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Revision as of 09:36, 13 October 2014
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Contents
Annotated Information
Transcriptomic Nomeclature
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Function
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Regulation
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Expression
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Allelic Information and Variation
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Evolution
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Labs working on this lncRNA
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References
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Basic Information
Transcript ID |
NONHSAT104640 |
Source |
NONCODE4.0 |
Same with |
, |
Classification |
intergenic |
Length |
3914 nt |
Genomic location |
chr5+:151187002..151190915 |
Exon number |
1 |
Exons |
151187002..151190915 |
Genome context |
|
Sequence |
000001 AAGGTTAACA TTACAGTTCT TAATTTCCTT TAGGGCAAAC AAGATAATTA AACTTGGGTT TTGTGAGTCT TTTTTTGATT 000080
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Predicted Small Protein
Name | NONHSAT104640_smProtein_3572:3760 |
Length | 63 |
Molecular weight | 6950.9774 |
Aromaticity | 0.145161290323 |
Instability index | 52.5856451613 |
Isoelectric point | 8.71185302734 |
Runs | 13 |
Runs residual | 0.0560368663594 |
Runs probability | 0.0556982321688 |
Amino acid sequence | MTSSMLKSESSASIFVIPHIQSSAKSCQFYLKSFPSFFLTYVISVVSQLHLTSYSSLLYT QC |
Secondary structure | LLHHHLLLLLLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEEEHHHHEEEELLLEEEE EL |
PRMN | LLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLL LL |
PiMo | iiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiTTTTTTTTTTTTTTTTTToooooooooo oo |