PRJNA736408: Microvascular Endothelial Cell RNA-Seq: Treatment with Platelet Releasate from COVID-19 & Control Donors
概要 : Assessment of the endothelial transcriptome following exposure to platelet releasated factors from COVID-19 and controls.
项目整体设计 : Human cardiac microvascular endothelial cells exposed to platelet releasate (7 controls, 7 COVID-19) originating from patients with COVID-19 or controls.
测序方法:
物种:
健康状况:
Normal
SARS-CoV-2 infection
细胞类型:
生长方案:
-
处理方案:
Human cardiac microvascular endothelial cells exposed to platelet releasate originating from patients with COVID-19 or controls.
提取方案:
Direct-zol RNA microspin columns
建库方案:
Sequencing libraries were barcoded and prepared using the Clontech SMART-Seq HT with Nxt HT kit (Takara Bio USA) as per the manufacturer's instruction
分子类型:
polyA(+) RNA
库的片段类型:
PAIRED
库的链类型:
-
测序平台:
ILLUMINA
测序仪型号:
Illumina NovaSeq 6000
链特异性:
Unspecific
数据来源
GEN样本编号
GEN数据集编号
系列编号
项目编号
样本编号
样本名称
生物样本编号
样本访问号
实验访问号
释放时间
提交时间
最后更新时间
物种
种族
族裔
年龄
年龄单位
性别
来源名称
组织
细胞类型
细胞亚型
细胞系
疾病
疾病状态
发育阶段
突变/变异
表型
Condition Detail
生长方案
处理方案
提取方案
建库方案
分子类型
库的片段类型
链特异性
库的链类型
加标(Spike-In)
测序方法
测序平台
测序仪型号
细胞数
测序片段数
碱基数
平均测序片段长度_1
平均测序片段长度_2
唯一比对率
多重比对率
覆盖度
Platelets amplify endotheliopathy in COVID-19. Science advances . 2021-09-08 [PMID:
34516880 ]