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Allelic Information and Variation
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Evolution
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Labs working on this lncRNA
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References
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Basic Information
Transcript ID |
NONHSAT029869 |
Source |
NONCODE4.0 |
Same with |
, |
Classification |
sense |
Length |
9679 nt |
Genomic location |
chr12-:92367962..92520747 |
Exon number |
22 |
Exons |
92367962..92368020,92378864..92380473,92381332..92381570,92381735..92382218,92382873..92383092,92384060..92384167,92387126..92387305,92429055..92429454,92438171..92438324,92442504..92442876,92443916..92444334,92477291..92478026,92488997..92489489,92492577..92493216,92493314..92493852,92504400..92504586,92508174..92508207,92508228..92508302,92508328..92509168,92517809..92518568,92519478..92520424,92520580..92520747 |
Genome context |
|
Sequence |
000001 TAGAGCACTC ATGATCAGAC AAATTCTTTT TCCTAACATA AATTTAGGAA GTTGAGTATG AAGAAGAATA AATGGGTCTA 000080
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Predicted Small Protein
Name | NONHSAT029869_smProtein_8006:8257 |
Length | 84 |
Molecular weight | 9396.7606 |
Aromaticity | 0.0481927710843 |
Instability index | 44.9951807229 |
Isoelectric point | 7.68377685547 |
Runs | 13 |
Runs residual | 0.0165997322624 |
Runs probability | 0.0372861549332 |
Amino acid sequence | MSISMPNSKETQGESELSLDKLEIVMTSRKPQERETKTTLACCSLQWWDPCGITVLGMKV STLSRNENASLAVVKYWMEAKRN |
Secondary structure | LLELLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEEEELLLLLLLLLLEEEEEELLEEELLLLEEEEEEEE EEELLLLHHHHHHHHHHHHHHLL |
PRMN | - |
PiMo | - |