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CRA003228 基本信息
标题: PacBio Seuqll II single-cell RNA isoform sequencing for Corneal Limbus
项目编号: PRJCA003458 /
发布日期: 2023-03-28
文件个数: 8
文件大小: 101.28 GB
出版信息
文章标题
HIT-scISOseq: High-throughput and High-accuracy Single-cell Full-length Isoform Sequencing
杂志名称
Research Square
发表年份
2022
Doi
10.21203/rs.3.rs-114035/v1
PubMed ID

文章标题
High-throughput and high-accuracy single-cell RNA isoform analysis using PacBio circular consensus sequencing
杂志名称
Nature Communications
发表年份
2023
Doi
10.1038/s41467-023-38324-9
PubMed ID
37149708

文章标题
Analyzing cell-type-specific isoform expression using IsoDiffR and long-read single-cell RNA sequencing
杂志名称
Bioinformatics
发表年份
2025
Doi
10.1093/bioinformatics/btaf664
PubMed ID
41400872

数据下载
元数据信息:
CRA003228.xlsx
文件:
HTTPS：https://download.cncb.ac.cn/gsa2/CRA003228
推荐 Qtrans（测试）： 文件下载 
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FTP：ftp://download.big.ac.cn/gsa2/CRA003228

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Experiments和Runs信息
实验编号 实验名称 物种名称 测序平台 样本编号
CRX560832 SIRV_HumanMouse_run2_v1 Mus musculus Pacbio Sequel II SAMC1017307
Run编号 Run别名 Run序列文件信息
CRR626134 SIRV_HumanMouse_run2_v1 File: CRR626134.bam
CRX560831 SIRV_HumanMouse_run2_v2 Mus musculus Pacbio Sequel II SAMC1017306
Run编号 Run别名 Run序列文件信息
CRR626133 SIRV_HumanMouse_run2_v2 File: CRR626133.bam
CRX560830 SIRV_HumanMouse_run1 Mus musculus Pacbio Sequel II SAMC1017305
Run编号 Run别名 Run序列文件信息
CRR626132 SIRV_HumanMouse_run1 File: CRR626132.bam
CRX155876 B0h2-MHT Macaca fascicularis PacBio Sequel SAMC238962
Run编号 Run别名 Run序列文件信息
CRR183529 B0h2-MHT File: CRR183529.bam
CRX155875 B0h1-MHT Macaca fascicularis PacBio Sequel SAMC238961
Run编号 Run别名 Run序列文件信息
CRR183528 B0h1-MHT File: CRR183528.bam
CRX155872 B0h1-HT Macaca fascicularis PacBio Sequel SAMC240754
Run编号 Run别名 Run序列文件信息
CRR183525 B0h1-HT File: CRR183525.bam
CRX155871 B0h2 Macaca fascicularis PacBio Sequel SAMC240753
Run编号 Run别名 Run序列文件信息
CRR183524 B0h2 File: CRR183524.bam
CRX155870 B0h1 Macaca fascicularis PacBio Sequel SAMC240752
Run编号 Run别名 Run序列文件信息
CRR183523 B0h1 File: CRR183523.bam
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提交者:Chuanle Xiao (xiaochuanle@126.com)
所属单位:Zhongshan Ophthalmic Center,Sun Yat-sen University
提交日期:2020-09-14