概要: Blood collected from recovered COVID-19 patients at 12, 16 and 24 weeks post infection was found to retain a signature of active infection which was associated with severity of disease.
项目整体设计: Total RNA sequenced from healthy controls, and from recovered COVID-19 patients at 12, 16 and 24 weeks post infection
RNA extraction and genomic DNA elimination was carried out using the PAXgene® Blood RNA kit (762164, Qiagen, Feldbachstrasse, Germany) as per the manufacturer’s instructions
建库方案:
Total RNA was converted to strand-specific Illumina compatible sequencing libraries using the Nugen Universal Plus Total RNA-Seq library kit from Tecan (Mannedorf, Switzerland) as per the manufacturer’s instructions (MO1523 v2) using 12 cycles of PCR amplification for the final libraries. An Anydeplete probe mix targeting both human ribosomal and adult globin transcripts (HBA1, HBA2, HBB, HBD) was used to deplete these transcripts.
测序信息
分子类型:
rRNA- RNA
库的片段类型:
PAIRED
库的链类型:
Reverse
测序平台:
ILLUMINA
测序仪型号:
Illumina NovaSeq 6000
链特异性:
Specific
样本
基本信息:
样本描述:
生物条件:
实验变量:
方案:
测序信息:
质量评估:
数据来源
GEN样本编号
GEN数据集编号
系列编号
项目编号
样本编号
样本名称
生物样本编号
样本访问号
实验访问号
释放时间
提交时间
最后更新时间
物种
种族
族裔
年龄
年龄单位
性别
来源名称
组织
细胞类型
细胞亚型
细胞系
疾病
疾病状态
发育阶段
突变/变异
表型
Condition Detail
生长方案
处理方案
提取方案
建库方案
分子类型
库的片段类型
链特异性
库的链类型
加标（Spike-In）
测序方法
测序平台
测序仪型号
细胞数
测序片段数
碱基数
平均测序片段长度_1
平均测序片段长度_2
唯一比对率
多重比对率
覆盖度
文章
Long-term perturbation of the peripheral immune system months after SARS-CoV-2 infection.
