PRJNA13141: International Rice Genome Sequencing Project
概要: The sequencing strategy was to organize BAC clones into contigs by FPC. These contigs were placed on a high-density genetic map. From this a minimum tiling path was chosen and the nucleotide sequence of these BACs was determined. PAC clones were used to fill in some gaps. The final sequence represents finished quality sequence that covers 95% of the 389 Mb genome.
项目整体设计: Oryza sativa japonica leaf, panicle and root RNA-Seq
| 生长方案: |
- |
| 处理方案: |
- |
| 提取方案: |
- |
| 建库方案: |
- |
| 分子类型: |
poly(A)+ RNA |
| 库的片段类型: |
PAIRED |
| 库的链类型: |
Forward |
| 测序平台: |
ILLUMINA |
| 测序仪型号: |
Illumina HiSeq 2000 |
| 链特异性: |
Specific |
| 数据来源 |
GEN样本编号 |
GEN数据集编号 |
系列编号 |
项目编号 |
样本编号 |
样本名称 |
生物样本编号 |
样本访问号 |
实验访问号 |
释放时间 |
提交时间 |
最后更新时间 |
物种 |
种族 |
族裔 |
年龄 |
年龄单位 |
性别 |
来源名称 |
组织 |
细胞类型 |
细胞亚型 |
细胞系 |
疾病 |
疾病状态 |
发育阶段 |
突变/变异 |
表型 |
Condition Detail |
生长方案 |
处理方案 |
提取方案 |
建库方案 |
分子类型 |
库的片段类型 |
链特异性 |
库的链类型 |
加标（Spike-In） |
测序方法 |
测序平台 |
测序仪型号 |
细胞数 |
测序片段数 |
碱基数 |
平均测序片段长度_1 |
平均测序片段长度_2 |
唯一比对率 |
多重比对率 |
覆盖度 |
The Rice Annotation Project Database (RAP-DB): 2008 update.
Nucleic acids research . 2007-12-17 [PMID:
18089549]
