Difference between revisions of "Lnc-BTG2-2:4"

From LncRNAWiki
Jump to: navigation, search
(Created page with "Please input one-sentence summary here. ==Annotated Information== ===Transcriptomic Nomeclature=== Please input transcriptomic nomeclature information here. ===Functio...")
 
 
(2 intermediate revisions by one other user not shown)
Line 42: Line 42:
 
sequence = <dnaseq>CAGAAATTTCTTTTATTTTTTGGTATAAATCCAAATGTCCATTTGGCATCATTTTCCTTTTGTGCAAAAAAACCTTCCTTTAACGCTTCTTAAAATTCTGCTGTTGATTTTCTCTCATTGCTTTTGGACATTCTCTTTAACACTAGTTCTTAAAATTCAATTATGATGTGTCTTGATATAGTTTTCTTCATGTTTTTTTTTCCTGCTTGGGGGTTCATTGAGCTTCTTAGATCTGCAGGTTTATCGTTTTGTCACATTCAGAAAAGTTTTAATCATTCTTTCTTTAAATATTTTTTCTGCTCCCTCTTCTGGACTCTGATGGCACGTATATTAGGCAATCTGATGTTGTTCCTCAGCTTACTGACGCTTTGTTGGTTTCTTTTTTCCAGACTTCTTCTCGGCGCTGCATTTTGAATTGTTTCTACTAGTGTATCTTGAAGTTTACTAAGCTTTTCTTCTGGAGTGTCTAAGATGCTGTTCATCTCGGCCAGTATTTTTTCATCTGTAGAATTTAATTCAGTCTTTTTTTATGTTCTCCATATCTCTCCTTAACATGCTCATACATTCTTCTACCTTTGTGAACACATGGAGTATATTATCACTTTTTAATATTCTGCTCCGCATAATTCTAGCATCTGTATCATTTCTGTTTCAGTCAATTTATTTTTCTTCTTATTCTGGGTCATATTTTCTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTCAGAAAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGAAACCTCCGTCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTACCTCAGCGTTCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCGCCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTTTGTAGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGCCCAGGCTTGTCTCGAATTCCTGAGCTCAAGCAGTTCGCCCGCTTTGGCCCCTCAAAGTGTTGGGACTACAGGTGTAAGCCACTGTGCCCGGCCCTGGGTCGTATTTTCCTGCCTCTTTGTATGCCTGTTAAGGTTTGATTGGATGCCAGATGTGGCTGGAAAGGTCACTCATGATTAGTTACTTCTACTAATTCTCTGACTTCATCTTCTAATCTCCACCCCTCCCAGGTCTCTGATTTTGCCACCCTGAACTTCTTGCACACTTCCTCGTTCATTTGCACATGCTGTCCCCTTTCTCTGGGGCACTCTTCCCTAGGCGGTCCCCATGGGTTTCTCCCTAACTTCATTTGGGTCTGTGTTCAAATGTCACATTACCAAAAACATTCTATCACCTTTCCTTGCTTTATTTGCCTTTAAACATTTATAACCACTTGCCAGCCATGTTACTTACTGATTGTCTATTTTTACCTCACCGCCCACCTCTGCTAAAATGTACCATGACAGCATCACCGAGAACTACTGCCATCAGCTATATAATGAAACTATTTTTAAGCAACAACAACAGCAGCAGAGAAGAGGGACCAACAGGGTCCAATGCATCAGAGGGGTCCAAACTGATGCCACAGTTTTTTAAATCCATTCCTCCATCGACACTTGGGTGGTTCCATATCTTGACTATTGTGAAGAATGCTGCGTGAAAATAGAAGTGCAGCCTGAGCTTTTGCTGCGATCTCCAAAAAATCATTGCCAGTTGGATGTGGTGGCTCACACTTATAATCCCAGCACTTTGGGATGTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGTCCAGAGGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAAGGAGATGCTGTCTCTACCAAAAAGGAAAAAGAAAATGAAAAAAATCATTGCCAAGGCAACTGTCCAGGAACTTTTCCTCCATGTTTTCTTCTAGGAGTTTTATAGTTTCAGATCTTGCATTTAGGTTTTTTTAAAAAAATCTATTTTGAGTTGATTTTTGTGTATGGTGTCAGATAAGGGTCTAGTGTCATTCTTTTGCATGTGGAAATCCAGTTTTCCTGGCATCATTTATTGAGAAGACCATCCTTGCCCCATTTTGTCCTCTTGGAGCCCTTGACAAAAATGAGTTGACCATATATGTTTGAAATTATTTCTAGGCTGTCTCTTCTGTTCCGTTGGCCTATATGTCTTTTTTTCTGTCAGTACCATACTGTTTTGTTTACTATGGTTTTGAAATATATAGTAATTTTTCACTATATTTTTAAATTTTTAACTTTTACTATATTTTAAAGTAATTGTTAAATCAAGAAATGTAACGCTTCAGAATGCCTTCAGGATGGCTAATCATTAACAGTTTTCTTTCAGAAACTGTAAGAATTTAACACAAAAAGTAGTTTGGAAGCACACATTAAGGAGTTACCGGAAGAAGTTTCTTTTCCTAAATGTGCCTATAGGACCAGATACAAATCCAGCCCTGAATAATAAATGGAAGATTTCTATTTGTATTTCTTTCTTAGAATTGTTTTGGCTATTTGGGGTCTTTTGTGGTTCTGTATGAATTGTAGGAATTTTTTTTTTCTATTTCCATGAAGAATGTCATTGGGATTTTGATAAGAATTGTGTCAAGTCTGTATATTGCTTTGGATAATAGGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCTGATCCATGAGCACAGAATATCTTTCCATTTGTTTATATCTTTTTTAGTTTTTTTATTGATGCTTTATACTTTTCAATGTACAGATCTTTCATCTCCTTGATTATTTCTCCCAAGTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTTGATGATATCACAAATAAGATTGTGTTTGTTATTTCTTTTTCAGCTAGGTCATTATTTGTGTATAAAAATGCTACTAATTGGGGCCAGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGATGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCGGCCTGGCCAACATGCTGAAACACCATCTCTACCAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTAATCTCAGCTATTTGGGAGGCTGAGACAAGAGAATTGCATGAACCCGAGAAGCGGAGGTTCCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGACGACAGAGTAAGACTCTGTCTCAAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAGCTATTGATTTTTAAAAAATGTTCGAAACACATTTATTTTCTAAATCACCTGAAGTTGACTTATATAAGATAATTTCAACAAATAAAATGTTCAATGAAAAATTGTGGTATGCAACGTACTTATGTCATTACAAGTTGA</dnaseq>|
 
sequence = <dnaseq>CAGAAATTTCTTTTATTTTTTGGTATAAATCCAAATGTCCATTTGGCATCATTTTCCTTTTGTGCAAAAAAACCTTCCTTTAACGCTTCTTAAAATTCTGCTGTTGATTTTCTCTCATTGCTTTTGGACATTCTCTTTAACACTAGTTCTTAAAATTCAATTATGATGTGTCTTGATATAGTTTTCTTCATGTTTTTTTTTCCTGCTTGGGGGTTCATTGAGCTTCTTAGATCTGCAGGTTTATCGTTTTGTCACATTCAGAAAAGTTTTAATCATTCTTTCTTTAAATATTTTTTCTGCTCCCTCTTCTGGACTCTGATGGCACGTATATTAGGCAATCTGATGTTGTTCCTCAGCTTACTGACGCTTTGTTGGTTTCTTTTTTCCAGACTTCTTCTCGGCGCTGCATTTTGAATTGTTTCTACTAGTGTATCTTGAAGTTTACTAAGCTTTTCTTCTGGAGTGTCTAAGATGCTGTTCATCTCGGCCAGTATTTTTTCATCTGTAGAATTTAATTCAGTCTTTTTTTATGTTCTCCATATCTCTCCTTAACATGCTCATACATTCTTCTACCTTTGTGAACACATGGAGTATATTATCACTTTTTAATATTCTGCTCCGCATAATTCTAGCATCTGTATCATTTCTGTTTCAGTCAATTTATTTTTCTTCTTATTCTGGGTCATATTTTCTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTCAGAAAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGAAACCTCCGTCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTACCTCAGCGTTCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGCACCGCCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTTTGTAGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGCCCAGGCTTGTCTCGAATTCCTGAGCTCAAGCAGTTCGCCCGCTTTGGCCCCTCAAAGTGTTGGGACTACAGGTGTAAGCCACTGTGCCCGGCCCTGGGTCGTATTTTCCTGCCTCTTTGTATGCCTGTTAAGGTTTGATTGGATGCCAGATGTGGCTGGAAAGGTCACTCATGATTAGTTACTTCTACTAATTCTCTGACTTCATCTTCTAATCTCCACCCCTCCCAGGTCTCTGATTTTGCCACCCTGAACTTCTTGCACACTTCCTCGTTCATTTGCACATGCTGTCCCCTTTCTCTGGGGCACTCTTCCCTAGGCGGTCCCCATGGGTTTCTCCCTAACTTCATTTGGGTCTGTGTTCAAATGTCACATTACCAAAAACATTCTATCACCTTTCCTTGCTTTATTTGCCTTTAAACATTTATAACCACTTGCCAGCCATGTTACTTACTGATTGTCTATTTTTACCTCACCGCCCACCTCTGCTAAAATGTACCATGACAGCATCACCGAGAACTACTGCCATCAGCTATATAATGAAACTATTTTTAAGCAACAACAACAGCAGCAGAGAAGAGGGACCAACAGGGTCCAATGCATCAGAGGGGTCCAAACTGATGCCACAGTTTTTTAAATCCATTCCTCCATCGACACTTGGGTGGTTCCATATCTTGACTATTGTGAAGAATGCTGCGTGAAAATAGAAGTGCAGCCTGAGCTTTTGCTGCGATCTCCAAAAAATCATTGCCAGTTGGATGTGGTGGCTCACACTTATAATCCCAGCACTTTGGGATGTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGTCCAGAGGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAAGGAGATGCTGTCTCTACCAAAAAGGAAAAAGAAAATGAAAAAAATCATTGCCAAGGCAACTGTCCAGGAACTTTTCCTCCATGTTTTCTTCTAGGAGTTTTATAGTTTCAGATCTTGCATTTAGGTTTTTTTAAAAAAATCTATTTTGAGTTGATTTTTGTGTATGGTGTCAGATAAGGGTCTAGTGTCATTCTTTTGCATGTGGAAATCCAGTTTTCCTGGCATCATTTATTGAGAAGACCATCCTTGCCCCATTTTGTCCTCTTGGAGCCCTTGACAAAAATGAGTTGACCATATATGTTTGAAATTATTTCTAGGCTGTCTCTTCTGTTCCGTTGGCCTATATGTCTTTTTTTCTGTCAGTACCATACTGTTTTGTTTACTATGGTTTTGAAATATATAGTAATTTTTCACTATATTTTTAAATTTTTAACTTTTACTATATTTTAAAGTAATTGTTAAATCAAGAAATGTAACGCTTCAGAATGCCTTCAGGATGGCTAATCATTAACAGTTTTCTTTCAGAAACTGTAAGAATTTAACACAAAAAGTAGTTTGGAAGCACACATTAAGGAGTTACCGGAAGAAGTTTCTTTTCCTAAATGTGCCTATAGGACCAGATACAAATCCAGCCCTGAATAATAAATGGAAGATTTCTATTTGTATTTCTTTCTTAGAATTGTTTTGGCTATTTGGGGTCTTTTGTGGTTCTGTATGAATTGTAGGAATTTTTTTTTTCTATTTCCATGAAGAATGTCATTGGGATTTTGATAAGAATTGTGTCAAGTCTGTATATTGCTTTGGATAATAGGGACATTTTAACAATATTAATTCTTCTGATCCATGAGCACAGAATATCTTTCCATTTGTTTATATCTTTTTTAGTTTTTTTATTGATGCTTTATACTTTTCAATGTACAGATCTTTCATCTCCTTGATTATTTCTCCCAAGTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTTGATGATATCACAAATAAGATTGTGTTTGTTATTTCTTTTTCAGCTAGGTCATTATTTGTGTATAAAAATGCTACTAATTGGGGCCAGGCGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGATGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCGGCCTGGCCAACATGCTGAAACACCATCTCTACCAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTAATCTCAGCTATTTGGGAGGCTGAGACAAGAGAATTGCATGAACCCGAGAAGCGGAGGTTCCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGACGACAGAGTAAGACTCTGTCTCAAAAAACAAACAAACAAACAAAAAAGCTATTGATTTTTAAAAAATGTTCGAAACACATTTATTTTCTAAATCACCTGAAGTTGACTTATATAAGATAATTTCAACAAATAAAATGTTCAATGAAAAATTGTGGTATGCAACGTACTTATGTCATTACAAGTTGA</dnaseq>|
 
}}
 
}}
[[Category:Intergenic]]
+
[[Category:Intergenic]][[Category:lnc-BTG2-2]][[Category:NONHSAG003995]][[Category:Transcripts]]

Latest revision as of 03:43, 17 October 2014

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Transcriptomic Nomeclature

Please input transcriptomic nomeclature information here.

Function

Please input function information here.

Regulation

Please input regulation information here.

Expression

Please input expression information here.

Allelic Information and Variation

Please input allelic information and variation information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this lncRNA

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Basic Information

Transcript ID

lnc-BTG2-2:4

Source

LNCipedia2.1

Same with

NONHSAT008891

Classification

intergenic

Length

3274 nt

Genomic location

chr1+:203364732..203369257

Exon number

3

Exons

203364732..203366255,203366957..203367051,203367603..203369257

Genome context

Sequence
000001 CAGAAATTTC TTTTATTTTT TGGTATAAAT CCAAATGTCC ATTTGGCATC ATTTTCCTTT TGTGCAAAAA AACCTTCCTT 000080
000081 TAACGCTTCT TAAAATTCTG CTGTTGATTT TCTCTCATTG CTTTTGGACA TTCTCTTTAA CACTAGTTCT TAAAATTCAA 000160
000161 TTATGATGTG TCTTGATATA GTTTTCTTCA TGTTTTTTTT TCCTGCTTGG GGGTTCATTG AGCTTCTTAG ATCTGCAGGT 000240
000241 TTATCGTTTT GTCACATTCA GAAAAGTTTT AATCATTCTT TCTTTAAATA TTTTTTCTGC TCCCTCTTCT GGACTCTGAT 000320
000321 GGCACGTATA TTAGGCAATC TGATGTTGTT CCTCAGCTTA CTGACGCTTT GTTGGTTTCT TTTTTCCAGA CTTCTTCTCG 000400
000401 GCGCTGCATT TTGAATTGTT TCTACTAGTG TATCTTGAAG TTTACTAAGC TTTTCTTCTG GAGTGTCTAA GATGCTGTTC 000480
000481 ATCTCGGCCA GTATTTTTTC ATCTGTAGAA TTTAATTCAG TCTTTTTTTA TGTTCTCCAT ATCTCTCCTT AACATGCTCA 000560
000561 TACATTCTTC TACCTTTGTG AACACATGGA GTATATTATC ACTTTTTAAT ATTCTGCTCC GCATAATTCT AGCATCTGTA 000640
000641 TCATTTCTGT TTCAGTCAAT TTATTTTTCT TCTTATTCTG GGTCATATTT TCTTTTTGTT TTGTTTTGTT TTGTTTTCAG 000720
000721 AAAGAGTCTC GCTCTGTCGC CCAGGTTGGA GTGCAGTGGC ACGATCTCGG CTCACTGAAA CCTCCGTCTC CCGGGTTCAA 000800
000801 GCGATTCTCC TACCTCAGCG TTCCGAGTAG CTGGGACTAC AGGTGCGCAC CGCCACGCCC GGCTAATTTT TGTATTTTTT 000880
000881 TGTAGAGACG GGGTTTTGCC ATGTTGCCCA GGCTTGTCTC GAATTCCTGA GCTCAAGCAG TTCGCCCGCT TTGGCCCCTC 000960
000961 AAAGTGTTGG GACTACAGGT GTAAGCCACT GTGCCCGGCC CTGGGTCGTA TTTTCCTGCC TCTTTGTATG CCTGTTAAGG 001040
001041 TTTGATTGGA TGCCAGATGT GGCTGGAAAG GTCACTCATG ATTAGTTACT TCTACTAATT CTCTGACTTC ATCTTCTAAT 001120
001121 CTCCACCCCT CCCAGGTCTC TGATTTTGCC ACCCTGAACT TCTTGCACAC TTCCTCGTTC ATTTGCACAT GCTGTCCCCT 001200
001201 TTCTCTGGGG CACTCTTCCC TAGGCGGTCC CCATGGGTTT CTCCCTAACT TCATTTGGGT CTGTGTTCAA ATGTCACATT 001280
001281 ACCAAAAACA TTCTATCACC TTTCCTTGCT TTATTTGCCT TTAAACATTT ATAACCACTT GCCAGCCATG TTACTTACTG 001360
001361 ATTGTCTATT TTTACCTCAC CGCCCACCTC TGCTAAAATG TACCATGACA GCATCACCGA GAACTACTGC CATCAGCTAT 001440
001441 ATAATGAAAC TATTTTTAAG CAACAACAAC AGCAGCAGAG AAGAGGGACC AACAGGGTCC AATGCATCAG AGGGGTCCAA 001520
001521 ACTGATGCCA CAGTTTTTTA AATCCATTCC TCCATCGACA CTTGGGTGGT TCCATATCTT GACTATTGTG AAGAATGCTG 001600
001601 CGTGAAAATA GAAGTGCAGC CTGAGCTTTT GCTGCGATCT CCAAAAAATC ATTGCCAGTT GGATGTGGTG GCTCACACTT 001680
001681 ATAATCCCAG CACTTTGGGA TGTGAGGTGG GAGGATCACT TGAGTCCAGA GGTTCGAGAC CAGCCTGGGC AACATAAGGA 001760
001761 GATGCTGTCT CTACCAAAAA GGAAAAAGAA AATGAAAAAA ATCATTGCCA AGGCAACTGT CCAGGAACTT TTCCTCCATG 001840
001841 TTTTCTTCTA GGAGTTTTAT AGTTTCAGAT CTTGCATTTA GGTTTTTTTA AAAAAATCTA TTTTGAGTTG ATTTTTGTGT 001920
001921 ATGGTGTCAG ATAAGGGTCT AGTGTCATTC TTTTGCATGT GGAAATCCAG TTTTCCTGGC ATCATTTATT GAGAAGACCA 002000
002001 TCCTTGCCCC ATTTTGTCCT CTTGGAGCCC TTGACAAAAA TGAGTTGACC ATATATGTTT GAAATTATTT CTAGGCTGTC 002080
002081 TCTTCTGTTC CGTTGGCCTA TATGTCTTTT TTTCTGTCAG TACCATACTG TTTTGTTTAC TATGGTTTTG AAATATATAG 002160
002161 TAATTTTTCA CTATATTTTT AAATTTTTAA CTTTTACTAT ATTTTAAAGT AATTGTTAAA TCAAGAAATG TAACGCTTCA 002240
002241 GAATGCCTTC AGGATGGCTA ATCATTAACA GTTTTCTTTC AGAAACTGTA AGAATTTAAC ACAAAAAGTA GTTTGGAAGC 002320
002321 ACACATTAAG GAGTTACCGG AAGAAGTTTC TTTTCCTAAA TGTGCCTATA GGACCAGATA CAAATCCAGC CCTGAATAAT 002400
002401 AAATGGAAGA TTTCTATTTG TATTTCTTTC TTAGAATTGT TTTGGCTATT TGGGGTCTTT TGTGGTTCTG TATGAATTGT 002480
002481 AGGAATTTTT TTTTTCTATT TCCATGAAGA ATGTCATTGG GATTTTGATA AGAATTGTGT CAAGTCTGTA TATTGCTTTG 002560
002561 GATAATAGGG ACATTTTAAC AATATTAATT CTTCTGATCC ATGAGCACAG AATATCTTTC CATTTGTTTA TATCTTTTTT 002640
002641 AGTTTTTTTA TTGATGCTTT ATACTTTTCA ATGTACAGAT CTTTCATCTC CTTGATTATT TCTCCCAAGT ATTTTATTTT 002720
002721 ATTTTATTTT ATTTTATTTT ATTTTTGATG ATATCACAAA TAAGATTGTG TTTGTTATTT CTTTTTCAGC TAGGTCATTA 002800
002801 TTTGTGTATA AAAATGCTAC TAATTGGGGC CAGGCGTGGT GGCTCATGCC TGTAATCCCA GCACTTTGGG ATGCCGAGGT 002880
002881 GGGTGGATCA CCTGAGGTCA GGAGTTCAAG ACCGGCCTGG CCAACATGCT GAAACACCAT CTCTACCAAA AAATACAAAA 002960
002961 ATTAGCCAGG CGTGGTGGTG CATGCCTGTA ATCTCAGCTA TTTGGGAGGC TGAGACAAGA GAATTGCATG AACCCGAGAA 003040
003041 GCGGAGGTTC CAGTGAGCTG AGATTGCACC ACTGCACTCC AGCCTGGACG ACAGAGTAAG ACTCTGTCTC AAAAAACAAA 003120
003121 CAAACAAACA AAAAAGCTAT TGATTTTTAA AAAATGTTCG AAACACATTT ATTTTCTAAA TCACCTGAAG TTGACTTATA 003200
003201 TAAGATAATT TCAACAAATA AAATGTTCAA TGAAAAATTG TGGTATGCAA CGTACTTATG TCATTACAAG TTGA
[back to top]