Difference between revisions of "NONHSAT040996"
Line 42: | Line 42: | ||
sequence = <dnaseq>AGCGTGGGAGCATTCTCCACAATGCATTTTTTCATGCCAGAGAAAAATCTAGAAAAAAATGAATAAAACGAAGAAATTCTTTCCCCTTGGTATCTGTAGCTAACTTGCCTAAGTGTTCTTTCCCACAGTTTAAGTCTTCAGTCCATAGTTCATAAGCAAAGGGGTGTAGCGAGCTCTGATCTTGCCAGAAGAGAGAATAAGTGAGCTACCCCACGGTGGACATTCTGGCCATCTGAAATGAGTCGATGCATGTGGCTTTTGTCTAAAGGCTACAAATAAAATGTAACCACTTTCTTCTTTGAGTAGTTGATATAGCAAATAGTTGAAACAGAAGTTTTGATTGGCAAATCAGGATGTGGTAGATACTTTAACAAAGAGTAGAACTATTACCAGTTTTATGTGTTGCTGTTTGTATCTCTTTCACAGTTTTGATAATATCACATCCTGGAAAGTGAAACAGAAAATTATTATTCCATTTTAAATGACTAAATTTGCTTTCATGGTATTTACAGTGAAAGAGTAAATTAGAAAGTGAATGGATGACTGTTCATGAGAAAAAGCAGGGTAAAAAGATTTTATTTAATTAATTGAAAATATTAGGGTCAAAACATAGGCTTATGTTATGTTTTGTGAATTGTGCTGTGTTGTAGACATTTGATGAGTCCTAACATAGAATTGATCTAGCTCTTGAAATACCATTTTTGATTGAGTATAAATGGGATATAGGCACCTTACAACTTCAGAATTCGAGGAAGATGATGTGAATCTTCCAATTTTATCTATTTGATTCAAATGGTATGTTTTTTCACATTTCTCATAATTTCCACGTCAACTCCCATGATGATCATGCAGGAAAGCAGCATGATTGCACTTCTTGTAGTGCATACCATCACTAAAACATAGTTACTGTCTTTCTGTGGTCTTAAGAAAAATTCAGAAACAGCATACCAATGTACATATAAGATAAATAAGCTTATGTGGTACAGTAAGTGTTCTGTTCTGAGAAATACCTTGATTCGTATCCTAATGTCTGATGTTATTGGTAGTTCTCAAACTTCCCCAATTCTGCTTTCATCTAAATTCATCTTATCTATCTATTGTTAAATAATCTATCAGTCCATTTTTATCTATCATCTATATATCTGTCTTTATCAATCATTCGTCTGTAATCTATCTGTGCCGTTTGGCATAAGAGACAGAAGGGCATAGCAGTGGAAACTCAAAGGAGTTACCTCCATGTGAATGGACAGTGGTGATGGTGATCTGTGAGGTGGTGATGTATAGAAAGAAAAACTATAAGAGAGCATGCCCTAACTCAGGGACCTTGTCCAGCAGGCACTCTGGCCTTGTTATACTGTGCTTGAATATGAAAAAAAAAAAAATCAAAATAGTGCTGACATTCTTTGTCTTCTGGGTCTGAGAAAACTTAGAGTAGATATGATGACTCTGCCATTTCAGTCTTTTGTATTTCCACATTTAGAGCTCAGTTTTAATTATGTAGAATTATTTCTCCAGCCTGTGTTAAACTAGACCATGGATTGGCAAACTTTTTTTGTAAATTGCCAAATACACATTTTCAGTTCTGAAAGCCTTGTGGTCTTTGTTGCAGCTAATCTACTCTGCTGTTGTGTTATGAAAGCAGCCATAGGTAATTTATAATTGAATGAGTGCGCTGTGCCTTTCTTCCAATAAAACTTTACAAAAGCATCCTGTGGGCTGGAGTTTACCCTTTGGGAAACCAGAGCATTGGCTAAACTGGAACCTGAAAAAATAATCACATCAACTCAGCCACATGGTAATAATATTTAGAGTATTATTTCAACATTTTCATTTTCATAAAAATTTTTTTAGCTCTTTTGTCAAATTCCATCTGTGAGTGATACAAATGACTACCACGTGCCATTAACATCACCTAAACAGTGCAAAACAAGCATAGTAGAAGTAATTGGAATGATATAAACCCCTTGCTGTAATAGTTATAGTTGATAAATTATGTTTCAAAATTGAACCTATTTCTTCCAAATTTCATCTATAAAGTTCCAAGGAGTTCCAAAATCTTGCCTGCCTTCTTTTCCCAGTTAGCAGTATTGTCTCTGAGCAGCCATGGTGGTATCCATCCTCCTTGGACAATGAATTTAGCCTATTTTGACTTCATTTGAGCAGTTGTAATTGTTTCACCACATCAGAGTAAGATTACTACATGCCAGAGCTATTCTTTAACTCAGCTTGTAAAAACATGATAGCATCAACAATATACATAGCAAATGAATGCCATCTTTAATCCAATTAAATGGTTTTTACAAATTTGCTCTTGTTTGTTGATGCTATCTGCATTGCAGTAATTAAAGGTGAGGTAAAAAGAATGAATAAACTGCCAAGTTAAAATTAAATTTGGGCAATTTCTCTTTTGCAGTAATGTATGTATATTTACTCAAAACATATGCCAAATTTAGTGTTGAAAGGCTCATTCAAATCAATTGGGAAAGCACGTAAATGAACAATTCATAAAAGAAAAGCATTGCAAATGGCCAAGAGCATAGAAAATGTGCTCAATCTTACCAGTCATTATAAGGAAATAATGAAATTTGTGTATATATGAAATACTTAAAATATATATAAAATAAAACAATTATTTGCCTTTTTTCACCTATCAGATTAACAGATTATATGTGTTAACAAGGTGGGGAGAATTTACAACTCCTGATATGTTAAAATCTTTCAGGAAGGTAGTAGAAAATATATGTAAGATGGAAATTAGCACTTTTGACCAACAATTTTAGTTTTAGATATTTACCTATAAGGATATAATAGGAGGTGTTCAAAGATGCATGTAACTCAATGTAGTATTAATTATAATTGTAAAATAGTAAATAACATTTTTGTCAAATCATAATGTTAGGAAAATTAGTGATGGCACATTTAACCAATTGAATTATATTCAGTTCTGAATACCGTGATGCATGTTCAAATTAATTGATACAAAAATCCAACAACTTTAGCAGTTTGTTTACCAGTTATTGAGTACCAACTGTGTTCAACATTGTTATTTCACTCATATGAAATGATAAATGTATGTGCTTGTTATGATACGGTCAATAAAACCACTTTTATAGGAAGAATACTCGCAAAAAAAAAAAAAAAA</dnaseq>| | sequence = <dnaseq>AGCGTGGGAGCATTCTCCACAATGCATTTTTTCATGCCAGAGAAAAATCTAGAAAAAAATGAATAAAACGAAGAAATTCTTTCCCCTTGGTATCTGTAGCTAACTTGCCTAAGTGTTCTTTCCCACAGTTTAAGTCTTCAGTCCATAGTTCATAAGCAAAGGGGTGTAGCGAGCTCTGATCTTGCCAGAAGAGAGAATAAGTGAGCTACCCCACGGTGGACATTCTGGCCATCTGAAATGAGTCGATGCATGTGGCTTTTGTCTAAAGGCTACAAATAAAATGTAACCACTTTCTTCTTTGAGTAGTTGATATAGCAAATAGTTGAAACAGAAGTTTTGATTGGCAAATCAGGATGTGGTAGATACTTTAACAAAGAGTAGAACTATTACCAGTTTTATGTGTTGCTGTTTGTATCTCTTTCACAGTTTTGATAATATCACATCCTGGAAAGTGAAACAGAAAATTATTATTCCATTTTAAATGACTAAATTTGCTTTCATGGTATTTACAGTGAAAGAGTAAATTAGAAAGTGAATGGATGACTGTTCATGAGAAAAAGCAGGGTAAAAAGATTTTATTTAATTAATTGAAAATATTAGGGTCAAAACATAGGCTTATGTTATGTTTTGTGAATTGTGCTGTGTTGTAGACATTTGATGAGTCCTAACATAGAATTGATCTAGCTCTTGAAATACCATTTTTGATTGAGTATAAATGGGATATAGGCACCTTACAACTTCAGAATTCGAGGAAGATGATGTGAATCTTCCAATTTTATCTATTTGATTCAAATGGTATGTTTTTTCACATTTCTCATAATTTCCACGTCAACTCCCATGATGATCATGCAGGAAAGCAGCATGATTGCACTTCTTGTAGTGCATACCATCACTAAAACATAGTTACTGTCTTTCTGTGGTCTTAAGAAAAATTCAGAAACAGCATACCAATGTACATATAAGATAAATAAGCTTATGTGGTACAGTAAGTGTTCTGTTCTGAGAAATACCTTGATTCGTATCCTAATGTCTGATGTTATTGGTAGTTCTCAAACTTCCCCAATTCTGCTTTCATCTAAATTCATCTTATCTATCTATTGTTAAATAATCTATCAGTCCATTTTTATCTATCATCTATATATCTGTCTTTATCAATCATTCGTCTGTAATCTATCTGTGCCGTTTGGCATAAGAGACAGAAGGGCATAGCAGTGGAAACTCAAAGGAGTTACCTCCATGTGAATGGACAGTGGTGATGGTGATCTGTGAGGTGGTGATGTATAGAAAGAAAAACTATAAGAGAGCATGCCCTAACTCAGGGACCTTGTCCAGCAGGCACTCTGGCCTTGTTATACTGTGCTTGAATATGAAAAAAAAAAAAATCAAAATAGTGCTGACATTCTTTGTCTTCTGGGTCTGAGAAAACTTAGAGTAGATATGATGACTCTGCCATTTCAGTCTTTTGTATTTCCACATTTAGAGCTCAGTTTTAATTATGTAGAATTATTTCTCCAGCCTGTGTTAAACTAGACCATGGATTGGCAAACTTTTTTTGTAAATTGCCAAATACACATTTTCAGTTCTGAAAGCCTTGTGGTCTTTGTTGCAGCTAATCTACTCTGCTGTTGTGTTATGAAAGCAGCCATAGGTAATTTATAATTGAATGAGTGCGCTGTGCCTTTCTTCCAATAAAACTTTACAAAAGCATCCTGTGGGCTGGAGTTTACCCTTTGGGAAACCAGAGCATTGGCTAAACTGGAACCTGAAAAAATAATCACATCAACTCAGCCACATGGTAATAATATTTAGAGTATTATTTCAACATTTTCATTTTCATAAAAATTTTTTTAGCTCTTTTGTCAAATTCCATCTGTGAGTGATACAAATGACTACCACGTGCCATTAACATCACCTAAACAGTGCAAAACAAGCATAGTAGAAGTAATTGGAATGATATAAACCCCTTGCTGTAATAGTTATAGTTGATAAATTATGTTTCAAAATTGAACCTATTTCTTCCAAATTTCATCTATAAAGTTCCAAGGAGTTCCAAAATCTTGCCTGCCTTCTTTTCCCAGTTAGCAGTATTGTCTCTGAGCAGCCATGGTGGTATCCATCCTCCTTGGACAATGAATTTAGCCTATTTTGACTTCATTTGAGCAGTTGTAATTGTTTCACCACATCAGAGTAAGATTACTACATGCCAGAGCTATTCTTTAACTCAGCTTGTAAAAACATGATAGCATCAACAATATACATAGCAAATGAATGCCATCTTTAATCCAATTAAATGGTTTTTACAAATTTGCTCTTGTTTGTTGATGCTATCTGCATTGCAGTAATTAAAGGTGAGGTAAAAAGAATGAATAAACTGCCAAGTTAAAATTAAATTTGGGCAATTTCTCTTTTGCAGTAATGTATGTATATTTACTCAAAACATATGCCAAATTTAGTGTTGAAAGGCTCATTCAAATCAATTGGGAAAGCACGTAAATGAACAATTCATAAAAGAAAAGCATTGCAAATGGCCAAGAGCATAGAAAATGTGCTCAATCTTACCAGTCATTATAAGGAAATAATGAAATTTGTGTATATATGAAATACTTAAAATATATATAAAATAAAACAATTATTTGCCTTTTTTCACCTATCAGATTAACAGATTATATGTGTTAACAAGGTGGGGAGAATTTACAACTCCTGATATGTTAAAATCTTTCAGGAAGGTAGTAGAAAATATATGTAAGATGGAAATTAGCACTTTTGACCAACAATTTTAGTTTTAGATATTTACCTATAAGGATATAATAGGAGGTGTTCAAAGATGCATGTAACTCAATGTAGTATTAATTATAATTGTAAAATAGTAAATAACATTTTTGTCAAATCATAATGTTAGGAAAATTAGTGATGGCACATTTAACCAATTGAATTATATTCAGTTCTGAATACCGTGATGCATGTTCAAATTAATTGATACAAAAATCCAACAACTTTAGCAGTTTGTTTACCAGTTATTGAGTACCAACTGTGTTCAACATTGTTATTTCACTCATATGAAATGATAAATGTATGTGCTTGTTATGATACGGTCAATAAAACCACTTTTATAGGAAGAATACTCGCAAAAAAAAAAAAAAAA</dnaseq>| | ||
}} | }} | ||
− | [[Category:Intergenic]][[Category:NONHSAG016302]] | + | [[Category:Intergenic]][[Category:NONHSAG016302]][[Category:Transcripts]] |
Revision as of 10:39, 16 October 2014
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Transcriptomic Nomeclature
Please input transcriptomic nomeclature information here.
Function
Please input function information here.
Regulation
Please input regulation information here.
Expression
Please input expression information here.
Allelic Information and Variation
Please input allelic information and variation information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this lncRNA
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Basic Information
Transcript ID |
NONHSAT040996 |
Source |
NONCODE4.0 |
Same with |
, |
Classification |
intergenic |
Length |
3142 nt |
Genomic location |
chr15+:25278511..25281637 |
Exon number |
1 |
Exons |
25278511..25281637 |
Genome context |
|
Sequence |
000001 AGCGTGGGAG CATTCTCCAC AATGCATTTT TTCATGCCAG AGAAAAATCT AGAAAAAAAT GAATAAAACG AAGAAATTCT 000080
000081 TTCCCCTTGG TATCTGTAGC TAACTTGCCT AAGTGTTCTT TCCCACAGTT TAAGTCTTCA GTCCATAGTT CATAAGCAAA 000160 000161 GGGGTGTAGC GAGCTCTGAT CTTGCCAGAA GAGAGAATAA GTGAGCTACC CCACGGTGGA CATTCTGGCC ATCTGAAATG 000240 000241 AGTCGATGCA TGTGGCTTTT GTCTAAAGGC TACAAATAAA ATGTAACCAC TTTCTTCTTT GAGTAGTTGA TATAGCAAAT 000320 000321 AGTTGAAACA GAAGTTTTGA TTGGCAAATC AGGATGTGGT AGATACTTTA ACAAAGAGTA GAACTATTAC CAGTTTTATG 000400 000401 TGTTGCTGTT TGTATCTCTT TCACAGTTTT GATAATATCA CATCCTGGAA AGTGAAACAG AAAATTATTA TTCCATTTTA 000480 000481 AATGACTAAA TTTGCTTTCA TGGTATTTAC AGTGAAAGAG TAAATTAGAA AGTGAATGGA TGACTGTTCA TGAGAAAAAG 000560 000561 CAGGGTAAAA AGATTTTATT TAATTAATTG AAAATATTAG GGTCAAAACA TAGGCTTATG TTATGTTTTG TGAATTGTGC 000640 000641 TGTGTTGTAG ACATTTGATG AGTCCTAACA TAGAATTGAT CTAGCTCTTG AAATACCATT TTTGATTGAG TATAAATGGG 000720 000721 ATATAGGCAC CTTACAACTT CAGAATTCGA GGAAGATGAT GTGAATCTTC CAATTTTATC TATTTGATTC AAATGGTATG 000800 000801 TTTTTTCACA TTTCTCATAA TTTCCACGTC AACTCCCATG ATGATCATGC AGGAAAGCAG CATGATTGCA CTTCTTGTAG 000880 000881 TGCATACCAT CACTAAAACA TAGTTACTGT CTTTCTGTGG TCTTAAGAAA AATTCAGAAA CAGCATACCA ATGTACATAT 000960 000961 AAGATAAATA AGCTTATGTG GTACAGTAAG TGTTCTGTTC TGAGAAATAC CTTGATTCGT ATCCTAATGT CTGATGTTAT 001040 001041 TGGTAGTTCT CAAACTTCCC CAATTCTGCT TTCATCTAAA TTCATCTTAT CTATCTATTG TTAAATAATC TATCAGTCCA 001120 001121 TTTTTATCTA TCATCTATAT ATCTGTCTTT ATCAATCATT CGTCTGTAAT CTATCTGTGC CGTTTGGCAT AAGAGACAGA 001200 001201 AGGGCATAGC AGTGGAAACT CAAAGGAGTT ACCTCCATGT GAATGGACAG TGGTGATGGT GATCTGTGAG GTGGTGATGT 001280 001281 ATAGAAAGAA AAACTATAAG AGAGCATGCC CTAACTCAGG GACCTTGTCC AGCAGGCACT CTGGCCTTGT TATACTGTGC 001360 001361 TTGAATATGA AAAAAAAAAA AATCAAAATA GTGCTGACAT TCTTTGTCTT CTGGGTCTGA GAAAACTTAG AGTAGATATG 001440 001441 ATGACTCTGC CATTTCAGTC TTTTGTATTT CCACATTTAG AGCTCAGTTT TAATTATGTA GAATTATTTC TCCAGCCTGT 001520 001521 GTTAAACTAG ACCATGGATT GGCAAACTTT TTTTGTAAAT TGCCAAATAC ACATTTTCAG TTCTGAAAGC CTTGTGGTCT 001600 001601 TTGTTGCAGC TAATCTACTC TGCTGTTGTG TTATGAAAGC AGCCATAGGT AATTTATAAT TGAATGAGTG CGCTGTGCCT 001680 001681 TTCTTCCAAT AAAACTTTAC AAAAGCATCC TGTGGGCTGG AGTTTACCCT TTGGGAAACC AGAGCATTGG CTAAACTGGA 001760 001761 ACCTGAAAAA ATAATCACAT CAACTCAGCC ACATGGTAAT AATATTTAGA GTATTATTTC AACATTTTCA TTTTCATAAA 001840 001841 AATTTTTTTA GCTCTTTTGT CAAATTCCAT CTGTGAGTGA TACAAATGAC TACCACGTGC CATTAACATC ACCTAAACAG 001920 001921 TGCAAAACAA GCATAGTAGA AGTAATTGGA ATGATATAAA CCCCTTGCTG TAATAGTTAT AGTTGATAAA TTATGTTTCA 002000 002001 AAATTGAACC TATTTCTTCC AAATTTCATC TATAAAGTTC CAAGGAGTTC CAAAATCTTG CCTGCCTTCT TTTCCCAGTT 002080 002081 AGCAGTATTG TCTCTGAGCA GCCATGGTGG TATCCATCCT CCTTGGACAA TGAATTTAGC CTATTTTGAC TTCATTTGAG 002160 002161 CAGTTGTAAT TGTTTCACCA CATCAGAGTA AGATTACTAC ATGCCAGAGC TATTCTTTAA CTCAGCTTGT AAAAACATGA 002240 002241 TAGCATCAAC AATATACATA GCAAATGAAT GCCATCTTTA ATCCAATTAA ATGGTTTTTA CAAATTTGCT CTTGTTTGTT 002320 002321 GATGCTATCT GCATTGCAGT AATTAAAGGT GAGGTAAAAA GAATGAATAA ACTGCCAAGT TAAAATTAAA TTTGGGCAAT 002400 002401 TTCTCTTTTG CAGTAATGTA TGTATATTTA CTCAAAACAT ATGCCAAATT TAGTGTTGAA AGGCTCATTC AAATCAATTG 002480 002481 GGAAAGCACG TAAATGAACA ATTCATAAAA GAAAAGCATT GCAAATGGCC AAGAGCATAG AAAATGTGCT CAATCTTACC 002560 002561 AGTCATTATA AGGAAATAAT GAAATTTGTG TATATATGAA ATACTTAAAA TATATATAAA ATAAAACAAT TATTTGCCTT 002640 002641 TTTTCACCTA TCAGATTAAC AGATTATATG TGTTAACAAG GTGGGGAGAA TTTACAACTC CTGATATGTT AAAATCTTTC 002720 002721 AGGAAGGTAG TAGAAAATAT ATGTAAGATG GAAATTAGCA CTTTTGACCA ACAATTTTAG TTTTAGATAT TTACCTATAA 002800 002801 GGATATAATA GGAGGTGTTC AAAGATGCAT GTAACTCAAT GTAGTATTAA TTATAATTGT AAAATAGTAA ATAACATTTT 002880 002881 TGTCAAATCA TAATGTTAGG AAAATTAGTG ATGGCACATT TAACCAATTG AATTATATTC AGTTCTGAAT ACCGTGATGC 002960 002961 ATGTTCAAAT TAATTGATAC AAAAATCCAA CAACTTTAGC AGTTTGTTTA CCAGTTATTG AGTACCAACT GTGTTCAACA 003040 003041 TTGTTATTTC ACTCATATGA AATGATAAAT GTATGTGCTT GTTATGATAC GGTCAATAAA ACCACTTTTA TAGGAAGAAT 003120 003121 ACTCGCAAAA AAAAAAAAAA AA |