Difference between revisions of "Lnc-AFM-1:4"

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Revision as of 11:37, 13 October 2014

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Annotated Information

Transcriptomic Nomeclature

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Function

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Regulation

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Expression

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Allelic Information and Variation

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Evolution

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Labs working on this lncRNA

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References

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Basic Information

Transcript ID

lnc-AFM-1:4

Source

LNCipedia2.1

Same with

NONHSAT096862

Classification

intergenic

Length

2227 nt

Genomic location

chr4+:74396768..74399812

Exon number

2

Exons

74396768..74398790,74399609..74399812

Genome context

Sequence
000001 TTCCCTTCTG TTGAACCATT TTATTTATTT CCAAAATTTT GCAACCCTAA CAAAACATGC CTGTACTTCT TTTTCCATAA 000080
000081 TTATGTTTTT ATTTATTTAG AAACATTTCT TGGTAAGAGA GTTGGCAGTA ATCCTAAGTT AAAGATATGA ATATTTGAGG 000160
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000401 AAAGAAAGAT TTTATAAAAC ACACCATGCT ATACTTCTGC ATTTTGGCCT CTTTTAAACA ACTCAGTAGA AGACTTTTTA 000480
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000801 GATTTGTAGA CTTTGTTGCT GTTGTTAATC ACCCCTTTTG ATTAAACCTG TTTGAAAAAT CATTTATCTC TCATTTTACA 000880
000881 AAGTCTGTTA ATGGAAACCT GGCTCCTTTC TCTCCACTTA TGTTACTTGC CTGTTCTAAT AGGGCACATA GTGCCGTAGA 000960
000961 TGTAGATGAA AAGGCATAAT CCTCAACTGC CCTTGTCATC TCCTACTTCA ACTTATTCCA TCCATTCAAA TCCTTTAGTC 001040
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001121 GAAAAGGTAT TTTTTTCTCT TGGAAGCTAG GAACAATTTT GCTCCAACAT CACGTGAAAC TGAAAAAGTG GGGCTGGGGG 001200
001201 TGGAAGAGAT TGTTGCCCAG TGTGCTTCTT CCCTGGCCCA GACTGTGTTT CTATACAAGT GGACCTCTGA GGACATACAT 001280
001281 TTACCTAACA TCACTTTCTC CAACTTAGGA CAACACTGGG CTTCCTGGAA GCTCAGTTCT CCTTACAGGG CAGGCCCAGA 001360
001361 CTCCCTATTT CCAGAGAAAT TTCAGGGATG TTGCTCAATT GTCAACAGAA GCAAGGGAAA CCCAAGCATC TTATACTTTT 001440
001441 TGTCTTTATG ATAATAGATT TAGCTAGGAA AGTGAGGATG GATAAATTTT GAAGGCTGGT CAACCTTATA TTTCATTGCT 001520
001521 TATCTAAGCA ACTTCTTTTG TTTTTAAATT TAACTTTCAT TTTAAGTTCA GGGATACATG TGCATCTAGT TACTTAATTG 001600
001601 CTGCACACAC TCAGCCTTAT CAGCCTTAAC CTGATGCCAT AATGTAGCTT CAACGTATCA CTCTTAGATT TAGATCTTCA 001680
001681 TCCAATTCTT CTTTCCTGAA CCCTTAGTTT ATATCCATGA CTGCTTAGAG ATGTGTAGAT GCTACACGGA AGTCTTAAAT 001760
001761 ATCCTTGAGC TCTATATTCA CACAGCAAAC TATTTGGATT TGCTTTTTAG CCACGCTCCT CAAACCTGTT CTTTTTTCCT 001840
001841 GAATATCAAT TTTAATAAAT TGTGCTACCA TCAACCCAGT CTCCTATATT ATTCTAGATT ATTTTTCTTC ACTCTACTTT 001920
001921 GTTTCTAAAC TAATTGTTGT TTATTAAAAT TATCAGTTCT ACCTTTCAGA AGTGCTTAAG TCTATCTGGA CATTGATTTG 002000
002001 GTTCAAACCT CACCATTTTA AAGAGCCAGC TTATAAACTA CCCCTGCTCT AAACAGGCTA TCCTATCCAG CAAGGTCACT 002080
002081 CAATCCTGTG AACAGCCAGT GCCATTCCAA GGGGAAGGCA TATTAACTCA GAAAATGCTG ACACACCTGA CCTTTCATCC 002160
002161 CTGCCACTCA GCAGTTCTAC AGAAGACCAA TTTGTATGCA AACAATTCAC TTACAAGCCA GAATTCC
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