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Latest revision as of 16:39, 16 October 2014

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Labs working on this lncRNA

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References

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Basic Information

Transcript ID

ENST00000507062.1

Source

Gencode19

Same with

lnc-SAP30-5:4,NONHSAT099260

Classification

intergenic

Length

4273 nt

Genomic location

chr4+:174451522..174463082

Exon number

4

Exons

174451522..174451690,174452118..174452229,174457999..174458121,174459214..174463082

Genome context

Sequence
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004241 AAGATGATGT CAGTAATAAA ATTACAGAAT CTA
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Predicted Small Protein

Name ENST00000507062.1_smProtein_1565:1807
Length 81
Molecular weight 9199.6839
Aromaticity 0.1375
Instability index 57.056375
Isoelectric point 9.69488525391
Runs 11
Runs residual 0.00131578947368
Runs probability 0.0498787557611
Amino acid sequence MDSCRRVAVPGPLLILWRWLFCVNQLLGAFGHLVGQPSLYQQNSSGLDSGRKPYISQTIK
SWLLLNKTVIFTLFYTEKHF
Secondary structure LLLLEEEELLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLEEELLLLLLLLLLLHHHHHHH
HHHHHLLLEEEEEEEEELLL
PRMN LLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHH
HHHHHHHHHHHHHHHLLLLL
PiMo iiiiiiiiiiiiTTTTTTTTTTTTTTTTTToooooooooooooooooooooooooooTTT
TTTTTTTTTTTTTTTiiiii