Gene Expression Nebulas
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多物种转录图谱整合数据库

PRJCA001246: Transcriptomic comparison between doule-low and double-high Brassica napus cultivars

来源: NGDC / CRA001407
提交时间: Jan 25 2019
释放时间: Feb 18 2019
最后更新时间: -

概要: Transcriptomic comparison in different organs between doule-low and double-high Brassica napus cultivars

GEN 数据集:
GEND000312
测序方法:
物种:
组织:
方案
生长方案: -
处理方案: -
提取方案: Total RNA was extract from leaves with CTAB methods, shear the cDNA to ~350bp with Bioruptor plus, sequence was generate on Illumina Hiseq 4000 sequencer
建库方案: -
测序信息
分子类型: -
库的片段类型: PAIRED
库的链类型: -
测序平台: ILLUMINA
测序仪型号: Illumina HiSeq 4000
链特异性: Unspecific
样本
基本信息:
样本描述:
生物条件:
实验变量:
方案:
测序信息:
质量评估:
数据来源 GEN样本编号 GEN数据集编号 系列编号 项目编号 样本编号 样本名称 生物样本编号 样本访问号 实验访问号 释放时间 提交时间 最后更新时间 物种 种族 族裔 年龄 年龄单位 性别 来源名称 组织 细胞类型 细胞亚型 细胞系 疾病 疾病状态 发育阶段 突变/变异 表型 Condition Detail 生长方案 处理方案 提取方案 建库方案 分子类型 库的片段类型 链特异性 库的链类型 加标(Spike-In) 测序方法 测序平台 测序仪型号 细胞数 测序片段数 碱基数 平均测序片段长度_1 平均测序片段长度_2 唯一比对率 多重比对率 覆盖度
文章
Whole-genome resequencing reveals Brassica napus origin and genetic loci involved in its improvement.
Nature communications . 2019-03-11 [PMID: 30858362]