Lnc-SLITRK5-1:1

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Transcriptomic Nomeclature

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Function

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Regulation

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Expression

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Allelic Information and Variation

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Evolution

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Labs working on this lncRNA

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References

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Basic Information

Transcript ID	lnc-SLITRK5-1:1
Source	LNCipedia2.1
Same with	NONHSAT034595
Classification	intergenic
Length	4483 nt
Genomic location	chr13+:88333940..88340538
Exon number	2
Exons	88333940..88338375,88340492..88340538
Genome context
Sequence	000001 AAAAAATAAA CATATTCCAA GAAAATGTAG ATAATTTGAA TGCTAATATA AAAAATCATT TACAGCTAAA CTATTGATTG 000080 000081 AAGTTGTAAG TTAAACCACC TTAGCATAGA TAGCCGACTT GGAACATGTC TTCTGTTTAG TGAAGATTAT CACCTTTACA 000160 000161 CATGAAAAGT GGAAATTTTT GACAAATTTC CTGGGAACTC AAGTCTGTTC CTCACCACTG TTTCCTCAAT ACTAGTAAGA 000240 000241 AAATCAAACT AGTTTGTAAT GAGAACATCC ACACGTACTG TGAAAAAAGT TACCATTTAA GAATTTAATC CAAGATCGCA 000320 000321 GTTTCTGGCC TTAGGTATTA GTTATATTTG TGTTACTACC TTGTTTTGTT GGCAAAATAT TCAAATTAAT ATTCATTATT 000400 000401 TTCTTTTTCT ATTCTATTAT TTCTTGTTTC CTTACATCTG CTCCTTCCCT CCTTTCTCTT TTTTATCTTT TTTCTTCATT 000480 000481 ATTTTTCAAT AAGGCAAGGG AAAGAGTGAA CATAGTTTAG TCCTAGTTTG AAATGCCAAA ATCTGGCTAT TTAATTTGAA 000560 000561 GAGTTCCATC GATGGTTCCC AAAGTCACAT GACTCCAGAT TAATGATAAC ATAGCAAATC ACAAATATTC TGTCAATTCA 000640 000641 TTTGGAAATG TGCTCTTCTT GCACTTTTCA GATGGCTCCA ATTTAAGATA TTTGCAGGCA TGGCAAGATA CCTGGAATGA 000720 000721 CTACTTTTAA GAATAAATTT TACACTAAGA AAAAGGAACT AGGAACATCA AAGCAACAGA 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GTTTCATGCA TGAAAAGTTC ATCGGTGATA TGCAGACTAC AGTTTTAAAT ATTAAATTTA 002400 002401 AAAATTGATA TATAAAAATG AAAACTTGAC CAATAAATAT ATCTCACCTG TAATAATATA TTTACATAAA TTATCCACAC 002480 002481 AAAAAATATG CCTTTTAACT TTATAAACAT AGAATATTTT TTGCTATATT AACATCCAAA GTCAAAAGGG TGTATCACTC 002560 002561 TGAAAATTCT AATAATAGTG AAAGACTTAT AGCTATCAAA TTTATTTAAA TCCTCTGTTT TAATATCTAC TTTAAATTTT 002640 002641 CACTTCAAAA TATAAAGTTA ATGGTATATA TTTTTTTTTA TATAGCTGAA ATCTGCCCTT GCTAAAGTTT CATAAGATAT 002720 002721 ACAATACACA TAATAGGGTT CCTTCACAGT TTTATTTTTG TTTAGCATTT AGGTACCATA TATTAAAATA TGAAGCTATA 002800 002801 AATTTCCACT AGTTAAGTTA TAATTATGTT TTTTCAAACA ATATACCTCA ATTATATAAT CATCCCAATT TTTTAAAGCT 002880 002881 AGTGACCATG AGCATATATA TGGGTGCATC CAAATGAGAA TATTGAGATC CAGAAATTAC TAATTTTAGA GAATATTCAA 002960 002961 AATCATTCAC CAGACTGTCA TTTAAACCCA TTCAATCAGT ATAATGATAT ATTTGTTACC CAATTATGAT GAAAGATCCC 003040 003041 TAATTCTTAG ATGAAAATGT AGTATTTCAC TGGAAATTCG TTTTTTGAAT GTTAAACCAT AATTATTGAG TATCCAGATT 003120 003121 ATAAATTTTA AATATCCTCT CCAAGATTTT ATATATATAA TTTATATATA TATACAGAAA ATTAAAGAGG GTCTTTCTAT 003200 003201 AAAAGTAAGC ATTTTAGGAA ATCACTAATT TCATATGGCT TTCACTATGT TTGACTTGTA ATTTAACAAC AAATTTCATC 003280 003281 TTCCTTTAAG AATTTTTACC CCAGAGAAGG TATTTGTTTG CATAGCATGT ACTTGAGTCA TCCGTTGTCC TATTATTGGT 003360 003361 TTTGGCCTAG TCTCTTCATT TAGAAGCTCT GTGCCCAAGG TCAGACACAT GGAAAATGGT CTCTATCATT GCCTTTAATT 003440 003441 CTCACAACTG AATCATTCTA CCACTGTCCC CTACCTCTCT GTTATTTTTT GAAAGAAAAA AAAAAGAAGG TGATATATCT 003520 003521 CTTTATTTTG CTAACAAAAG AATTTTAAGA ATATCCTAAG GCAAATTCAT GACATCCCCC ACATTATTAA AATAAAAATA 003600 003601 TGACTCAATT TCTAACATGG CAATCAAGAA CTATGTAAGC AGGACTTAGT GTGAATAAGG GGATGGGGAT TTTAAATTGT 003680 003681 TACTATGAAT TTGTGATTCA TTAGTAATTT TAAATACACA ACATCTAAAA CATAAAGGTG GCAATTTCTT TTTTAGTATA 003760 003761 TTTTAAATTA CACACTTTTG TTGACAGGGT AGGTAATATA GTTTACAAAA TGCCACTATT GCCTGCTTAC AAACATTAAG 003840 003841 AAACTTGGTT GCCGACTGAT GACTCATGTG GTAACTCCTG AACAATCTGT TTTATTTGAT CAGATCAGCT 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