Project - PRJNA598873 - Gene Expression Nebulas

基于标准化流程分析的转录图谱综合数据库

多物种转录图谱整合数据库

PRJNA598873: Single-cell Transcriptomes Reveal Diverse Regulatory Strategies for Olfactory Receptor Expression and Axon Targeting

提交时间: Jan 03 2020

释放时间: Jan 04 2020

最后更新时间: Mar 19 2020

概要: Using single-cell RNA-sequencing, we comprehensively characterized the transcriptomes of Drosophila olfactory receptor neurons (ORNs) from middle pupal stage antennae. These ORNs are from 3 genotypes: nSyb-GAL4 labels 44 ORN types, 85A10-GAL4 labels 5 ORN types, and AM29-GAL4 labels 2 ORN types.

项目整体设计: Single-cell RNA-seq

GEN 数据集:

GEND000068

测序方法:	scRNA Smart-seq2
物种:	Drosophila melanogaster
组织:	Olfactory Receptor Neurons
健康状况:	Normal

方案

生长方案:	-
处理方案:	-
提取方案:	Modified SMART-seq2 (Li et al. 2017)
建库方案:	-

测序信息

分子类型:	poly(A)+ RNA
库的片段类型:	PAIRED
库的链类型:	-
测序平台:	ILLUMINA
测序仪型号:	Illumina NextSeq 550
链特异性:	-

样本

生物条件:

疾病

疾病状态

发育阶段

突变/变异

表型

实验变量:

Condition Detail

方案:

生长方案

处理方案

提取方案

建库方案

分子类型

库的片段类型

链特异性

库的链类型

加标（Spike-In）

测序信息:

测序方法

测序平台

测序仪型号

质量评估:

细胞数

测序片段数

碱基数

平均测序片段长度_1

平均测序片段长度_2

唯一比对率

多重比对率

覆盖度

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文章

Single-Cell Transcriptomes Reveal Diverse Regulatory Strategies for Olfactory Receptor Expression and Axon Targeting.

Current biology : CB . 2020-02-13 [PMID: 32059767]