Difference between revisions of "NONHSAT146407"
Line 42: | Line 42: | ||
sequence = <dnaseq>cataacttttattagattatgttgttataattgttctatttttatttcttattaatctcttactgtgcattatttataaattaagcattatcataggtatgtacttacaggaaaaaatatagcatatataaggtttggtattaaccacaatttgaggcatctgctgggggtcttggaatgtatcccctgcagataagggaggactactatactttatgaatttattaatggtaagatctagtggcaggtctaataactactttcaaagcagtggtgagcgtaaacaatatgttaagataactgcagcaagtatagtacaaaatgaaaaatgtctgtggtttctattgtgtcagggtgtttttaattttacctatattcatagtttgttgtctacattcataatttaatgatatgctaactactttcaaagcagtggtgagcataaatagtattttgaggccgtgcgtggtggcttacgcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggcgggtgaatcactgaggttgggagttcgagaccagcctgaccaacatggagaaaccccatctctactaaaaatacaaaattagctgggcatgatggcgcatgcctgtaatccctgctacttgggaggctgaggcaggagaatcgtttgaacccgggaggcagaggttgcggtgagctgagatcgccccgttgcatgccagcctgggcaacaagagcgaaactctgtctcaaaaacaaaaaacaaaaccaaacaaaaaacaaaactacaatattttgaggtaactgcagcaaatatagtacaaaataaaaaaatgcctgtgatttctattgtgtcagggtgtttttaattttacctacattcatagtttgttgtctacattcataatttaaagatatgctaaattttagccagaggttaatgaaaatgaaggtaacatttttttttaacccatcgaggttcacagaaccactgaatctattagtggacaccattaattaaacatccatgGTACTgttgattcttatttatcttttatatttcattccaaatgttgactcctcagagagtcattttctgatacccagactagatccaatttccctgttatactcttcaagcatctcacacttttcccttgcaggacttaactcagttggtaatggtacatttgtgcattggttgtctgcctctcttcacctctttccctgaggaaggagttggtatctgttagtcactgttgtattaccagcacatagtagatgctcagtaaatatttgttgagtaaataaaGATTAGGAAAGCTATCAAACTAATTTATTACCTTAGTAAGTAGGAAAAGAGCTTGGTAACTTGAGAGACTGACTGAAGGCCAGTGTCTATAATCATTTTCAGGGATATGTAGTTGTAAAATACATGTAGCTATAGTCAGGATGTAAAGTAGGTCACAGTAACCAAATAGCAAGGGGTTTAGGGAAAATTAGGGAACTGGAGAAAGGGCAAATTGTTCATGAGGGAAAAGAGAAGGTGTAATGTTTATGGGTGGACTTGTTGCTTGCTCTGTCACCTCTACCCCTATTAGTCCTGCCATTACCATTTTACTTAATCACTTAGCCAGGCCTGATACATAGTAGTCTTTGCTAACTGGATATTATGGAGGTAAAGCTGAAGGTTTTTGTTTGTGAAATGTTACACTAAGATAGGAGCTTGTGATAGATCTTTAAATAATGCTTTTAAAATGTGCCTGTTTATATTAATCTTCACCAGAATGTCACAGGTAGACTAATGGTTGGCCTACGTTGGTGGAATCACATTGATGAAGATGGAAAGAGCCATTGGGTGTTTGAATCTAGAAAGGAGTCCTCTCAAGAGAATAAAACTGTGTCAGAGGCTGAATCAAGAATCTTTTGGTTGGGACTTATTGCCTGTCCAGTACTGTGGGTGATATTTGCTTTTAGTGCACTCTTCTCCTTCAGAGTAAAGTGGTTGGCGGTGGTTATCATGGGTGTGGTGCTACAAGGTGCCAACCTGTATGGTTACATCAGGTGTAAGGTGCGCAGCAGAAAGCATTTAACCAGCATGGCTACTTCATATTTTGGAAAGCAGTTTTTAAGACAAAACACTGGAGATGATCAGACTTCCTGAATAGAGAAAGCTTATGTGCTTTGTTACATTGGGGAACAACTGAAGAGATTCTTGACTCAACCTTTTAGAGCTTAGTCCATGTTGCAACGAGGAGTGTTGGCTTTGTTTTTCCACTTAAAAACTTTATTTATAAAAAGGAAAAGTAGTTTTCATATTAAGTTTTTATTTCCTTTCCAGCAGTTGGGGCTAGAAAGTATGTGTTGGCACTAGAAACATTGTCAAGATTTGTTCTGTGGTGTAGGTATGCACATTCCATAGGTATGCACACGGCCATGTAATATCAGTATATCCCAAGTTAATGAAAGTGTTCATTTACATAGGTAATGGAGACCTTTGCATTTTGATCCATAGAACATAGGAGGATGTTCTTAGTCTGTCTCAAAGCTCTATATGTTTACATATTATTTCTGTAGATTGTTTTCAGGAGAAAGTTTTGCTTCTATGGTAAGAGTGAGCACTTTGGCTTATGTATAAGTTAGAAATAATTGTTAGTTTTTAATATGCACTTCGTGGGGAAATTTCTTAGACGTATGCAAGCAAGTGAAAACAATTAGGGCCAGTGGTATTAACTACTTTATAAAATTTTATTTTTGTTTGTAAGAAGTCATCTATTTAAGGCCCAGTTAATATAAGTGGAATCATCATAGTTTAAGGAATACCCAGAGATTGCTGCTGTTCTATTTATTTTACAGAAAGGATAGCTAGATTGAAAGCTCTTCAGTGGACCTTGAGCTAATAGATCTTTTACCACTAAAAGAGCATTATTCTCATGTCATAATGAGAATAATAATTTACATACTTGGCATAATAAATGCCTAAAAGACATTTTATTTTCTGAATCTATTTTTTTCTTGCTATAATGGGGATATTGTAAATTATGCATTTGTATTAATGGTATTTCTTAAAGCAATCTATGTAACTGTAAATTAAACCAATCTACAAACTATTGTAGGCATCTGTAAATTCTGTTGTAGGTATTATAAACTTTGTTGAAGTCTTAATCAGCAGATTATGTTGTGAATATATTTGTACATTGTTAAAATAGTTTTTAAGATTATTTGTTTAATTGAATAAGTGTCTTATTGGAGTGATAGCTTTGAAGGTGCAAAActttatatttgtataaaattctactatttacaaggca</dnaseq>| | sequence = <dnaseq>cataacttttattagattatgttgttataattgttctatttttatttcttattaatctcttactgtgcattatttataaattaagcattatcataggtatgtacttacaggaaaaaatatagcatatataaggtttggtattaaccacaatttgaggcatctgctgggggtcttggaatgtatcccctgcagataagggaggactactatactttatgaatttattaatggtaagatctagtggcaggtctaataactactttcaaagcagtggtgagcgtaaacaatatgttaagataactgcagcaagtatagtacaaaatgaaaaatgtctgtggtttctattgtgtcagggtgtttttaattttacctatattcatagtttgttgtctacattcataatttaatgatatgctaactactttcaaagcagtggtgagcataaatagtattttgaggccgtgcgtggtggcttacgcctgtaatcccagcactttgggaggccaaggcgggtgaatcactgaggttgggagttcgagaccagcctgaccaacatggagaaaccccatctctactaaaaatacaaaattagctgggcatgatggcgcatgcctgtaatccctgctacttgggaggctgaggcaggagaatcgtttgaacccgggaggcagaggttgcggtgagctgagatcgccccgttgcatgccagcctgggcaacaagagcgaaactctgtctcaaaaacaaaaaacaaaaccaaacaaaaaacaaaactacaatattttgaggtaactgcagcaaatatagtacaaaataaaaaaatgcctgtgatttctattgtgtcagggtgtttttaattttacctacattcatagtttgttgtctacattcataatttaaagatatgctaaattttagccagaggttaatgaaaatgaaggtaacatttttttttaacccatcgaggttcacagaaccactgaatctattagtggacaccattaattaaacatccatgGTACTgttgattcttatttatcttttatatttcattccaaatgttgactcctcagagagtcattttctgatacccagactagatccaatttccctgttatactcttcaagcatctcacacttttcccttgcaggacttaactcagttggtaatggtacatttgtgcattggttgtctgcctctcttcacctctttccctgaggaaggagttggtatctgttagtcactgttgtattaccagcacatagtagatgctcagtaaatatttgttgagtaaataaaGATTAGGAAAGCTATCAAACTAATTTATTACCTTAGTAAGTAGGAAAAGAGCTTGGTAACTTGAGAGACTGACTGAAGGCCAGTGTCTATAATCATTTTCAGGGATATGTAGTTGTAAAATACATGTAGCTATAGTCAGGATGTAAAGTAGGTCACAGTAACCAAATAGCAAGGGGTTTAGGGAAAATTAGGGAACTGGAGAAAGGGCAAATTGTTCATGAGGGAAAAGAGAAGGTGTAATGTTTATGGGTGGACTTGTTGCTTGCTCTGTCACCTCTACCCCTATTAGTCCTGCCATTACCATTTTACTTAATCACTTAGCCAGGCCTGATACATAGTAGTCTTTGCTAACTGGATATTATGGAGGTAAAGCTGAAGGTTTTTGTTTGTGAAATGTTACACTAAGATAGGAGCTTGTGATAGATCTTTAAATAATGCTTTTAAAATGTGCCTGTTTATATTAATCTTCACCAGAATGTCACAGGTAGACTAATGGTTGGCCTACGTTGGTGGAATCACATTGATGAAGATGGAAAGAGCCATTGGGTGTTTGAATCTAGAAAGGAGTCCTCTCAAGAGAATAAAACTGTGTCAGAGGCTGAATCAAGAATCTTTTGGTTGGGACTTATTGCCTGTCCAGTACTGTGGGTGATATTTGCTTTTAGTGCACTCTTCTCCTTCAGAGTAAAGTGGTTGGCGGTGGTTATCATGGGTGTGGTGCTACAAGGTGCCAACCTGTATGGTTACATCAGGTGTAAGGTGCGCAGCAGAAAGCATTTAACCAGCATGGCTACTTCATATTTTGGAAAGCAGTTTTTAAGACAAAACACTGGAGATGATCAGACTTCCTGAATAGAGAAAGCTTATGTGCTTTGTTACATTGGGGAACAACTGAAGAGATTCTTGACTCAACCTTTTAGAGCTTAGTCCATGTTGCAACGAGGAGTGTTGGCTTTGTTTTTCCACTTAAAAACTTTATTTATAAAAAGGAAAAGTAGTTTTCATATTAAGTTTTTATTTCCTTTCCAGCAGTTGGGGCTAGAAAGTATGTGTTGGCACTAGAAACATTGTCAAGATTTGTTCTGTGGTGTAGGTATGCACATTCCATAGGTATGCACACGGCCATGTAATATCAGTATATCCCAAGTTAATGAAAGTGTTCATTTACATAGGTAATGGAGACCTTTGCATTTTGATCCATAGAACATAGGAGGATGTTCTTAGTCTGTCTCAAAGCTCTATATGTTTACATATTATTTCTGTAGATTGTTTTCAGGAGAAAGTTTTGCTTCTATGGTAAGAGTGAGCACTTTGGCTTATGTATAAGTTAGAAATAATTGTTAGTTTTTAATATGCACTTCGTGGGGAAATTTCTTAGACGTATGCAAGCAAGTGAAAACAATTAGGGCCAGTGGTATTAACTACTTTATAAAATTTTATTTTTGTTTGTAAGAAGTCATCTATTTAAGGCCCAGTTAATATAAGTGGAATCATCATAGTTTAAGGAATACCCAGAGATTGCTGCTGTTCTATTTATTTTACAGAAAGGATAGCTAGATTGAAAGCTCTTCAGTGGACCTTGAGCTAATAGATCTTTTACCACTAAAAGAGCATTATTCTCATGTCATAATGAGAATAATAATTTACATACTTGGCATAATAAATGCCTAAAAGACATTTTATTTTCTGAATCTATTTTTTTCTTGCTATAATGGGGATATTGTAAATTATGCATTTGTATTAATGGTATTTCTTAAAGCAATCTATGTAACTGTAAATTAAACCAATCTACAAACTATTGTAGGCATCTGTAAATTCTGTTGTAGGTATTATAAACTTTGTTGAAGTCTTAATCAGCAGATTATGTTGTGAATATATTTGTACATTGTTAAAATAGTTTTTAAGATTATTTGTTTAATTGAATAAGTGTCTTATTGGAGTGATAGCTTTGAAGGTGCAAAActttatatttgtataaaattctactatttacaaggca</dnaseq>| | ||
}} | }} | ||
− | [[Category:Sense]][[Category:NONHSAG021076]] | + | [[Category:Sense]][[Category:NONHSAG021076]][[Category:Transcripts]] |
Latest revision as of 03:21, 17 October 2014
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Transcriptomic Nomeclature
Please input transcriptomic nomeclature information here.
Function
Please input function information here.
Regulation
Please input regulation information here.
Expression
Please input expression information here.
Allelic Information and Variation
Please input allelic information and variation information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this lncRNA
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Basic Information
Transcript ID |
NONHSAT146407 |
Source |
NONCODE4.0 |
Same with |
, |
Classification |
sense |
Length |
3298 nt |
Genomic location |
chr17+:18699119..18710027 |
Exon number |
4 |
Exons |
18699119..18700981,18702125..18702256,18707451..18707579,18708854..18710027 |
Genome context |
|
Sequence |
000001 cataactttt attagattat gttgttataa ttgttctatt tttatttctt attaatctct tactgtgcat tatttataaa 000080 000081 ttaagcatta tcataggtat gtacttacag gaaaaaatat agcatatata aggtttggta ttaaccacaa tttgaggcat 000160 000161 ctgctggggg tcttggaatg tatcccctgc agataaggga ggactactat actttatgaa tttattaatg gtaagatcta 000240 000241 gtggcaggtc taataactac tttcaaagca gtggtgagcg taaacaatat gttaagataa ctgcagcaag tatagtacaa 000320 000321 aatgaaaaat gtctgtggtt tctattgtgt cagggtgttt ttaattttac ctatattcat agtttgttgt ctacattcat 000400 000401 aatttaatga tatgctaact actttcaaag cagtggtgag cataaatagt attttgaggc cgtgcgtggt ggcttacgcc 000480 000481 tgtaatccca gcactttggg aggccaaggc gggtgaatca ctgaggttgg gagttcgaga ccagcctgac caacatggag 000560 000561 aaaccccatc tctactaaaa atacaaaatt agctgggcat gatggcgcat gcctgtaatc cctgctactt gggaggctga 000640 000641 ggcaggagaa tcgtttgaac ccgggaggca gaggttgcgg tgagctgaga tcgccccgtt gcatgccagc ctgggcaaca 000720 000721 agagcgaaac tctgtctcaa aaacaaaaaa caaaaccaaa caaaaaacaa aactacaata ttttgaggta actgcagcaa 000800 000801 atatagtaca aaataaaaaa atgcctgtga tttctattgt gtcagggtgt ttttaatttt acctacattc atagtttgtt 000880 000881 gtctacattc ataatttaaa gatatgctaa attttagcca gaggttaatg aaaatgaagg taacattttt ttttaaccca 000960 000961 tcgaggttca cagaaccact gaatctatta gtggacacca ttaattaaac atccatgGTA CTgttgattc ttatttatct 001040 001041 tttatatttc attccaaatg ttgactcctc agagagtcat tttctgatac ccagactaga tccaatttcc ctgttatact 001120 001121 cttcaagcat ctcacacttt tcccttgcag gacttaactc agttggtaat ggtacatttg tgcattggtt gtctgcctct 001200 001201 cttcacctct ttccctgagg aaggagttgg tatctgttag tcactgttgt attaccagca catagtagat gctcagtaaa 001280 001281 tatttgttga gtaaataaaG ATTAGGAAAG CTATCAAACT AATTTATTAC CTTAGTAAGT AGGAAAAGAG CTTGGTAACT 001360 001361 TGAGAGACTG ACTGAAGGCC AGTGTCTATA ATCATTTTCA GGGATATGTA GTTGTAAAAT ACATGTAGCT ATAGTCAGGA 001440 001441 TGTAAAGTAG GTCACAGTAA CCAAATAGCA AGGGGTTTAG GGAAAATTAG GGAACTGGAG AAAGGGCAAA TTGTTCATGA 001520 001521 GGGAAAAGAG AAGGTGTAAT GTTTATGGGT GGACTTGTTG CTTGCTCTGT CACCTCTACC CCTATTAGTC CTGCCATTAC 001600 001601 CATTTTACTT AATCACTTAG CCAGGCCTGA TACATAGTAG TCTTTGCTAA CTGGATATTA TGGAGGTAAA GCTGAAGGTT 001680 001681 TTTGTTTGTG AAATGTTACA CTAAGATAGG AGCTTGTGAT AGATCTTTAA ATAATGCTTT TAAAATGTGC CTGTTTATAT 001760 001761 TAATCTTCAC CAGAATGTCA CAGGTAGACT AATGGTTGGC CTACGTTGGT GGAATCACAT TGATGAAGAT GGAAAGAGCC 001840 001841 ATTGGGTGTT TGAATCTAGA AAGGAGTCCT CTCAAGAGAA TAAAACTGTG TCAGAGGCTG AATCAAGAAT CTTTTGGTTG 001920 001921 GGACTTATTG CCTGTCC |