Difference between revisions of "NONHSAT132534"

From LncRNAWiki
Jump to: navigation, search
(Created page with "Please input one-sentence summary here. ==Annotated Information== ===Transcriptomic Nomeclature=== Please input transcriptomic nomeclature information here. ===Functio...")
 
Line 42: Line 42:
 
sequence = <dnaseq>GGTCATTCCAGATGCCTGCAGGTGATCAGATATCTAAGTAACCCTCTTGCCACCAAATACCACACACACTTCAGTTACTCTTTCAAAAAAAATTATCAAGCAACTGCTCTGTGCCAGAGACTCTTCTAGTCCTGAAGATACAGTGATAAATAAGATAGAGACAGTTCCTGCTGCCATTCAGCTTGGTTCTAGTGAGAAAGACAGATATATTAAAAAATAACTTGACATTACATTTTCAAGAATTTAAGTACTTTATTGGAAAATATAACTGTGTAAGAAGACAGATATTGACAAGGACACTTAGTTCTTGTAGCGAGGAAGTATAGACTTAACTCTTATTATTAAAAGAGTGTTTAAGAATAAAAATATATCAATACCCCTAACTTTGGAGACAAACTGAAGTACTGAATGTACTTCTATTTTTGATTTTTCCCTTAGCATGGTGAGTTGTTTGGGAAATGATTCAATAGTTATTTGTAGTTTCTAAATTCTCAGCAGCAGTTGCCTCCTGATATGTGTCACTATATATTCTGAGTTGACATCTGTTATCTGAATCACCAAAATAGTGCCTTGTTTTAAAATTTATCCACTATTGGCTTATGTTTTATCTTACTCTAGGCCATGTTATCACTACATGTGACATCTCTGTATATGTGTTTGTGAAACTGGGATAAAGTTGGCAAAACTTGAGATAGAGGAAACTATCTATGAAACATGTTTTGCATTAGTAGAACAGGAGGCATAAGCACATTTGGAATAGAAAGAACAGAGAAGGCGATACTGGAGAAATAGGATCTCACAAAGGAAAGTAGAATGCACGTAGAGAACTTAAATGCAATTTAGGCAATAACCTATGCAATTTGGACAACTATAGACCTACTATGGCTTATGGTTTCTACCAACTAGACTTAAGCTTCTTTTGGAATAAAGCCTTTGCTTCATGGAGGAAGTCAGTTAATGTTTGTTGATTGTGATTTTGATGATGACATTCATGATGATATTCTATTTGGGGAATGTTTTTCAAAGTGGGGCTTTGACCTGACAAACTGTTATACCGATAGAAAAATCAACATTCTCTCACTGACACCTTAGGTATTTGACAGATATCTGAAAGAAAAATAATTTGATATGACCAAGCAATAGTGAAGTGTAGGATATTGATCTCCAGAGATTTGTGAGACTAAAAATTGTGCAAACGAATAAAAAAAAAATCATAGTCTAGATTATCCCAATGTTGAACAATATACTTATGTTTACACATAATGTTGGAAAAGGCATCAGTGCAATTTCTACAATGCACTGATGATAATGATAATGAAATTTTAGTGACAATGTGATAATGAAATTTTAGAAGAAATTATAATTAGTTTTTCATCTCTCTTAAATGGATGTGTTGTTTTTTCTGTCCTCTTCCTTCTCCATTTATGCCTGTTCTGGTTCCTTGTTGACTTGGGGAAATATACATGTGGGTAATAAGGGTGAACATTTCCGCAGAAACAAAGCAGGTCTACTGTGCTTCAGCAGGCTTAACTCTCATTTGTTCAATGAGGGTTTGGAAAGATGGGGGGGTTTCCTACGTATAGTCAATGCATACTTAAGAACACCTACTATGTGCTGGCTTCATTTTAGTCTCTAGGAACTGGGAGACATATTGAGCCATCTGTATCTACATATATTAAAATTGTTGTACCGAAGAGTATTTCAAGGTCTTCTATCTGTTTTCTTTTGGATAGAAGCAGTCAGTGCAAACCAGCATGGTGAATGAGCTTGATTGTATTTAAGAGAAAAAATTCTCACTTTTGGGGTTTTTGCTACCAATTTTAAGAATGGGGAGCTGTTTTCAGAACTAAAAGTTTGCCAGCGCACTAAGATGTAAAATGAAGAAAAATTAAAAAATAGCTCTATGGTTTCAAAGAATGTGGAGCTACTTTGGCTTCATCGGCAGAGTAAGTCTGTTAATAACCCCGAAGCTCTCCCCTTGTTGAAATAACACAAATTAGCGTTTAACCTGGGAGGAAGACACGTGAAGTTATTTAACATTTACATAAAATTATGGAGTAAACTCCAAACAGGTCGCCTCCAAAATGTATAATTACACTCAGCAGTCCTGTCAGCATACATAGAAACAATTTTATTTCCAATCATCTTCTGCTTTTATTCACTCAGGAATGTATCATTAGAATTTCCACAGAACAATGAACCTTAATAGGCGCTAATGCAATTGTGAATTATGGTAATTGTTACCTAAATTAATCTCTGTACTTTCCATTCCTTATTGCCCTGTGCATAAGGAGTGTGAAAAAGATAATGTTGAAACTGACATTTGTATAAATGGTATAAAAATTTATCTTATTTAATAAAAATTTAATATAAGAACTTGCTACTTTGTAAAGTAGTTTACTTAGAAAAAAATGTTAGATTTGTTGCAAGTTGGGTTTATAAAATCTTTAATTTGTGAAATTTGGGAGGGAAACTGGCAGTTGACTCATTATGGTTATCTTTGGGGTATGTGTATGCACCGAGGTATCGGGATGGTACATGTATGTTCCTCCGTGCACATATTGCCAGGGCAGTGTATGCATTCGTACCCTTATCTGTGTGCCTGGCCTCTTTCTGTGTGTTTATGTTTACTCATTTACGTAAACTACCCTCTTGGTGTAATAAAATCCACCATTATGTGTTGAATTGTGTTCCTCTCAAATTCATATGCTGAAGTCTCCTAGTTCTTCAGAATGTGACCATATTTGAAGATAGGACCTTTAAAGAGGTGATTAAGTTAAAATTAGGCCGTATGTTTGGGCTCTAATCCAGTGTGACTGGTGTCCATCTAAGAAGAAATTAGGACAGAGACATAGAGGGAAGACCATTGGAAGACACAGGGATAAGATGGCTGTCTACAAGCCAAGGAGAGAGGCTCCTGAAGAAACCGGCCCTGCCAATACCATCTTGTCAGATATATGGCCTCCAGAACTGTGGGAAAATAAATTTCTGTTGTTTAAGCCACAAAAAAAAAAAAAAA</dnaseq>|
 
sequence = <dnaseq>GGTCATTCCAGATGCCTGCAGGTGATCAGATATCTAAGTAACCCTCTTGCCACCAAATACCACACACACTTCAGTTACTCTTTCAAAAAAAATTATCAAGCAACTGCTCTGTGCCAGAGACTCTTCTAGTCCTGAAGATACAGTGATAAATAAGATAGAGACAGTTCCTGCTGCCATTCAGCTTGGTTCTAGTGAGAAAGACAGATATATTAAAAAATAACTTGACATTACATTTTCAAGAATTTAAGTACTTTATTGGAAAATATAACTGTGTAAGAAGACAGATATTGACAAGGACACTTAGTTCTTGTAGCGAGGAAGTATAGACTTAACTCTTATTATTAAAAGAGTGTTTAAGAATAAAAATATATCAATACCCCTAACTTTGGAGACAAACTGAAGTACTGAATGTACTTCTATTTTTGATTTTTCCCTTAGCATGGTGAGTTGTTTGGGAAATGATTCAATAGTTATTTGTAGTTTCTAAATTCTCAGCAGCAGTTGCCTCCTGATATGTGTCACTATATATTCTGAGTTGACATCTGTTATCTGAATCACCAAAATAGTGCCTTGTTTTAAAATTTATCCACTATTGGCTTATGTTTTATCTTACTCTAGGCCATGTTATCACTACATGTGACATCTCTGTATATGTGTTTGTGAAACTGGGATAAAGTTGGCAAAACTTGAGATAGAGGAAACTATCTATGAAACATGTTTTGCATTAGTAGAACAGGAGGCATAAGCACATTTGGAATAGAAAGAACAGAGAAGGCGATACTGGAGAAATAGGATCTCACAAAGGAAAGTAGAATGCACGTAGAGAACTTAAATGCAATTTAGGCAATAACCTATGCAATTTGGACAACTATAGACCTACTATGGCTTATGGTTTCTACCAACTAGACTTAAGCTTCTTTTGGAATAAAGCCTTTGCTTCATGGAGGAAGTCAGTTAATGTTTGTTGATTGTGATTTTGATGATGACATTCATGATGATATTCTATTTGGGGAATGTTTTTCAAAGTGGGGCTTTGACCTGACAAACTGTTATACCGATAGAAAAATCAACATTCTCTCACTGACACCTTAGGTATTTGACAGATATCTGAAAGAAAAATAATTTGATATGACCAAGCAATAGTGAAGTGTAGGATATTGATCTCCAGAGATTTGTGAGACTAAAAATTGTGCAAACGAATAAAAAAAAAATCATAGTCTAGATTATCCCAATGTTGAACAATATACTTATGTTTACACATAATGTTGGAAAAGGCATCAGTGCAATTTCTACAATGCACTGATGATAATGATAATGAAATTTTAGTGACAATGTGATAATGAAATTTTAGAAGAAATTATAATTAGTTTTTCATCTCTCTTAAATGGATGTGTTGTTTTTTCTGTCCTCTTCCTTCTCCATTTATGCCTGTTCTGGTTCCTTGTTGACTTGGGGAAATATACATGTGGGTAATAAGGGTGAACATTTCCGCAGAAACAAAGCAGGTCTACTGTGCTTCAGCAGGCTTAACTCTCATTTGTTCAATGAGGGTTTGGAAAGATGGGGGGGTTTCCTACGTATAGTCAATGCATACTTAAGAACACCTACTATGTGCTGGCTTCATTTTAGTCTCTAGGAACTGGGAGACATATTGAGCCATCTGTATCTACATATATTAAAATTGTTGTACCGAAGAGTATTTCAAGGTCTTCTATCTGTTTTCTTTTGGATAGAAGCAGTCAGTGCAAACCAGCATGGTGAATGAGCTTGATTGTATTTAAGAGAAAAAATTCTCACTTTTGGGGTTTTTGCTACCAATTTTAAGAATGGGGAGCTGTTTTCAGAACTAAAAGTTTGCCAGCGCACTAAGATGTAAAATGAAGAAAAATTAAAAAATAGCTCTATGGTTTCAAAGAATGTGGAGCTACTTTGGCTTCATCGGCAGAGTAAGTCTGTTAATAACCCCGAAGCTCTCCCCTTGTTGAAATAACACAAATTAGCGTTTAACCTGGGAGGAAGACACGTGAAGTTATTTAACATTTACATAAAATTATGGAGTAAACTCCAAACAGGTCGCCTCCAAAATGTATAATTACACTCAGCAGTCCTGTCAGCATACATAGAAACAATTTTATTTCCAATCATCTTCTGCTTTTATTCACTCAGGAATGTATCATTAGAATTTCCACAGAACAATGAACCTTAATAGGCGCTAATGCAATTGTGAATTATGGTAATTGTTACCTAAATTAATCTCTGTACTTTCCATTCCTTATTGCCCTGTGCATAAGGAGTGTGAAAAAGATAATGTTGAAACTGACATTTGTATAAATGGTATAAAAATTTATCTTATTTAATAAAAATTTAATATAAGAACTTGCTACTTTGTAAAGTAGTTTACTTAGAAAAAAATGTTAGATTTGTTGCAAGTTGGGTTTATAAAATCTTTAATTTGTGAAATTTGGGAGGGAAACTGGCAGTTGACTCATTATGGTTATCTTTGGGGTATGTGTATGCACCGAGGTATCGGGATGGTACATGTATGTTCCTCCGTGCACATATTGCCAGGGCAGTGTATGCATTCGTACCCTTATCTGTGTGCCTGGCCTCTTTCTGTGTGTTTATGTTTACTCATTTACGTAAACTACCCTCTTGGTGTAATAAAATCCACCATTATGTGTTGAATTGTGTTCCTCTCAAATTCATATGCTGAAGTCTCCTAGTTCTTCAGAATGTGACCATATTTGAAGATAGGACCTTTAAAGAGGTGATTAAGTTAAAATTAGGCCGTATGTTTGGGCTCTAATCCAGTGTGACTGGTGTCCATCTAAGAAGAAATTAGGACAGAGACATAGAGGGAAGACCATTGGAAGACACAGGGATAAGATGGCTGTCTACAAGCCAAGGAGAGAGGCTCCTGAAGAAACCGGCCCTGCCAATACCATCTTGTCAGATATATGGCCTCCAGAACTGTGGGAAAATAAATTTCTGTTGTTTAAGCCACAAAAAAAAAAAAAAA</dnaseq>|
 
}}
 
}}
[[Category:Intergenic]]
+
[[Category:Intergenic]][[Category:NONHSAG052644]]

Revision as of 11:49, 13 October 2014

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Transcriptomic Nomeclature

Please input transcriptomic nomeclature information here.

Function

Please input function information here.

Regulation

Please input regulation information here.

Expression

Please input expression information here.

Allelic Information and Variation

Please input allelic information and variation information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this lncRNA

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Basic Information

Transcript ID

NONHSAT132534

Source

NONCODE4.0

Same with

,

Classification

intergenic

Length

3019 nt

Genomic location

chr9+:82503916..82506922

Exon number

1

Exons

82503916..82506922

Genome context

Sequence
000001 GGTCATTCCA GATGCCTGCA GGTGATCAGA TATCTAAGTA ACCCTCTTGC CACCAAATAC CACACACACT TCAGTTACTC 000080
000081 TTTCAAAAAA AATTATCAAG CAACTGCTCT GTGCCAGAGA CTCTTCTAGT CCTGAAGATA CAGTGATAAA TAAGATAGAG 000160
000161 ACAGTTCCTG CTGCCATTCA GCTTGGTTCT AGTGAGAAAG ACAGATATAT TAAAAAATAA CTTGACATTA CATTTTCAAG 000240
000241 AATTTAAGTA CTTTATTGGA AAATATAACT GTGTAAGAAG ACAGATATTG ACAAGGACAC TTAGTTCTTG TAGCGAGGAA 000320
000321 GTATAGACTT AACTCTTATT ATTAAAAGAG TGTTTAAGAA TAAAAATATA TCAATACCCC TAACTTTGGA GACAAACTGA 000400
000401 AGTACTGAAT GTACTTCTAT TTTTGATTTT TCCCTTAGCA TGGTGAGTTG TTTGGGAAAT GATTCAATAG TTATTTGTAG 000480
000481 TTTCTAAATT CTCAGCAGCA GTTGCCTCCT GATATGTGTC ACTATATATT CTGAGTTGAC ATCTGTTATC TGAATCACCA 000560
000561 AAATAGTGCC TTGTTTTAAA ATTTATCCAC TATTGGCTTA TGTTTTATCT TACTCTAGGC CATGTTATCA CTACATGTGA 000640
000641 CATCTCTGTA TATGTGTTTG TGAAACTGGG ATAAAGTTGG CAAAACTTGA GATAGAGGAA ACTATCTATG AAACATGTTT 000720
000721 TGCATTAGTA GAACAGGAGG CATAAGCACA TTTGGAATAG AAAGAACAGA GAAGGCGATA CTGGAGAAAT AGGATCTCAC 000800
000801 AAAGGAAAGT AGAATGCACG TAGAGAACTT AAATGCAATT TAGGCAATAA CCTATGCAAT TTGGACAACT ATAGACCTAC 000880
000881 TATGGCTTAT GGTTTCTACC AACTAGACTT AAGCTTCTTT TGGAATAAAG CCTTTGCTTC ATGGAGGAAG TCAGTTAATG 000960
000961 TTTGTTGATT GTGATTTTGA TGATGACATT CATGATGATA TTCTATTTGG GGAATGTTTT TCAAAGTGGG GCTTTGACCT 001040
001041 GACAAACTGT TATACCGATA GAAAAATCAA CATTCTCTCA CTGACACCTT AGGTATTTGA CAGATATCTG AAAGAAAAAT 001120
001121 AATTTGATAT GACCAAGCAA TAGTGAAGTG TAGGATATTG ATCTCCAGAG ATTTGTGAGA CTAAAAATTG TGCAAACGAA 001200
001201 TAAAAAAAAA ATCATAGTCT AGATTATCCC AATGTTGAAC AATATACTTA TGTTTACACA TAATGTTGGA AAAGGCATCA 001280
001281 GTGCAATTTC TACAATGCAC TGATGATAAT GATAATGAAA TTTTAGTGAC AATGTGATAA TGAAATTTTA GAAGAAATTA 001360
001361 TAATTAGTTT TTCATCTCTC TTAAATGGAT GTGTTGTTTT TTCTGTCCTC TTCCTTCTCC ATTTATGCCT GTTCTGGTTC 001440
001441 CTTGTTGACT TGGGGAAATA TACATGTGGG TAATAAGGGT GAACATTTCC GCAGAAACAA AGCAGGTCTA CTGTGCTTCA 001520
001521 GCAGGCTTAA CTCTCATTTG TTCAATGAGG GTTTGGAAAG ATGGGGGGGT TTCCTACGTA TAGTCAATGC ATACTTAAGA 001600
001601 ACACCTACTA TGTGCTGGCT TCATTTTAGT CTCTAGGAAC TGGGAGACAT ATTGAGCCAT CTGTATCTAC ATATATTAAA 001680
001681 ATTGTTGTAC CGAAGAGTAT TTCAAGGTCT TCTATCTGTT TTCTTTTGGA TAGAAGCAGT CAGTGCAAAC CAGCATGGTG 001760
001761 AATGAGCTTG ATTGTATTTA AGAGAAAAAA TTCTCACTTT TGGGGTTTTT GCTACCAATT TTAAGAATGG GGAGCTGTTT 001840
001841 TCAGAACTAA AAGTTTGCCA GCGCACTAAG ATGTAAAATG AAGAAAAATT AAAAAATAGC TCTATGGTTT CAAAGAATGT 001920
001921 GGAGCTACTT TGGCTTCATC GGCAGAGTAA GTC