PRJCA002591: Single cell transcriptome analysis reveals six subpopulations reflecting distinct cellular fates in senescent mouse embryonic fibroblasts
概要: We conducted single cell RNA sequencing on senescent MEFs. PCA analyses showed there were obvious heterogeneity among these MEFs and they could be divided into six subpopulations. Three lines of gene expression analyses indicated distinct expression features of these six subpopulations.
| 生长方案: |
- |
| 处理方案: |
- |
| 提取方案: |
- |
| 建库方案: |
Following the manual SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for the Fluidigm C1 System, IFCs Components |
| 分子类型: |
poly(A)+ RNA |
| 库的片段类型: |
PAIRED |
| 库的链类型: |
- |
| 测序平台: |
ILLUMINA |
| 测序仪型号: |
Illumina HiSeq 4000 |
| 链特异性: |
Unspecific |
| 数据来源 |
GEN样本编号 |
GEN数据集编号 |
系列编号 |
项目编号 |
样本编号 |
样本名称 |
生物样本编号 |
样本访问号 |
实验访问号 |
释放时间 |
提交时间 |
最后更新时间 |
物种 |
种族 |
族裔 |
年龄 |
年龄单位 |
性别 |
来源名称 |
组织 |
细胞类型 |
细胞亚型 |
细胞系 |
疾病 |
疾病状态 |
发育阶段 |
突变/变异 |
表型 |
Condition Detail |
生长方案 |
处理方案 |
提取方案 |
建库方案 |
分子类型 |
库的片段类型 |
链特异性 |
库的链类型 |
加标（Spike-In） |
测序方法 |
测序平台 |
测序仪型号 |
细胞数 |
测序片段数 |
碱基数 |
平均测序片段长度_1 |
平均测序片段长度_2 |
唯一比对率 |
多重比对率 |
覆盖度 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Six Subpopulations Reflecting Distinct Cellular Fates in Senescent Mouse Embryonic Fibroblasts.
Frontiers in genetics . 2020-08-11 [PMID:
32849838]
