PRJCA000776: Gene expression profile of Zika virus infected HT-29 cells
概要: 1, detect the gene expresion profile of Zika virus infected human colonal epithelial cells (HT-29); 2, detect the azithromycin upregulated genes in HT-29 cells after Zika virus infection
| 测序方法: |
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| 物种: |
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| 健康状况: |
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| 细胞类型: |
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| 细胞系: |
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| 生长方案: |
- |
| 处理方案: |
- |
| 提取方案: |
- |
| 建库方案: |
RNA was used to remove ribosomal RNA with the Ribo-Zero Magnetic Gold Kit followed by a cleanup with Agencourt RNAClean XP beads and elution by RNA Fragmentation and Priming mix from the NEBNext Ultra Directional RNA Library Prep Kit for Illumina. |
| 分子类型: |
rRNA- RNA |
| 库的片段类型: |
PAIRED |
| 库的链类型: |
Forward |
| 测序平台: |
ILLUMINA |
| 测序仪型号: |
Illumina HiSeq X Ten |
| 链特异性: |
Specific |
| 数据来源 |
GEN样本编号 |
GEN数据集编号 |
系列编号 |
项目编号 |
样本编号 |
样本名称 |
生物样本编号 |
样本访问号 |
实验访问号 |
释放时间 |
提交时间 |
最后更新时间 |
物种 |
种族 |
族裔 |
年龄 |
年龄单位 |
性别 |
来源名称 |
组织 |
细胞类型 |
细胞亚型 |
细胞系 |
疾病 |
疾病状态 |
发育阶段 |
突变/变异 |
表型 |
Condition Detail |
生长方案 |
处理方案 |
提取方案 |
建库方案 |
分子类型 |
库的片段类型 |
链特异性 |
库的链类型 |
加标(Spike-In) |
测序方法 |
测序平台 |
测序仪型号 |
细胞数 |
测序片段数 |
碱基数 |
平均测序片段长度_1 |
平均测序片段长度_2 |
唯一比对率 |
多重比对率 |
覆盖度 |
Zika virus shedding in the stool and infection through the anorectal mucosa in mice.
Emerging microbes & infections . 2018-10-17 [PMID:
30333476]
Azithromycin Protects against Zika virus Infection by Upregulating virus-induced Type I and III Interferon Responses.
Antimicrobial agents and chemotherapy . 2019-09-16 [PMID:
31527024]