Difference between revisions of "NONHSAT095745"
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Revision as of 13:41, 13 October 2014
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Name
UM9-5
Characteristics
Found in an intron of KCNIP4 in the sense direction. ~2.3kb clones were identified in pig and human. NCRNA00099 which contains UM9-5 is ~10kb. Given it's position in an intron the full length of the transcript is somewhat unclear, cloning gave shorter transcripts, while transcription could be detected over whole NCRNA00099 site (but not outside it) in human. Transcript contains a number of repeats.
Function
Please input function information here.
Expression
Identified as a RNA that is more highly expressed in adult brain than fetal brain. Expression in human and pig was similar. Mostly restricted to adult brain, highest expression in cerebellum. Low expression was also detected in porcine embryonic tissues.
Conservation
Transcripts identified in pig and human. Southern blotting also could identify a homologous sequence in cow but not in rodents.
Misc
KCNIP4 is a voltage-gated potassium (Kv) channel-interacting protein which is expressed in brain. UM9-5 accessions: AY072607, AY072608, AY072609, AY072610 and AY072611.
Transcriptomic Nomeclature
Please input transcriptomic nomeclature information here.
Regulation
Please input regulation information here.
Allelic Information and Variation
Please input allelic information and variation information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this lncRNA
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Basic Information
Transcript ID |
NONHSAT095745 |
Source |
NONCODE4.0 |
Same with |
, |
Classification |
intergenic |
Length |
9848 nt |
Genomic location |
chr4-:21844964..21854811 |
Exon number |
1 |
Exons |
21844964..21854811 |
Genome context |
|
Sequence |
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