Difference between revisions of "NONHSAT069200"

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Latest revision as of 23:11, 16 October 2014

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Evolution

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Labs working on this lncRNA

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References

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Basic Information

Transcript ID

NONHSAT069200

Source

NONCODE4.0

Same with

,

Classification

sense

Length

5432 nt

Genomic location

chr2+:11956279..11966639

Exon number

3

Exons

11956279..11959724,11960537..11960640,11964758..11966639

Genome context

Sequence
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005041 TTCGAAGCAT TATTTTTTTA AAGAGTGTTT TACTCCAACG ATTGAAACAT TTTCCTATTT AAATTTCATT GTTAGAATCA 005120
005121 CAGGAGGCAA AAAATGGAAC GGTTGAATGA AATTTTACTC TTTCTGTGAA AGAAAATCCA CAGAGTTGTT GCCTCCGTTG 005200
005201 TAGTTGGTGG GCCCCGTTAG CATTGGATGC CTTTGCCAAA TGGTTCATGT GGACACACAA AGGCAAACAG ATCTGCCATC 005280
005281 GATCGCAGAT TTCTGTAGAA ACACGGATGT GCATGTGCAG ATTCCCTTTT GCAGGtatta aaaataatta aaaataGTCC 005360
005361 TGCCTgaggt tgcagtgagc cgagcttgca ctactgcact ccagcctggg tgacagagta agactccatg tc
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Predicted Small Protein

Name NONHSAT069200_smProtein_1097:1279
Length 61
Molecular weight 6422.3285
Aromaticity 0.116666666667
Instability index 44.7066666667
Isoelectric point 8.97943115234
Runs 7
Runs residual 0.0330673758865
Runs probability 0.0329447094152
Amino acid sequence MKEGKVVGGYACGAVGKNKPSAQDGDHLAFVRSAANVFSQFIAFNENKLSFMSLNVLFPL
Secondary structure LLLLEEEELLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEEEEELLL
PRMN -
PiMo -