Gene Expression Nebulas
基于标准化流程分析的转录图谱综合数据库

Gene Expression Nebulas

多物种转录图谱整合数据库

PRJCA001122: Unbalanced Breeding-like Inter-Cross (CUBIC) offspring

来源: NGDC / CRA001241
提交时间: Nol 16 2018
释放时间: Nov 16 2018
最后更新时间: Nol 16 2018

概要: RNA-seq data of CUBIC offspring

GEN 数据集:
GEND000324
测序方法:
物种:
组织:
健康状况:
方案
生长方案: -
处理方案: -
提取方案: At the V9 stage, total RNA was extracted from the tissue of the 11th leaf, collected from the pool of three plants of similar growth status per line, following the standard protocol of Quick RNA isolation Kit, #0416-50.
建库方案: A library with insert sizes ranging from 200~500 bp was prepared using the commercial Illumina library preparation kits (TruSeq Stranded mRNA LT-SetA. RS-122-1201).
测序信息
分子类型: poly(A)+ RNA
库的片段类型: PAIRED
库的链类型: -
测序平台: ILLUMINA
测序仪型号: Illumina HiSeq X Ten
链特异性: Unspecific
样本
基本信息:
样本描述:
生物条件:
实验变量:
方案:
测序信息:
质量评估:
数据来源 GEN样本编号 GEN数据集编号 系列编号 项目编号 样本编号 样本名称 生物样本编号 样本访问号 实验访问号 释放时间 提交时间 最后更新时间 物种 种族 族裔 年龄 年龄单位 性别 来源名称 组织 细胞类型 细胞亚型 细胞系 疾病 疾病状态 发育阶段 突变/变异 表型 Condition Detail 生长方案 处理方案 提取方案 建库方案 分子类型 库的片段类型 链特异性 库的链类型 加标(Spike-In) 测序方法 测序平台 测序仪型号 细胞数 测序片段数 碱基数 平均测序片段长度_1 平均测序片段长度_2 唯一比对率 多重比对率 覆盖度
文章
CUBIC: an atlas of genetic architecture promises directed maize improvement.
Genome biology . 2020-01-24 [PMID: 31980033]