Difference between revisions of "Lnc-REL-1:1"
(Created page with "Please input one-sentence summary here.
==Annotated Information==
===Transcriptomic Nomeclature===
Please input transcriptomic nomeclature information here.
===Functio...") |
|||
| Line 42: | Line 42: | ||
sequence = <dnaseq>ATTTATCTATTGATTGATTGATGCATAGGTTGATGCCATATCTTGGCTATTATGAATAATGCTGCAGAGACCATGGGAGTCAGATATCTCTTCAACATACTGATTTTATTTCCTTGGGATACATATACCTAAATAGTAGGATTGCTGGATCATGTGGTAGTTCTATTTTAAATTTTGTTTTCTGTTTATATTCCCACCAACAGTGTGCCAGAAGTTCTCTTTACTCCGTATCCTTGCCAACACTTGTTGTCTTTCATCTTTTTTGGTAATAGCCATTCTAATAGTTTTGAGGCGGTGCCTCACTGTGGTTTTAAATTTGCATTTTCCTGGTAAGTGATGGTAAGCATTTGCATGTCTTAAACCTGTTGGCCATTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATGTCTACTCAGGTCCTTTCCCCATCTTTTAATCAGGCTGTTTTCTTGGTATTGAGTTGTTGGAGTTCGTTGTATATTTTGGATATTAACCCCTCATTAGATGTATGGCTTATAAATATTTTATTCCATTCCATAAGTTGTCTCTTCACTCTGTTGATAGTTTCCTTTGCAGTGCAGAAGCTTTTGTTTGATATAGTCCCATTTGATTTGTCTTTTTTTTGTTGTTGTTACCTGTGCTTTTAGGGTCATATTCAAATAATTGCCCAGACCAGTGTCATGGAGCTTTTTCTCTACGTTTTCTTCTAATAGTTTACAGTTTTGGGTCTTAGATTTAGGTCACTGTCAGTTGAGTTTTTAATATGGTGTGAGATAAGGGTCTAACTTCATTATTCTGTATGTGGATATCCAGTTGTCCCAGCACAATTTATTAAAGGGACTGTCTTTTCCCATTAAGTTTCTTCACACGTTTGTAAAAAATCAGCTGGCTGTAAATATATGGATTTATTCCTGGGCTCTCTTTCCTATTCTTTTGGTTTAAGTGTCTGTTTTTATGCCAGTACAAAAATGTTTTGATTACTATGGCTTTGTAGTAATTTTGAAATCAGGTATTGTGATATCTCTAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGCTTTGGCTATTCAGGGTCTTTAGTGGTTCCATATGAATTTTAGGATTGTTTTTTCGATTTCTGTGGAAAATATCATTGGAATTTTGACAGGGATTGCACTGAATCTTTAGATCACTTTGGTTAGTATGGACATTTTAGCAATATTAAGTCTTCCAATCTATGAATGTGGGATATTTTTGCATTTATTTGTGACTTTAATTTCTTATGTCAATGTTTTACAGTTTTCAGTGTAGAGATATTTTACCTTCTTGGTTAAATTTATTCCTAAGTATTTTATATTTTGTGACACTACTGCTTGTTGTATATTGATATGCCTGCAACTTTACTGAATTTGTTTATTAGTTCTAACAGTCTTTTTGGTGGATTCTTTCAGCTTTTCTATATATAAAATCATCACTTGCAAACAGGGACAGTCTCCTTCCTTTCCAATTTGGATGCCTTTTACTTCTTTCTCTTGCCTAATCGCTCTGGCTAGGACTTCCAGTTCCAGTACTATGTTAAACAGAAATGAAAGTGGAAGTCCTTGGATTATTCCTGATCTTAGAGGAAAAGCTTTCAGTTTTTCACTGTTGAGTATGGTGTTAGCTGTGGGTTTGTCACATATGGCCTTTACTTTTGAAGTACACTCCTTCTACTCCTAATTCATTGAGAGCTTTTATCATGAAAGGATGTTAAATTTTGTCAAATACTTGATCGTGTGGTTTTTGTCCTTCATTCTGTTAATGTGGTGTATTATATTTATAGATTGGCATATGTTGAACCATCTGTGAATCCCTGACATAAATCTCACTTGGTCATGGTGATTAATCTTTTCAGAGTGCTGTTGAATTTGTTTATTAGTATTTTGTTGAAAATTTTTGCATCTTGACCAGGCACCGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCACTTCAGGAGGTCAAGGCCTGAGGATGGTCTCGAACTCCTGCACTTAAGCAATCCTCCCACCTAAACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGATGTGAGCCACCGTGTCTGGCCGTAGTTCTTTAAATGTTCGATAGCATTCAGCAGTGAAGCCGTCTGGTTCTGGTCTTTTCTTTGATGAGGGAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTGAGTCTCGCTCTCTCACCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCTGCTCACTGCAACCTCTGTCTTCTGGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCAACATGTTGGACAGGATGGTTTTGATCTCTTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAATGTGCTGGGATTACTGATGTGATCTCCTTTTTTTTTCAAGGCTTAACATGTAATTTAACAAGTTGATGCTGCATTGCTGCTCCATTTCTCAGAAAAACTTCAAATTTAAAGTATCAGCAACAAATCAAACATAGTACATCAATTAAATATGCACAGCATAACTACTATCTAAGATAGGCAAGGCTAAGAGCTACTCTCAGACCTTCAGCATACAGCAACTCTGTTTCCAAGATTGTACTAGGCCTATCAAGAAAAGTTGTGAACAGCAACATCATAGACACAAAACGGCCATTCCTGGTTGTCCTTATCCAAGAAAAAGATTGAGGCAAGTTAACACAAGATTTTTAAAAAAGATACACTGAAATGAAAGTCTCTAAGAGAAAATGTCTTCCTTAGGACAAGAAGGGATAATATATCGGATATAAAAGAACTATACGTAC</dnaseq>| | sequence = <dnaseq>ATTTATCTATTGATTGATTGATGCATAGGTTGATGCCATATCTTGGCTATTATGAATAATGCTGCAGAGACCATGGGAGTCAGATATCTCTTCAACATACTGATTTTATTTCCTTGGGATACATATACCTAAATAGTAGGATTGCTGGATCATGTGGTAGTTCTATTTTAAATTTTGTTTTCTGTTTATATTCCCACCAACAGTGTGCCAGAAGTTCTCTTTACTCCGTATCCTTGCCAACACTTGTTGTCTTTCATCTTTTTTGGTAATAGCCATTCTAATAGTTTTGAGGCGGTGCCTCACTGTGGTTTTAAATTTGCATTTTCCTGGTAAGTGATGGTAAGCATTTGCATGTCTTAAACCTGTTGGCCATTTGTATGTCTTCTTTTGAGAAATGTCTACTCAGGTCCTTTCCCCATCTTTTAATCAGGCTGTTTTCTTGGTATTGAGTTGTTGGAGTTCGTTGTATATTTTGGATATTAACCCCTCATTAGATGTATGGCTTATAAATATTTTATTCCATTCCATAAGTTGTCTCTTCACTCTGTTGATAGTTTCCTTTGCAGTGCAGAAGCTTTTGTTTGATATAGTCCCATTTGATTTGTCTTTTTTTTGTTGTTGTTACCTGTGCTTTTAGGGTCATATTCAAATAATTGCCCAGACCAGTGTCATGGAGCTTTTTCTCTACGTTTTCTTCTAATAGTTTACAGTTTTGGGTCTTAGATTTAGGTCACTGTCAGTTGAGTTTTTAATATGGTGTGAGATAAGGGTCTAACTTCATTATTCTGTATGTGGATATCCAGTTGTCCCAGCACAATTTATTAAAGGGACTGTCTTTTCCCATTAAGTTTCTTCACACGTTTGTAAAAAATCAGCTGGCTGTAAATATATGGATTTATTCCTGGGCTCTCTTTCCTATTCTTTTGGTTTAAGTGTCTGTTTTTATGCCAGTACAAAAATGTTTTGATTACTATGGCTTTGTAGTAATTTTGAAATCAGGTATTGTGATATCTCTAGCTTTGTTCTTTTTGCTCAAGATTGCTTTGGCTATTCAGGGTCTTTAGTGGTTCCATATGAATTTTAGGATTGTTTTTTCGATTTCTGTGGAAAATATCATTGGAATTTTGACAGGGATTGCACTGAATCTTTAGATCACTTTGGTTAGTATGGACATTTTAGCAATATTAAGTCTTCCAATCTATGAATGTGGGATATTTTTGCATTTATTTGTGACTTTAATTTCTTATGTCAATGTTTTACAGTTTTCAGTGTAGAGATATTTTACCTTCTTGGTTAAATTTATTCCTAAGTATTTTATATTTTGTGACACTACTGCTTGTTGTATATTGATATGCCTGCAACTTTACTGAATTTGTTTATTAGTTCTAACAGTCTTTTTGGTGGATTCTTTCAGCTTTTCTATATATAAAATCATCACTTGCAAACAGGGACAGTCTCCTTCCTTTCCAATTTGGATGCCTTTTACTTCTTTCTCTTGCCTAATCGCTCTGGCTAGGACTTCCAGTTCCAGTACTATGTTAAACAGAAATGAAAGTGGAAGTCCTTGGATTATTCCTGATCTTAGAGGAAAAGCTTTCAGTTTTTCACTGTTGAGTATGGTGTTAGCTGTGGGTTTGTCACATATGGCCTTTACTTTTGAAGTACACTCCTTCTACTCCTAATTCATTGAGAGCTTTTATCATGAAAGGATGTTAAATTTTGTCAAATACTTGATCGTGTGGTTTTTGTCCTTCATTCTGTTAATGTGGTGTATTATATTTATAGATTGGCATATGTTGAACCATCTGTGAATCCCTGACATAAATCTCACTTGGTCATGGTGATTAATCTTTTCAGAGTGCTGTTGAATTTGTTTATTAGTATTTTGTTGAAAATTTTTGCATCTTGACCAGGCACCGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCACTTCAGGAGGTCAAGGCCTGAGGATGGTCTCGAACTCCTGCACTTAAGCAATCCTCCCACCTAAACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGATGTGAGCCACCGTGTCTGGCCGTAGTTCTTTAAATGTTCGATAGCATTCAGCAGTGAAGCCGTCTGGTTCTGGTCTTTTCTTTGATGAGGGAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTGAGTCTCGCTCTCTCACCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCTGCTCACTGCAACCTCTGTCTTCTGGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCAACATGTTGGACAGGATGGTTTTGATCTCTTGACCTCGTGATCTGCCTGCCTCGGCCTCCCAATGTGCTGGGATTACTGATGTGATCTCCTTTTTTTTTCAAGGCTTAACATGTAATTTAACAAGTTGATGCTGCATTGCTGCTCCATTTCTCAGAAAAACTTCAAATTTAAAGTATCAGCAACAAATCAAACATAGTACATCAATTAAATATGCACAGCATAACTACTATCTAAGATAGGCAAGGCTAAGAGCTACTCTCAGACCTTCAGCATACAGCAACTCTGTTTCCAAGATTGTACTAGGCCTATCAAGAAAAGTTGTGAACAGCAACATCATAGACACAAAACGGCCATTCCTGGTTGTCCTTATCCAAGAAAAAGATTGAGGCAAGTTAACACAAGATTTTTAAAAAAGATACACTGAAATGAAAGTCTCTAAGAGAAAATGTCTTCCTTAGGACAAGAAGGGATAATATATCGGATATAAAAGAACTATACGTAC</dnaseq>| | ||
}} | }} | ||
| − | [[Category:Intergenic]] | + | [[Category:Intergenic]][[Category:lnc-REL-1]] |
Revision as of 13:43, 13 October 2014
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Transcriptomic Nomeclature
Please input transcriptomic nomeclature information here.
Function
Please input function information here.
Regulation
Please input regulation information here.
Expression
Please input expression information here.
Allelic Information and Variation
Please input allelic information and variation information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this lncRNA
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Basic Information
| Transcript ID |
lnc-REL-1:1 |
| Source |
LNCipedia2.1 |
| Same with |
NONHSAT070917 |
| Classification |
intergenic |
| Length |
2828 nt |
| Genomic location |
chr2+:61159963..61163467 |
| Exon number |
2 |
| Exons |
61159963..61161931,61162609..61163467 |
| Genome context |
|
| Sequence |
000001 ATTTATCTAT TGATTGATTG ATGCATAGGT TGATGCCATA TCTTGGCTAT TATGAATAAT GCTGCAGAGA CCATGGGAGT 000080 000081 CAGATATCTC TTCAACATAC TGATTTTATT TCCTTGGGAT ACATATACCT AAATAGTAGG ATTGCTGGAT CATGTGGTAG 000160 000161 TTCTATTTTA AATTTTGTTT TCTGTTTATA TTCCCACCAA CAGTGTGCCA GAAGTTCTCT TTACTCCGTA TCCTTGCCAA 000240 000241 CACTTGTTGT CTTTCATCTT TTTTGGTAAT AGCCATTCTA ATAGTTTTGA GGCGGTGCCT CACTGTGGTT TTAAATTTGC 000320 000321 ATTTTCCTGG TAAGTGATGG TAAGCATTTG CATGTCTTAA ACCTGTTGGC CATTTGTATG TCTTCTTTTG AGAAATGTCT 000400 000401 ACTCAGGTCC TTTCCCCATC TTTTAATCAG GCTGTTTTCT TGGTATTGAG TTGTTGGAGT TCGTTGTATA TTTTGGATAT 000480 000481 TAACCCCTCA TTAGATGTAT GGCTTATAAA TATTTTATTC CATTCCATAA GTTGTCTCTT CACTCTGTTG ATAGTTTCCT 000560 000561 TTGCAGTGCA GAAGCTTTTG TTTGATATAG TCCCATTTGA TTTGTCTTTT TTTTGTTGTT GTTACCTGTG CTTTTAGGGT 000640 000641 CATATTCAAA TAATTGCCCA GACCAGTGTC ATGGAGCTTT TTCTCTACGT TTTCTTCTAA TAGTTTACAG TTTTGGGTCT 000720 000721 TAGATTTAGG TCACTGTCAG TTGAGTTTTT AATATGGTGT GAGATAAGGG TCTAACTTCA TTATTCTGTA TGTGGATATC 000800 000801 CAGTTGTCCC AGCACAATTT ATTAAAGGGA CTGTCTTTTC CCATTAAGTT TCTTCACACG TTTGTAAAAA ATCAGCTGGC 000880 000881 TGTAAATATA TGGATTTATT CCTGGGCTCT CTTTCCTATT CTTTTGGTTT AAGTGTCTGT TTTTATGCCA GTACAAAAAT 000960 000961 GTTTTGATTA CTATGGCTTT GTAGTAATTT TGAAATCAGG TATTGTGATA TCTCTAGCTT TGTTCTTTTT GCTCAAGATT 001040 001041 GCTTTGGCTA TTCAGGGTCT TTAGTGGTTC CATATGAATT TTAGGATTGT TTTTTCGATT TCTGTGGAAA ATATCATTGG 001120 001121 AATTTTGACA GGGATTGCAC TGAATCTTTA GATCACTTTG GTTAGTATGG ACATTTTAGC AATATTAAGT CTTCCAATCT 001200 001201 ATGAATGTGG GATATTTTTG CATTTATTTG TGACTTTAAT TTCTTATGTC AATGTTTTAC AGTTTTCAGT GTAGAGATAT 001280 001281 TTTACCTTCT TGGTTAAATT TATTCCTAAG TATTTTATAT TTTGTGACAC TACTGCTTGT TGTATATTGA TATGCCTGCA 001360 001361 ACTTTACTGA ATTTGTTTAT TAGTTCTAAC AGTCTTTTTG GTGGATTCTT TCAGCTTTTC TATATATAAA ATCATCACTT 001440 001441 GCAAACAGGG ACAGTCTCCT TCCTTTCCAA TTTGGATGCC TTTTACTTCT TTCTCTTGCC TAATCGCTCT GGCTAGGACT 001520 001521 TCCAGTTCCA GTACTATGTT AAACAGAAAT GAAAGTGGAA GTCCTTGGAT TATTCCTGAT CTTAGAGGAA AAGCTTTCAG 001600 001601 TTTTTCACTG TTGAGTATGG TGTTAGCTGT GGGTTTGTCA CATATGGCCT TTACTTTTGA AGTACACTCC TTCTACTCCT 001680 001681 AATTCATTGA GAGCTTTTAT CATGAAAGGA TGTTAAATTT TGTCAAATAC TTGATCGTGT GGTTTTTGTC CTTCATTCTG 001760 001761 TTAATGTGGT GTATTATATT TATAGATTGG CATATGTTGA ACCATCTGTG AATCCCTGAC ATAAATCTCA CTTGGTCATG 001840 001841 GTGATTAATC TTTTCAGAGT GCTGTTGAAT TTGTTTATTA GTATTTTGTT GAAAATTTTT GCATCTTGAC CAGGCACCGT 001920 001921 GGCTCACGCT TGTAATCCCA GCACTTCAGG AGGTCAAGGC CT |