Gene Expression Nebulas
基于标准化流程分析的转录图谱综合数据库

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多物种转录图谱整合数据库

PRJCA000233: RNA-seq of 2 maize RILs under drought stress

来源: NGDC / CRA002420
提交时间: May 14 2016
释放时间: May 14 2016
最后更新时间: -

概要: -

项目整体设计: Transcriptome analysis of 2 maize recombination inbred lines from ph4CV and F9721 under drought stress. The three-leaf seedlings of the two RILs were treated with natural drought stress without water. From the start to 5 days after drought stress, the shoot tissues of the two RILs seedlings were harvested and samples labeled CK, DT1, DT2 and DT5 were used for RNA extraction and Illumina deep sequencing.

GEN 数据集:
GEND000309
测序方法:
物种:
组织:
发育阶段:
方案
生长方案: -
处理方案: Transcriptome analysis of 2 maize recombination inbred lines from ph4CV and F9721 under drought stress. The three-leaf seedlings of the two RILs were treated with natural drought stress without water.
提取方案: -
建库方案: -
测序信息
分子类型: poly(A)+ RNA
库的片段类型: PAIRED
库的链类型: -
测序平台: ILLUMINA
测序仪型号: Illumina HiSeq 2500; Illumina Genome Analyzer II
链特异性: Unspecific
样本
基本信息:
样本描述:
生物条件:
实验变量:
方案:
测序信息:
质量评估:
数据来源 GEN样本编号 GEN数据集编号 系列编号 项目编号 样本编号 样本名称 生物样本编号 样本访问号 实验访问号 释放时间 提交时间 最后更新时间 物种 种族 族裔 年龄 年龄单位 性别 来源名称 组织 细胞类型 细胞亚型 细胞系 疾病 疾病状态 发育阶段 突变/变异 表型 Condition Detail 生长方案 处理方案 提取方案 建库方案 分子类型 库的片段类型 链特异性 库的链类型 加标(Spike-In) 测序方法 测序平台 测序仪型号 细胞数 测序片段数 碱基数 平均测序片段长度_1 平均测序片段长度_2 唯一比对率 多重比对率 覆盖度
文章
ZmbHLH124 identified in maize recombinant inbred lines contributes to drought tolerance in crops.
Plant biotechnology journal . 2021-05-25 [PMID: 34031958]