Difference between revisions of "Lnc-CIDEA-2:1"

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Revision as of 13:49, 13 October 2014

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Transcriptomic Nomeclature

Please input transcriptomic nomeclature information here.

Function

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Regulation

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Expression

Please input expression information here.

Allelic Information and Variation

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Evolution

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You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this lncRNA

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Basic Information

Transcript ID

lnc-CIDEA-2:1

Source

LNCipedia2.1

Same with

NONHSAT058355

Classification

intergenic

Length

2255 nt

Genomic location

chr18+:12218590..12224800

Exon number

2

Exons

12218590..12218842,12222799..12224800

Genome context

Sequence
000001 CAATTATGAC CTCTCCTATT TCCTCAAATC TCTGATTCGT TCTTGCTTCT AATGCAGGAT ACCCTCTGAG GTCAAATCAT 000080
000081 TGGGCTTGTG GCCATGAGAC CACAGACTTT GCCTAGCTTC CAGTGACTGT CCGAGATGAC CTGTGGAGTG CACCGCCTGT 000160
000161 ACTTGGACAT CACTGTCTTT TCCGATCCAT ACCCGTCATC CTTGGAATTT CCCCTGCATC CAAACCTGTT CCTGATACAG 000240
000241 GTGTGAGTAA TGAATAACCC TAAGGAATAT CTTGGATGTC TTCACGGGGC TTATGACTTA TTCTGAGGTT TACAAAATAG 000320
000321 AGGCCCCCAG CTGAGCAAAG AGAGGGCTGC AGCGCCGAGG GAACAGCTGC CGGACTCACC GGAGAGGCCT CCTGGAGCAC 000400
000401 GCCGGGACCC CCTCCACCCC CTGGCTTTGG CTGCATCCAT GGCTAGTTTG CCTGAACTAT ATCTGAGCCA CTGAGAGTAT 000480
000481 TTATTAAGCA GAGAATAATT TTGAGTTTCA CTTTTATAAC TTTTGTTTCA AAAGTTGTTT TGGATAATTT AATGAAATGA 000560
000561 CTGTAAACCA GAATTCCCCT TTTCATTATT TCTTTGTGTC GATATAAAAA GAGTTGATGA TTTTAAAAGC CAGTGAGATG 000640
000641 TCCCTGTCTG TGGATGTCAG CGGGAGCGTG GGGTCTGAAG CCTTTCTCTG GTGGCTGTCC AGGAAGATTG CCCCAGCTTG 000720
000721 CACTCCCTTT TGGCGGGTTC CAGAGCCTTC CATTTGAAAG GAGCATCTCT CCCCACTCTG CCCCACCCAG CACCAGCTCT 000800
000801 TCTGGAACCC ACTGACTTCC TAAACACTTT CTTCCTCCTT CACCTCATTG AATTCAAGAC TTTAGAAAAC AGCCAAAAAC 000880
000881 TCTAGAGGTG GGGGTGGGTG TGATCTGGAA ATCCCTGCTG TAATCTTTTT AAGGGAATCC ACTGGAAATT ATTAATTTAT 000960
000961 GTTTTAAATA AAACCATTCC TTACTTCACA GAATATTAAG CCACTCACTT TTTAACAGAA CTTTGAGATA TAATTAAAAT 001040
001041 GCCGTAAATT TCACCCCCAC ACAGTGTACA GTTCCAAGGT TTCCAATATA GTCACAGAAG TCTCTGCAAC AATTACCACA 001120
001121 ATTTTAGACA TGAAGACCAT TTGTTGGCAG CCCTACCTGT ATCTATGTGT ATATATATAA TTTTAATATT GGATTAGATG 001200
001201 TTATAGTATT TAATATTGTA CTGTTACCTA TTTGTGTCTT TATATTGCTG TTTTTTATTC AGGTGAATAA TAATTATCTC 001280
001281 CATATAGTCA TACATTTATA TAGGGTTAAA ACATACCTTT TTACAATTCA ATAAATTAAA TTGGCCAGGC GTGGTGGCTC 001360
001361 ATGCCTGTAA TCCCAGCACT TTGGGAGGCC GAGGGGGGCG GATCACCTGA GGTTGGGGGT TCGAGACCAG CCTGACCAAC 001440
001441 ATGGAGAAAC CCTGTCTGTA CTAAAAATAC AAAAAATTAG CCGGGTGTGG TGGCTCATGC CTGTAATCCC AGCTACTTGG 001520
001521 GAGGCTGAGG CAGGAGAATC ACTAGAACCC AGGAGGCGGA CGTTGCGGTA AGCCGGGATC GCACCATTGC ACTCCAGCCT 001600
001601 GGGCAACAAG ACCAAAACTC CATCTCAAGA AAAAAAAAAA AAAAAAAAGA AAGTAAATTG TTTTTAATTA CTCACATAAG 001680
001681 AAACACATGT GTTATTGTTA TAAAAATTCA CATAGTGCTT AGGTCTACAG AATAAACGTA TCCCCGCCAC CTCCCAGCCC 001760
001761 ACCCCCTCGT CTGCATTCAC CTACACACAG TTAAACATGC ACATATGTTT CCGTGACACG ATCTTGTTTG CATATTGTTC 001840
001841 ACTGATTTGC TTTTCCATAT AAGATTTAAT TTGGTGATTA TTGCTTATCA GTACCTATAG GTCTCTCTCA TTATTATTTA 001920
001921 TAATTACATC ATTATTCCAT AGGGTATTTT ACCATAATTT GGTCACTTTT TCACTGAGGA ATTTTTATGT CAGTTTCAGT 002000
002001 TATTTGTTAT TGTTACCAAT GCTGTACTGG GCATCCCTGT ATATCCACCT TTTTGTTGCA TTAGTTAAGT GGTTTTTTCC 002080
002081 TTTTATGATT GATTTCTAAA AATAAAATAC TGCAGCAAAT GTTAATGTTT AATATTTTCA TAAAATTAAA AATCTGTGTT 002160
002161 CCAAAAAGAA ATCAATGGTT TATACTTCTA CCATCAGTGT ATGAGAATTC CTATTTCCCC ACACCCTTAA TTACACAGGA 002240
002241 AATTATCAAT GTTTG
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