重点研发计划科学数据汇交流程

根据《专项数据汇交管理办法》(试行)条例,项目承担单位应按时完成科学数据汇交计划撰写工作,并在正式提出结题验收申请,国家基因组科学数据中心出具汇交凭证,帮助国家科技基础性专项项目顺利验收(详见:国家基因组科学数据中心数据汇交指南)。

汇交数据范围
数据库培训视频
1.项目科学数据汇交总体流程(PPT
关键词:总体流程、资助编号添加BioProject,BioSample
2.GSA数据库(PPT
关键词:提交操作流程、非人的组学
测序数据
3.GSA-Human数据库(PPT
关键词:提交操作流程、人的组学
测序数据,申请下载
4.GWH数据库(PPT
关键词:提交操作流程、基因组组装数据
5.GVM数据库(PPT
关键词:提交操作流程、变异分析数据,
变异芯片数据
6.BioCode数据库(PPT
关键词:提交操作流程、软件工具、
算法
7.OMIX数据库(PPT
关键词:提交操作流程、多组学数据等
汇交数据类型及数据库信息
数据库简称 描述信息 接收数据格式 备注
GSA 非人类的组学原始测试下机数据的归档库 Fastq、Bam、10×Genomics等,详见File type standard
邮箱:gsa@big.ac.cn
QQ 群:548170081
帮助文档:GSA使用说明
GSA-Human使用说明
GSA-Human 人类的组学原始测试下机数据归档库
OMIX 分析后的转录组、表观组等基因组学二级数据 结果文件,如abundance measurements、raw count、txt、bed等 邮箱:gsa@big.ac.cn
QQ 群:516418530
提交入口:
https://bigd.big.ac.cn/omix
芯片数据 xls、xlsx、csv等
代谢组(包括脂质组) RAW文件:raw、wiff、scan、baf、mzXML、mzML或tar格式打包上传
Result/search文件: prideXML、mzIdentML、XML、txt或tar打包上传
蛋白组
调研性数据(临床信息、人口统计学数据、问卷等) txt或tar打包上传
其他(所有符合科技要求的研究结果类科学数据) txt或tar打包上传
GWH 基因组组装数据归档库 拼接文件格式:fasta
注释文件格式:gff、tbl
邮箱:gwh@big.ac.cn
QQ群:541196594
帮助文档:GWH使用说明
GVM 基因组序列变异数据归档库 VCF、GVCF 邮箱:gvm@big.ac.cn
QQ群:468638108
帮助文档:GVM使用说明
BioCode 软件工具和方法的数据库 源代码等 邮箱:biocode@big.ac.cn
QQ群:537473603
联系方式

邮箱:data@big.ac.cn

电话:010-84097340(工作日9:00-17:00)