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[[Category:Intergenic]]
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Revision as of 12:46, 13 October 2014

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Annotated Information

Transcriptomic Nomeclature

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Function

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Regulation

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Expression

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Allelic Information and Variation

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Evolution

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Labs working on this lncRNA

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References

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Basic Information

Transcript ID

NONHSAT093248

Source

NONCODE4.0

Same with

,

Classification

intergenic

Length

8066 nt

Genomic location

chr3+:172135391..172143456

Exon number

1

Exons

172135391..172143456

Genome context

Sequence
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008001 TGAAAAGACT AATGCAACAT TAGATTCAAA TCTATATCTC CTGTAGCTAC TTAAAACATG GTTTTA
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Predicted Small Protein

Name NONHSAT093248_smProtein_1376:1594
Length 73
Molecular weight 8112.4266
Aromaticity 0.166666666667
Instability index 40.88625
Isoelectric point 7.74053955078
Runs 10
Runs residual 0.00202757502028
Runs probability 0.0393040098923
Amino acid sequence MLNNTGKSGHPCCVPDIRGKAFSSSPFSMILAVDLSYMAFIMLRYIPSIPSFFEGFYHEG
MSNFIKCFFSIN
Secondary structure LLLLLLLLLLLLLLLLLLLLEELLLLLEEEEEELHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLL
HHHEEEEEEEEL
PRMN LLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLL
LLLLLLLLLLLL
PiMo iiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTToooooooooooo
oooooooooooo