12618_CDS.CHIPS | 密码子分析 | chips | 文本 |
| T36 | ATH-MIR172C.PAL | 重复序列分析 | palindrome | 文本 |
| T37 | EF565211.EINV | 重复序列分析 | einverted | 文本 |
| T38 | EF565211_EINV.FASTA | 重复序列分析 | einverted | 文本 |
| T39 | CEAM3_HUMAN.ANTI | 序列特征位点识别 | antigenic | 文本 |
| T40 | 17ARATH_SPLD.FUZ | 序列特征位点识别 | fuzzpro | 文本 |
| T41 | PPF1_PEA.TMAP | 二级结构分析 | tmap | 文本 |
| T42 | 1MBN.GARNIER | 二级结构分析 | garnier | 文本 |
| T43 | 2QSQ.GARNIER | 二级结构分析 | garnier | 文本 |
| T44 | 1UBQ.GARNIER | 二级结构分析 | garnier | 文本 |