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Latest revision as of 19:39, 16 October 2014

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Transcriptomic Nomeclature

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Function

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Regulation

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Expression

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Allelic Information and Variation

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Evolution

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Labs working on this lncRNA

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References

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Basic Information

Transcript ID

NONHSAT006254

Source

NONCODE4.0

Same with

,

Classification

intergenic

Length

4542 nt

Genomic location

chr1-:149816065..149820591

Exon number

1

Exons

149816065..149820591

Genome context

Sequence
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002801 TGAAGTTGAA TAGAAGGTTT TAGTCAAATA CTGAGATGAA AACTGAGGCA GTCCTGGCGG GGGGGAGTGA GTGTGTGTGT 002880
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003201 GTCAGCCTAT ACTAAATCAA TTTCATTTAA AATATCTCGG CTACTACTCT GCATCTCCAC TGCTACCATC GGCCTCTCCA 003280
003281 GTCACATTCT CCAAGAGCAC TCTATCTCAT TTAAAAGACA AAATCTCTGC AGTGGCCTGT GATGCTCCTT AATGGCCTAC 003360
003361 ATAATCCAGC CCTCAAGCAC CTCCGTGATC TCTGTAAAAC TTTCCCTTGG TCACTGTGCT TCAGCCACAT TAACCAGCTT 003440
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003521 CTCAAGATAT CCTACAACTA TCTTACTGTA TTCAGCTCTC TGCTCAAGTA TTAACTGATG AAACCTGTCA TCCCTACTCC 003600
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004401 AACATGTATT TTCTAAGTTT GTATTATGCC TTTATCTTGG TACTTTTATC TTCTGTTCTC ACTTGATCTT TTTGAAATGT 004480
004481 ATTTTAAATC CTAATAAAAA TATATAAAGT CTGGAATTAA TAAAGGAAAA AAAAAAAAAA AA
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Predicted Small Protein

Name NONHSAT006254_smProtein_2966:3181
Length 72
Molecular weight 8299.8447
Aromaticity 0.183098591549
Instability index 44.7492957746
Isoelectric point 9.90020751953
Runs 7
Runs residual 0.0499629355078
Runs probability 0.0503066091301
Amino acid sequence MRSYKPNPLLFPKLQILIFLTSYLIFTLRYLPGVFNILFKTVLLVFFLQDYSLLISANSS
SFQVLSVKTYN
Secondary structure LLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLL
LEEEEEEEEEL
PRMN LLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHH
HHHHLLLLLLL
PiMo iiiiiiiiiiiiiiiiiTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTooooTTTTTTTTTTTTTT
TTTTiiiiiii