Difference between revisions of "NONHSAT094018"

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Latest revision as of 00:49, 17 October 2014

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Annotated Information

Transcriptomic Nomeclature

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Function

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Regulation

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Expression

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Allelic Information and Variation

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Evolution

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Labs working on this lncRNA

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References

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Basic Information

Transcript ID

NONHSAT094018

Source

NONCODE4.0

Same with

,

Classification

sense

Length

3660 nt

Genomic location

chr3+:193409183..193415315

Exon number

2

Exons

193409183..193409921,193412395..193415315

Genome context

Sequence
000001 TAATGTAAAT CTACCTCTAG TGGCTCTGGT ATTTTTAAAC TTATTTATAG CTGGCAAAGT ACTTTTTTGT ATGTATTTTT 000080
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003281 AAGATAAAAT CTTTAGTTAA TAATTTTGTA TTTATTTATT CTAGATGTAT GTATCTGAGG AAAGAAATCT GGTATTTTTG 003360
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003601 TGCCTGAGCT TGATCAAAGG TCATTTGTGT AGATGAGTAA TTAAAAAATA TTTAAATCAC
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Predicted Small Protein

Name NONHSAT094018_smProtein_392:640
Length 83
Molecular weight 9687.3798
Aromaticity 0.158536585366
Instability index 44.9548780488
Isoelectric point 9.34283447266
Runs 13
Runs residual 0.0226348854398
Runs probability 0.0609432962375
Amino acid sequence MYLIHAFFHVKSPEFLLDPQRGQSVSPPTSKKCLRPTTIIHLDFIWVKGGMVRLIFFFFP
QIVKYTNHLVNNYLLICDTFEK
Secondary structure LEEEEEEEEELLLLEELLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEEEEEEELLLLEEEEEEELH
HHHHHHHHHHLLEEEEELLLLL
PRMN LLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLL
PiMo iiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTToooooooooooooooooo