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Latest revision as of 15:18, 16 October 2014

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Transcriptomic Nomeclature

Please input transcriptomic nomeclature information here.

Function

Please input function information here.

Regulation

Please input regulation information here.

Expression

Please input expression information here.

Allelic Information and Variation

Please input allelic information and variation information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this lncRNA

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Basic Information

Transcript ID

ENST00000428440.1

Source

Gencode19

Same with

lnc-FAM27D1.1-1:1,NONHSAT131479

Classification

intergenic

Length

3321 nt

Genomic location

chr9+:46826492..46833319

Exon number

3

Exons

46826492..46829386,46829671..46829756,46832980..46833319

Genome context

Sequence
000001 TTATCTTCCG TATAAGCTTT GGAAGCAGTT TAGTGACAAT GGTACTCTTG TCTTTTTCTT GATTTTAAAA GGAGTGATTT 000080
000081 CGATATTTTT AATCACAAAA CATGATAGGT GCTGTAGGTT ATTTGTTGAC TCCTTTTATC AGGTTAAGGA AATTACCCTT 000160
000161 TATTCATAGG TGGAAATATC ATGAATTATT TAATTTTTGT AAAATAATTT TATAGGCCTT TTGAGACAAT CATATAACTT 000240
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000321 GTTCATGGTT TTTATACTTT GCTAGGTATA CTTCCTAGTA TTTTGTTTAC AATATTTGTC TCTGTGTGCA TGGATGAGGT 000400
000401 ACACAATAGC AAGGTTACCC TAGTCTCAAA TGAATTGAAG AATGGCCTCT TTTTTCTCCC CTCGCAAATA ATTAGTGTAA 000480
000481 CATTGGAACT ACTTGTGACA TCATCTGGGC ATCCTGTTTT CTTTGTAGAA TTATTAATTA TCAACTCAAT TACTTTAATG 000560
000561 GTATGATTTC CATCCAGATT TTCTAATTAT TTGAGTCAAC TTTAATAAGT TAAATGTATC CAAAAATTTG TTAATCTCAC 000640
000641 TTATTTACAA ATGCATATAT TTAATTGTCT TATTACTTAA TGAAATAGAT CATAAATATA AAAGTGTGTA TGTACAGCTT 000720
000721 AAGAAGAATA TAAAATGAGC ATATGTGTCC TTCCTTCAGG TTATGAAATA GAATATTTCC AGTATCTTAG AAACTCCCAT 000800
000801 TGCCCTTCTA CAATGCCACT CACTCCTTCC ACAAGAGGTA ACCACTATCC CTAACTTCCT GTTAATCATT CCATTGCTTG 000880
000881 TCATTACAGA CTTGTATATT GTTTAGTTTT GCACATTTGA CTTTTTAAAT AAGTGAAACT ATGTATTGTT TCTTATGATC 000960
000961 AGATATGCAT ACACACAAAC ATGTATATGT ATGTATATAT ACACACATAC ACACATTATT TTTAAGAGCA GTTCAAAGTT 001040
001041 CACAGCAAAA CTGAGCAGCA GGTATAGATT TCCCATATAC TCCCTGTCCC CCACACATGC ATAGCCTCCC CCATAATAAA 001120
001121 CATCCCCCAC CAGAGTGGTG CATTTGTTAC AATTAAAGAA CCTACATGAT ACATCTTATA GTTTGCATTA AGGTTCACAC 001200
001201 TTGGGCTTGG ACAAATTTAC AATGACAAGT ATTCACTATT AAAATATCAT ACACGTACTT TCACTGCCTT AAGCATCCTC 001280
001281 TGTGCTCTGG TTATTCATCC CTCTCTTCCT CCTAACTCCT GGGAACCACT GATTTTTTTT TCTATTTCTA TAGTATTACC 001360
001361 TTTTCCAGAA GGTCATAAAG TTGGAAGTGA CATACGTAGC CTTTTTAGAT TGGCTTCTTT CATTCTGCAA TATGCATGTA 001440
001441 AGCTTCCACT GTGTCTTTTC ATGGCTTGAC AGCCATTTAT TTTATCATTG AATGGTATTC AGTTGTCTGG ATGTAATACA 001520
001521 GTTTGTTTAA TTATTCACCT ACTGAAGGTA ATCTTGTCTC CAAATTTTTG CAATTATAAA TAAAACGTCC ATAAACATCT 001600
001601 GTGTGCAGGT TTCTGTGTGG ACATAAGTTT TCAACTCCTT TGGGTATATA CCAAGAAACA AGATTGCGGG GTCGTATAAT 001680
001681 AAGAGTGGAT TTAGTTTTCT AAGATGCCAC AAAACTATTC TCCATTTTGT ATTTCCATCA GCACTGAATG AGAGTTCCTG 001760
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001841 ATTGCAGTGC TGTGTTTGAG AATGTGAGTA GCTGCAGTTC ATTCACTCTT AGTGCTGCGA GGTACTCTAT TATTGGAATA 001920
001921 TATGAT