Gene Expression Nebulas
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多物种转录图谱整合数据库

PRJNA736408: Microvascular Endothelial Cell RNA-Seq: Treatment with Platelet Releasate from COVID-19 & Control Donors

来源: NCBI / GSE176479
提交时间: Jun 09 2021
释放时间: Sep 09 2021
最后更新时间: Dec 10 2021

概要: Assessment of the endothelial transcriptome following exposure to platelet releasated factors from COVID-19 and controls.

项目整体设计: Human cardiac microvascular endothelial cells exposed to platelet releasate (7 controls, 7 COVID-19) originating from patients with COVID-19 or controls.

GEN 数据集:
GEND000375
测序方法:
物种:
健康状况:
细胞类型:
方案
生长方案: -
处理方案: Human cardiac microvascular endothelial cells exposed to platelet releasate originating from patients with COVID-19 or controls.
提取方案: Direct-zol RNA microspin columns
建库方案: Sequencing libraries were barcoded and prepared using the Clontech SMART-Seq HT with Nxt HT kit (Takara Bio USA) as per the manufacturer's instruction
测序信息
分子类型: polyA(+) RNA
库的片段类型: PAIRED
库的链类型: -
测序平台: ILLUMINA
测序仪型号: Illumina NovaSeq 6000
链特异性: Unspecific
样本
基本信息:
样本描述:
生物条件:
实验变量:
方案:
测序信息:
质量评估:
数据来源 GEN样本编号 GEN数据集编号 系列编号 项目编号 样本编号 样本名称 生物样本编号 样本访问号 实验访问号 释放时间 提交时间 最后更新时间 物种 种族 族裔 年龄 年龄单位 性别 来源名称 组织 细胞类型 细胞亚型 细胞系 疾病 疾病状态 发育阶段 突变/变异 表型 Condition Detail 生长方案 处理方案 提取方案 建库方案 分子类型 库的片段类型 链特异性 库的链类型 加标(Spike-In) 测序方法 测序平台 测序仪型号 细胞数 测序片段数 碱基数 平均测序片段长度_1 平均测序片段长度_2 唯一比对率 多重比对率 覆盖度
文章
Platelets amplify endotheliopathy in COVID-19.
Science advances . 2021-09-08 [PMID: 34516880]