Difference between revisions of "NONHSAT115288"
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Latest revision as of 02:03, 17 October 2014
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Contents
Annotated Information
Transcriptomic Nomeclature
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Function
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Regulation
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Expression
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Allelic Information and Variation
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Evolution
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Labs working on this lncRNA
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References
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Basic Information
| Transcript ID |
NONHSAT115288 |
| Source |
NONCODE4.0 |
| Same with |
, |
| Classification |
intergenic |
| Length |
2630 nt |
| Genomic location |
chr6-:141128740..141219567 |
| Exon number |
9 |
| Exons |
141128740..141128958,141137269..141138214,141167095..141167471,141173956..141174059,141184950..141184976,141184986..141185033,141185039..141185580,141216940..141217067,141219325..141219567 |
| Genome context |
|
| Sequence |
000001 CTCTTCCTGT GTGGAAGCTG GGATTCCAAT GGCAGGCAGG AAATCTTGTA GTAGGTGATC GTGGCCTTCC TTGGGATCCC 000080
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Predicted Small Protein
| Name | NONHSAT115288_smProtein_1154:1393 |
| Length | 80 |
| Molecular weight | 8835.1777 |
| Aromaticity | 0.0886075949367 |
| Instability index | 45.0582278481 |
| Isoelectric point | 10.6513061523 |
| Runs | 11 |
| Runs residual | 0.00104040228889 |
| Runs probability | 0.0383886560358 |
| Amino acid sequence | MISAQCNLRLLGSSSSPRSASASRVAGITGTRHHAWLMLVRLARTPDLKRSTCFGLPKCS DYRHELPHPASKYFFFKSK |
| Secondary structure | LLLHHHLHHHLLLLLLLLLLLHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLL LLLLLLLLLLLLLEEEELL |
| PRMN | - |
| PiMo | - |
