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Latest revision as of 07:20, 17 October 2014
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Contents
Annotated Information
Transcriptomic Nomeclature
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Function
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Regulation
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Expression
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Allelic Information and Variation
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Evolution
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Labs working on this lncRNA
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References
Please input cited references here.
Basic Information
Transcript ID |
NONHSAT131902 |
Source |
NONCODE4.0 |
Same with |
, |
Classification |
intergenic |
Length |
3793 nt |
Genomic location |
chr9+:76188530..76196553 |
Exon number |
3 |
Exons |
76188530..76188769,76192784..76193074,76193292..76196553 |
Genome context |
|
Sequence |
000001 AGGAAGATAG AGTTGTACTG TGACCACGGT TACCTAGGAG TCTGTATTTT TAGTTTAATT TTTTATTGAT CTATAAAGTG 000080
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Predicted Small Protein
Name | NONHSAT131902_smProtein_1886:2113 |
Length | 76 |
Molecular weight | 8935.4666 |
Aromaticity | 0.12 |
Instability index | 72.1666666667 |
Isoelectric point | 8.66387939453 |
Runs | 10 |
Runs residual | 0.0156028368794 |
Runs probability | 0.0506270976859 |
Amino acid sequence | MEKIEIVIFPVRHRALNKPSDSFMHKPKFTYRVITYFLYLIMSIRIHISNIDSGFNEDCF KMLNETVKVHIDSLC |
Secondary structure | LLEEEEEEEELLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEHHHHHHHHHHHEEEEEELLLLLLLHHHH HHHHHHHHEEELLLL |
PRMN | LLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLL LLLLLLLLLLLLLLL |
PiMo | iiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiTTTTTTTTTTTTTTTTTToooooooooooo ooooooooooooooo |