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实验基本信息
实验编号 CRX1256024
物种名称 Swertia przewalskii
标题 SPS_HiC
项目编号 PRJCA032197
样本编号 SAMC4326748
测序平台 Illumina NovaSeq 6000
建库信息
文库名称 文库构建方法 建库策略 样品来源 实验选择 文库布局
We preserved cellular 3D structure using formaldehyde, followed by DNA digestion with the restriction enzyme DPN II. After repairing the DNA fragments, we captured DNA fragments containing interaction relationships using magnetic beads for library construction. Hi-C GENOMIC PCR PAIRED
处理信息 Planned read length (bp) for mate 1: 150
Planned read length (bp) for mate 2: 150
发布日期2025-11-01
测序反应
Run编号 Run序列文件信息
File nameFile size (MB)
CRR1370659 CRR1370659_r1.fq.gz
CRR1370659_r2.fq.gz
119,738.44
117,383.4
提交者Han Shuang (hanshuang@nwipb.cas.cn)
所属单位Chinese Academy of Sciences
提交日期2024-11-11
关联实验
Experiments(2)