Gene Expression Nebulas
基于标准化流程分析的转录图谱综合数据库

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多物种转录图谱整合数据库

PRJNA761722: Hyperglycemia in Acute COVID-19 is Characterized by Adipose Tissue Dysfunction and Insulin Resistance

来源: NCBI / GSE183714
提交时间: Sep 08 2021
释放时间: Sep 29 2021
最后更新时间: Jan 06 2022

概要: RNA sequencing was performed on Golden Syrian hamster fat tissue depots from hamsters inoculated with SARS-CoV-2 in PBS or PBS only.

项目整体设计: RNA sequencing of Mock infected or SARS-CoV-2 treated hamsters treated.

GEN 数据集:
GEND000384
测序方法:
物种:
组织:
健康状况:
方案
生长方案: Standard Golden Syrian Hamsters
处理方案: Mock infected or SARS-CoV-2 treated hamsters
提取方案: Fat tissue was harvested and lysed in TRIZOL and subjected to RNA extraction using Trizol extraction protocol
建库方案: RNA-seq libraries of polyadenylated RNA were prepared using the TruSeq RNA Library Prep Kit v2 (Illumina) or TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit (Illumina) according to the manufacturer’s instructions.
测序信息
分子类型: polyA(+) RNA
库的片段类型: SINGLE
库的链类型: Forward
测序平台: ILLUMINA
测序仪型号: Illumina NextSeq 500
链特异性: Specific
样本
基本信息:
样本描述:
生物条件:
实验变量:
方案:
测序信息:
质量评估:
数据来源 GEN样本编号 GEN数据集编号 系列编号 项目编号 样本编号 样本名称 生物样本编号 样本访问号 实验访问号 释放时间 提交时间 最后更新时间 物种 种族 族裔 年龄 年龄单位 性别 来源名称 组织 细胞类型 细胞亚型 细胞系 疾病 疾病状态 发育阶段 突变/变异 表型 Condition Detail 生长方案 处理方案 提取方案 建库方案 分子类型 库的片段类型 链特异性 库的链类型 加标(Spike-In) 测序方法 测序平台 测序仪型号 细胞数 测序片段数 碱基数 平均测序片段长度_1 平均测序片段长度_2 唯一比对率 多重比对率 覆盖度
文章
Hyperglycemia in acute COVID-19 is characterized by insulin resistance and adipose tissue infectivity by SARS-CoV-2.
Cell metabolism . 2021-12-01 [PMID: 34879241]