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Latest revision as of 01:08, 17 October 2014

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Transcriptomic Nomeclature

Please input transcriptomic nomeclature information here.

Function

Please input function information here.

Regulation

Please input regulation information here.

Expression

Please input expression information here.

Allelic Information and Variation

Please input allelic information and variation information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this lncRNA

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Basic Information

Transcript ID

NONHSAT098640

Source

NONCODE4.0

Same with

,

Classification

sense

Length

2781 nt

Genomic location

chr4+:146578404..146581186

Exon number

1

Exons

146578404..146581186

Genome context

Sequence
000001 TCATTTCTCC TTATGTTGTC GTTGTACCAT TGGGTATTGT ATAGAGACCA ATTTCTAAGA GATTTTTTCA CCTCTGTTTC 000080
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000961 TTCTTTATAA ATTTATAAAT TACCCAGTCG CAGATATTTA TAGAAAGAAC AGCCTAATAC AGGTGCTAAA TACATATCTG 001040
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002161 GAAAATTTGT GTATAAAGGT AACCTTGGGG CAGTTTATTT TGCTTAGACC CCTCAGCTTC TTGATAGAGT GAGGTGAGGG 002240
002241 CATATGTAAG TCAGTAAACT ATTCTGTTAG TAAAGTCAAA GGCGTAATCT AAATTAATTA TGCTTTTAAC TAACACAGAA 002320
002321 GAAATCATGT GACCTCATTC TCAAAGCTCG TAACATCCAC CTGGCCAATC TTAAGATGTG GATAGAGTTC TTTTTTTTCT 002400
002401 TTTTTCAATT TTTACAATAA TTTTTGACAC ATTGAAGCTG TGCATGTTTA TGGGGGCACA ATTTGATGTT TCAATACATG 002480
002481 TATATGTTGT GTAATGATCA AATCGGAGTA CTTAGCATAT CTATCATCTC GTGCATTTAT CATTTCTTTG TGGCGAGAAC 002560
002561 ATTTAAAAAT CCTATTTTCT AGCTATTTTG TAATATACAC TACCTTACTG TTGCGAACCA TAGTCACCCT ACTGTGCAAT 002640
002641 AGAACACCTG AACTTATTCC TCCTATCTAG TTGTAACTTT GTACCCATTG ACCCCCCTTC CCTTCCTTCC ACTCTCCCCT 002720
002721 CCCCAGTCTC TGGTAACCAC TGTTCTGTTC CCTATGAGAT AAAACTTTTT TTGTCTTCCA T
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Predicted Small Protein

Name NONHSAT098640_smProtein_701:835
Length 45
Molecular weight 4889.8266
Aromaticity 0.0681818181818
Instability index 57.2636363636
Isoelectric point 10.7631225586
Runs 7
Runs residual 0.00401069518717
Runs probability 0.0438463673759
Amino acid sequence MTWAILWVVSELLLRVHTRSRSGHLKVCGISPSLTLSLAPTFVI
Secondary structure LLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEELLLLLLLLLLLEEL
PRMN -
PiMo -