Difference between revisions of "NONHSAT101028"

Latest revision as of 01:17, 17 October 2014

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Labs working on this lncRNA

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References

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Basic Information

Transcript ID	NONHSAT101028
Source	NONCODE4.0
Same with	,
Classification	sense
Length	3317 nt
Genomic location	chr5-:36192987..36218359
Exon number	7
Exons	36192987..36195384,36197643..36197766,36200329..36200382,36201208..36201263,36207272..36207367,36211946..36212024,36217850..36218359
Genome context
Sequence	000001 TGAACACAAT ATTATTTTAA TTTAAGAATG CTTTCCTTTT TGTATAATAT TTTTTGCTGA GCAAAGCACA AGCTATATCT 000080 000081 AGCTCAGTAT CTTGGACTTT ATGGGTTCTT GATAGAGTTT GACTTAATTT AAGTTACTTG GGAGATTTTG TACAAGCACA 000160 000161 TTAGGTGTTT CCGTTATAAT TGAAAAGAGA ATAAATATTC AAATCTGTCA TTGATAAGGA AGCTATAGGC TTTAGGTGTT 000240 000241 TCTGATATAA TTTATTCATG GAATAACTGG TAACTAGTTT TTATTAACTA TTTAATTTGG TTAAATTATT ATAATGTCTA 000320 000321 CTCTTTAATT TATTCTATTT TAACATAATT TGCCTTTTCT TCATTTTTCT AAGGTGGTTG TGGAGGCAGA GAATCAGGTT 000400 000401 ATACCTTGAA GGGACTGGCA TAAACCCTGT ACCTGTGGAC CTTCACGAGC AGCAGCTAAG CTTGAATCAG CACAATAGAG 000480 000481 CCCTTAACAT TGAAAGAGCT CATGATGAAA GGTCTGAGGC TTCAGGACCC CAACTTCTGC CAGTGAGAGC ACTAAATGAA 000560 000561 GTCTTCATTG GGGAGAGTCT GTCATCCAGG GCTTCCTACT ATGAGATTTC AGTTGATGAT GGTCCATGGG AAAAACAGAA 000640 000641 GAGTTCAGGG CTCAATTTGT GTACTGGAAC AGGATCAAAG GCCTGGTCAT TCAATATTAA CAGGGTTGCA ACTCAGGCTG 000720 000721 TAGAAGATGT TTTAAATATT GCAAAACGAC AAGGAAATTT GAGTCTTCCA TTGAACAGAG AATTGGTAGA GAAAGTAACA 000800 000801 AATGAATATA ATGAATCACT GCTCTACAGT CCGGAAGAAC CAAAAATACT TTTCAGTATT CGAGAACCAA TAGCAAATAG 000880 000881 AGTTTTCTCA AGCAGTCGTC AGCGTTGTTT CTCCTCAAAG GTTTGTGTTC GTTCTCGTTG TTGGGATGCC TGTATGGTTG 000960 000961 TGGATGGAGG AACTTCTTTT GAGTTTAATG ATGGTGCAAT TGCTTCGATG ATGATCAATA AAGAAGATGA GCTTCGAACT 001040 001041 GTGCTTCTTG AACAGTGAAG GATTTCCTCA TGACAAATTT TGATTACTGG CGAGAATATT TTTACTTCAG AAACAGACTA 001120 001121 CCAGTCGTAA AGTGACATTT TTTGGTTATT GTTGAGACTG CTTGCCCGTG GGCTCAGAAG TGAGATTTGC ATTATTCTTC 001200 001201 TGTTGGATTC TGATAGAAAA AAAGACATTC ACTGTATAAG AAAATGGATG GACTGAACCA ATTAGAATTG ATACCAGTGA 001280 001281 AATTTTTATA TTGCTTACAA TTGGTAACCA AGAGTGCTGA TACCTTTTTA AATTTAGAGG GGCAGGCTTA AATAAAGGAC 001360 001361 TAAATATTTA GGATTTGAAA CTTAACTGTA TAAGTGTGTT TTCCTTCCCT TTCCTCCTAA TTGTGGGATT GTCAGAACTG 001440 001441 AACACATATC ATTTGATTAG TGCATATTTT TTATAGTACC TGAAAACCAA GATTTTGAAA AAATTTTCAA GACAGAGAAT 001520 001521 TTTGATAAAT CCTGACATTG ACCTAATTGA CATAGGTAAA TATGTTTGTA TATGTGCTAA TAATTTTCTA ATTTCGGAAC 001600 001601 ACGATGATGT TATGACTATT Gatttaaaaa tttcaaataa taatttttga aattataGAT GAATGCTTTC ATTTGAGTTT 001680 001681 CATTCTGTAA TTCAGCAGTT CTGGGTGAAA TACAGATAGC AAAACAAATC ATGATGCTGT TACAAATGTA TTAGTTATCC 001760 001761 AATAAGTGTT TTAAGTCAAT TTTTTTAAAA TGATATGAGT CTTACAGGTT TCTTCCATCT TTAAAATGCT CAAACATGGA 001840 001841 TTCAGGGACT AAAAGGATGA ACTGATTAGA CATTTTCTAT TAGGAGTTTG GTAAAATATT GTAAAAATAT CTTCACCTGT 001920 001921 GTTAGGAGTA TTATCAGA

@@ Line 42: / Line 42: @@
 sequence = <dnaseq>TGAACACAATATTATTTTAATTTAAGAATGCTTTCCTTTTTGTATAATATTTTTTGCTGAGCAAAGCACAAGCTATATCTAGCTCAGTATCTTGGACTTTATGGGTTCTTGATAGAGTTTGACTTAATTTAAGTTACTTGGGAGATTTTGTACAAGCACATTAGGTGTTTCCGTTATAATTGAAAAGAGAATAAATATTCAAATCTGTCATTGATAAGGAAGCTATAGGCTTTAGGTGTTTCTGATATAATTTATTCATGGAATAACTGGTAACTAGTTTTTATTAACTATTTAATTTGGTTAAATTATTATAATGTCTACTCTTTAATTTATTCTATTTTAACATAATTTGCCTTTTCTTCATTTTTCTAAGGTGGTTGTGGAGGCAGAGAATCAGGTTATACCTTGAAGGGACTGGCATAAACCCTGTACCTGTGGACCTTCACGAGCAGCAGCTAAGCTTGAATCAGCACAATAGAGCCCTTAACATTGAAAGAGCTCATGATGAAAGGTCTGAGGCTTCAGGACCCCAACTTCTGCCAGTGAGAGCACTAAATGAAGTCTTCATTGGGGAGAGTCTGTCATCCAGGGCTTCCTACTATGAGATTTCAGTTGATGATGGTCCATGGGAAAAACAGAAGAGTTCAGGGCTCAATTTGTGTACTGGAACAGGATCAAAGGCCTGGTCATTCAATATTAACAGGGTTGCAACTCAGGCTGTAGAAGATGTTTTAAATATTGCAAAACGACAAGGAAATTTGAGTCTTCCATTGAACAGAGAATTGGTAGAGAAAGTAACAAATGAATATAATGAATCACTGCTCTACAGTCCGGAAGAACCAAAAATACTTTTCAGTATTCGAGAACCAATAGCAAATAGAGTTTTCTCAAGCAGTCGTCAGCGTTGTTTCTCCTCAAAGGTTTGTGTTCGTTCTCGTTGTTGGGATGCCTGTATGGTTGTGGATGGAGGAACTTCTTTTGAGTTTAATGATGGTGCAATTGCTTCGATGATGATCAATAAAGAAGATGAGCTTCGAACTGTGCTTCTTGAACAGTGAAGGATTTCCTCATGACAAATTTTGATTACTGGCGAGAATATTTTTACTTCAGAAACAGACTACCAGTCGTAAAGTGACATTTTTTGGTTATTGTTGAGACTGCTTGCCCGTGGGCTCAGAAGTGAGATTTGCATTATTCTTCTGTTGGATTCTGATAGAAAAAAAGACATTCACTGTATAAGAAAATGGATGGACTGAACCAATTAGAATTGATACCAGTGAAATTTTTATATTGCTTACAATTGGTAACCAAGAGTGCTGATACCTTTTTAAATTTAGAGGGGCAGGCTTAAATAAAGGACTAAATATTTAGGATTTGAAACTTAACTGTATAAGTGTGTTTTCCTTCCCTTTCCTCCTAATTGTGGGATTGTCAGAACTGAACACATATCATTTGATTAGTGCATATTTTTTATAGTACCTGAAAACCAAGATTTTGAAAAAATTTTCAAGACAGAGAATTTTGATAAATCCTGACATTGACCTAATTGACATAGGTAAATATGTTTGTATATGTGCTAATAATTTTCTAATTTCGGAACACGATGATGTTATGACTATTGatttaaaaatttcaaataataatttttgaaattataGATGAATGCTTTCATTTGAGTTTCATTCTGTAATTCAGCAGTTCTGGGTGAAATACAGATAGCAAAACAAATCATGATGCTGTTACAAATGTATTAGTTATCCAATAAGTGTTTTAAGTCAATTTTTTTAAAATGATATGAGTCTTACAGGTTTCTTCCATCTTTAAAATGCTCAAACATGGATTCAGGGACTAAAAGGATGAACTGATTAGACATTTTCTATTAGGAGTTTGGTAAAATATTGTAAAAATATCTTCACCTGTGTTAGGAGTATTATCAGAAAGAATGGATTCTTTAATAAATATGTAAAACACAGTAGTTTTGGAATTGCCTTCCTTAGTATTGTGGTTTTCACCTAGCTTATATTCCAAGATTTACAGAATAGCTTTTAGGATAAGATGTTAGGACTTTTTTTTTTTCCCCATGAGAATTCCTTTATTTTTGGAGGAAATTATTATCTAATTATTGATCTACTTATAAGTAATCCTAGAATTTTTGCCAAAAGATCCTGTCGTTGCATAATCAAACAGTTGGTATTCTCGTGCCGTTGTTCAAAGTCATGTGTTTCTTTCATTTGGTGCTGAAAATTTCTGttcaatcattgacaaatatttattgaacacccactctgtgccatgtaaaactatgtcaggtgctggatatgttgatgaatgaaacagactctatccttatacaatttgagtcttgtgggCTCAGAAGTAAATTCTGTGAAAGCTGGACGGATAGTCGAATTGAGTGCTCTTAGTTTTGCCAATATTTAACATGTTGTTCTTATCAATTTTTTAAAATAAATGTTAATGTACAAAGTTAATCTAGGTTTTGATGTATATCCAGAGAATCAATTTTTCTTAAAGTATCTGCGTAGACATTCATAGCAAAGAATTTATGACATATCAGATAGAAATACATTAAAATGTAGTGTTTTCCCAGAGATTGATCTGGCTTTTTTTTTTTGATATACATAAGATACCACTTTATAAAGAAGCTCCATACTATAGAACCTCCCCTAACAGGCTTAAAATACCttctttttttttttttttttttttgagaacggagtcttgctttgtcacccaggctggactgcagtggcatgatctcggctctgcaacctccatctcccaggttcaagcgattctcctgcctcagcctcccaagtagctgggattacaggcaggcaccactatgcctggctaattttttgtatttttagtagatatggggattcaccatgttggtcaggctggtctcgaactcctgaccttgtgatctgcctgcctcggcctcccagtattgggattacaggcatgagccaccatgcccggccTTAAAATGCCTTCTTAAAGGAAAAATGCCAACTCCATCCTTAATCTCAAGGAAATCTGATTGTCCAAATAGATCTGTTAATATGTAACATATTAATAGGTAACTTGCTGTGTAAAATTATAAGCCATATTTTAAAAGGTTTTAAAAATACTTATTGTGCTCCATTTGTGATATAATTTCTAACATTTCTGCTCTGTGATGGGGGTTTATTTGTAAGAATAAGAGGCAAAGGAATGTTAGCATAGCAAAAATGTGTTTGAATGAGTTAACCTTTTAATCGCAACCCTATGTGAATAAAATTACTCCACTGTTA</dnaseq>|
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