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Latest revision as of 14:49, 16 October 2014

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Annotated Information

Transcriptomic Nomeclature

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Function

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Regulation

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Expression

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Allelic Information and Variation

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Evolution

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Labs working on this lncRNA

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References

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Basic Information

Transcript ID

ENST00000413356.1

Source

Gencode19

Same with

lnc-RGS18-4:1,NONHSAT008508

Classification

intergenic

Length

2216 nt

Genomic location

chr1+:190594020..190770788

Exon number

5

Exons

190594020..190594163,190707568..190707640,190760644..190760693,190762636..190762726,190768931..190770788

Genome context

Sequence
000001 GGTGACTATA CTTCTCTCTT TCACCAGTCT TTAATTTGCA AAAAGGATTA TTAATATCAA AACCTGCAAT TACGTTTGTA 000080
000081 CCAACCTAAT ATTTAAACGA CATCACTTAA TCTGCATTTA TCAAGAAGTA CTCAGCATTT CAAGGCCTTC TCCTCGACAA 000160
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000401 AAAATATTTG CAAAACATGT GTCAGGAAAA GGTTGTGTAT CCTATATATA TAACTAATTT TTGAACTCAT TTGTAAGATA 000480
000481 ATCAACCTGA TTAAAAAGAA ATGTGCAAAA ATGTGAGCAG CATTTCACCA AATATGGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 000560
000561 GTGTGTATGT GTGTGTGATG CATAAGCATG TGGAAATATA CCCAACATTG TTAATCATTT GAGAAATACA AACTAAACCA 000640
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000801 TATTAAGTTA AAGATACACT TATAAACAGT CAGTGATTCA ACTCCCAGAT ATTTACCCAG CAGATATGAA AAATATCCAT 000880
000881 ACAAAGCTTA TATCCGCACA AAACTTACAC TCCCCATAAT GGAAAAAAAG GATCTCTGCT TTAGATCTAG TTGTTAGAGA 000960
000961 AAGTCTGTAT AAGAATGCTT TAACTTAAAG CTTGATTGGA AGGAAGAAGA AAGCCATGCC AAATCTAGGA AAAATATTAA 001040
001041 ACACTAAACA AGTAGCTGGC ACAAAAGCTC TAAGATAGTA ACAAAAGTGG CTAGAAAGAA AGCTAATATT TCTTTAGAAG 001120
001121 AATGAGCTAA TATAATTATG GCAGGCAGTG AAATTTTCAA GAAATATGGA AGCCATACCA AAGAAAATTC TAAAGCCCAG 001200
001201 TTGTAGAATT AAAAATCAAC CATCAGTATT TTCCAACAAC AGTGTAACTA AAAATATTAT AAGCAACAGA CAACAGTATT 001280
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001361 TAAAAGACAG TGATGTTAAT ATCAATACTG GCAGAAATAA CTTGACTGGT ATATAATTAA TTGTCCAATC TACCTGGGCC 001440
001441 TGGTGGCTCA CACCTGTAAT CCCAGCACTT TGGGAGGCTG AGGCAGGTAG ATTACTTGAG CCCAGGAATT CAAGACCAGT 001520
001521 CTGGGCAACA TGACTAAACC CCGTTTCTAC AAAAATTACA AAAATTAGCC TAGCTCGGCA TGGTGGTGCA TGCTTGTAGT 001600
001601 TCCAGCTACT CAGGAGATTG AGGTGGAAAA ATCAACTGAG CCCAGGAAGT TGAAGCTATA ATGAGTCATG ATTGCTCTAC 001680
001681 TGTACTTCAC CTTGAACAAC AGAGTGATAA CCTGTCTCAA AAAAAAAATT GGTCAATCTA ATGCCACATT ATATTTTGCT 001760
001761 TTATATTTGG GGTATATTTT ATTTCATAGT TTATTATTTT TCCCTTCATG AGTTCTAATA GTTTTCTCCT CGACCTAAGG 001840
001841 TTAATCCACT TTTACCATAT GCTTATCATC TAGTGCATAG AACCTCCCTG TTTGTCAAAG CACTCTAATT GTTGCTTTTT 001920
001921 ATTCATTTCA GAATGAATGT TTTCTATATG CCTGCTGCAA TGCATATCTT TTCCTGTTAC TTATTTTCCT TGAACTCATG 002000
002001 GATTAGAGTT TCTCTTCTAT ATTTTTTGTT TGCAATTTTC TTCCTTATTT GTTATAATTC ACCTTCAATT AACTTGTTTG 002080
002081 GCTAAAGTAT ATGAAAACAA AACCTTTGGA ATTCTTGCAC ATGCAAAACT GTTACTATGA TGCTCTCACA TATGTTTGTA 002160
002161 TAATGTGTAT AATTGCTTAC TATACATATT AATTAAAGAT TCAAAATTGC TTTCTA
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