Difference between revisions of "DAOA-AS1"

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Latest revision as of 11:57, 23 June 2016

Annotated Information

Approved Symbol

DAOA-AS1

Approved Name

DAOA antisense RNA 1

Previous Symbols

DAOAAS, DAOA-AS

Synonyms

G30

Chromosome

13q33.2

RefSeq ID

NR_040247

OMIM ID

607415

Ensembl ID

ENSG00000232307

pubmed IDs

12364586, 12647258

Sequence

>gi|339276056|ref|NR_040247.1| Homo sapiens DAOA antisense RNA 1 (DAOA-AS1), long non-coding RNA

000001 TCAACCACTC ATAGACTGCT TTTGTTCAAA CTGCGTTCAA ATAAGGCAAA CGCCGAGCTG GAACCAATCT CACTGTTTCT 000080
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000161 ACCATCTCAG AATTTTACTC TGTTACTGCA AAATCTCATG CAAAGATAAC CAAGTACGAA GAATTAACTG AAATTCATCC 000240
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000401 AGTTGGCCAG GTCTTGTGAA AGGTAACCTC ATCACCGGAG TCAAGTGTCA TCACCTTTCC CATGTTCCAT TGGTTAGAAG 000480
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000801 GCAGCACAGT AATTTGGCTG AAATGTTGAT GAGTTCAGAC AAGAAGAAGG TGATGATGAC AAGAGAGCGT CACGGGGAAA 000880
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001121 TAAAGTCAGT ATAAAGACCT GTGTCTCTCC ATGTTTTGCT GCTTATAATT GCAGAGGAAC ATTTTGAGAT AGAAAATTTT 001200
001201 ATCCCTCTTT CAAGTGACTT TTTATAAAAC ATAACCTTTT AAGAGAGGTC ATTCTTTTGA AAAATTGTCT GAATACAAAA 001280
001281 AAGTAACTGA ACAGCAAGGG ATTGTAGCCA TAATGTTCTT GACCACTTTA GATTGACAAA TAGTATCTCA AAATTGATCA 001360
001361 GGTTCTGGAG AATCTATTGA GGTTGTATGG AGTAACCAAG TGATGGAAGA GGTTGGAAGT GAATAATTTT ATGTGGTATT 001440
001441 ATGTGATTTT TTTTGGTGGG GGTAGTGTCT GGAGCTGAGC ATGATGGAGC CTAGATGGGG CAGCCTTCTA ATGCTCCCAG 001520
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001601 CTAATTAGAG CATTGATCAT TTCTCTCCCC TTCATGAATG CACATGAGTG CACATTTTCA TATATAAGGG CAAAGGACAT 001680
001681 TTCAAAGTTT GGATGGAATC TTTCCTACTT AGAAGTAATA AAAAACAATA CTTTGAAATC TTACCAAATG TTAAACAAAT 001760
001761 AGCAACAATT TTTCCATTTG AAGATGTGTG TCTTAAGGTC TGTTGGATCT TTCAAATTTC TATTTTGGAC ATGGAAACTA 001840
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002401 TCATCGTTTT TCTGATTTTT AAATAAGTTT CAGAATTAAT ACATTTAACT GAATAAATCA ACCAATAATG TCAAACTTAA 002480
002481 AA

Predicted Small Protein

Name DAOA-AS1_smProtein_461:655
Length 64
Molecular weight 7019.186
Aromaticity 0.078125
Instability index 79.1265625
Isoelectric point 9.16314697266
Runs 10
Runs residual 0.00765625
Runs probability 0.0471383147855
Amino acid sequence MFHWLEVPAPAHIQGNIHPGSSVLPCKCHIALRPPCCKKPQATYLKSWRESAPISFSSIL
GPPS
Secondary structure LEEEEELLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLEELLLLLLLLLLLLEEHHHHHHLLLLLHHHHL
LLLL
PRMN -
PiMo -