Difference between revisions of "NONHSAT132727"
Line 42: | Line 42: | ||
sequence = <dnaseq>cactgcactccagcttgggtgacagtgcgagactccatctcaaaaaaaaaaaaaaaagaaaTTGTACTATCCAAGTTCATAAAACCATCCTAATTCCaaaaaaaaaaaaaagcaatcagaggctgaagtggaagcatggcccctgatgaataagaggcatttctcgtttgtgatgtaggggagagggggttttgtagagggaggagcctctggcctcttgtcacttgggcatgcagaggtggggttttcctttcagcccagttcgaagaagaaagccatgggttggccttaggctccttgtctccagaccctattctcctgcctcaGCTGAAGCTGATGTGTCTCTGATTCCAAAGCCTGAAAAATTTTCGTTATATTATACCAGCTTTGTTACTGAAAAGAACATTCAGGAATGTAGTTAATAACCACTGGTGTTCAAggacctgttttaattaataaaaatgatttacattaaacattaaattttaatttaaaataaatgcatttgaggcattgaaaataatttgttttctaaatatgacattcccacaagttttatacattatgaattgcctttaaatattctccctcttctagtccttagacactgaggagtatatgtcaacccatttgacaaggttcaaattaatgcatttcctgaattatccaatctaaattaatgaggttGTTCATATGGACCACAATAATTTCAGCAATTTCttctattttttttaatctgtgctgtggtttaaatcttttctcttgacctgtcttttaattcactatccctattttctggtgtgtttaatctgctgttaaatccatttattgagttcttaattgtggatattgtatttttcaagccaataactgccatttgattattccatatagatttcagctctccagtaaaataatttatcttctgctctattttcttcaacatagtaatcacagctattctaaagtcattgtctaataattctaatacctagttctccagtgagattgtttacattatcttttttatttttggtcttgggttttggttgtatagtcctatcatatcacaagacaagtcacttttgattggataatggacattgtttacaacaattgtaaaagctttggatgatgttatcattttcatcgaagttcattcttttctttgctagacaaagtgagagcaaatcctcttaactcaaggattgaaccaagtcaaggctggatgacttttagctaatgctcagtccatttctagcttgctattttacctatggttttgtgccccaggactttcagctgagaacataatttgttcaccatgaccccaaacccttgaaggtcctgaaatctaccttctgtgttctgtgaagctgaaaaattctgatctgcatttcagatgttttcagatattatttatggtcttctgcacagtgaaattttcaaatgtggaaaatgtcttgggaagaaaaatgatgtggttttgaaaatcctcaagaatctggttttgtctcttcggccagcttagactgacaaatggtatgatgcctttgtcctccagaaaggcccttatcctgggcaaagcttacctgttctcagccccttgtctgtgcccagaacaagcaagttctgggaacactggttacaggttgtcatctgctgacctctctattgctagatcctctctggaatcttagaccctgtatcctgatttcttcagtagctcaccgatgcctttaaatttagaagttttacattttgtctggatttttttgttatgtaaaagatcattagcctacagaaaactactccatcttatccaggtccagaagtcTCACATCTGTGGGCTCCTAAACAAGAGATTGATAGAATAAAATTTCTATTTGCCAGATGGATAAAAGAAAAGAAACTGGGCAAGATGCAACAGACCTTAACCATGTTGGCAGAGGCAGGAATTAACAGAAACATAGAACTCTGATAATGTTATTttcaatctttataacacctccaaggtagatattcttggcctccctttacaaatTAATTTACAAGATGTACATTATTGTATTTACTATCCCCAAAGCCTAGGTATCTTCTGTGTGGTATAgtggagctttgtccaaagtagctctgacatcactaagcctcaattactcggtctgtcaaatgagaataataatatttgtttcataattctgaccattgaaataaatacatatgaaagcaactcattaattacaaagagatatatattttaagggCAACTGGGATACATAAAAATGAATGTTATAAAGGGAGGCAttttgttgtttttctttttcttttaaaaaagagatagggtctcactgtgttaactaggctggtcttgaactcctgacctcaagccatcttcttggctcggcctcccaaagcactgggattataggGGGAAGAAGGGTCTTTAAAAAAAAAGTtcacagatccctggaaacaagaggcacaccacaccacacagggctacccagggaactaccagcatcagtcaggagacgagggagcaaggggaaaatgtagctaacagtctttattgtgatttcccagggaaggaacaagcaatgcagggttaacagatttagaattggcaagtttggataattttggcaggcactaggggcattgggccctttcctagttgtcaggaacctggccttcagatgattagggcagcaggatagtgggtcagagtgtgagagcctaataaactaggtggttaggggtatggactctgggtggtttggtttacaaatgacagatgcattgcctggaaaattgtttgccatctttaggaataggctaaccctaaaggaggtagtccctccagggtcaactagcctccaagatgcccaagcatccaaacacagcaaaaaaagacatgattaagacaGTATAGAAATATAAGTGGCAGTTATCTTTCTTAAGTACCAATATTCTACTAATTCTGA</dnaseq>| | sequence = <dnaseq>cactgcactccagcttgggtgacagtgcgagactccatctcaaaaaaaaaaaaaaaagaaaTTGTACTATCCAAGTTCATAAAACCATCCTAATTCCaaaaaaaaaaaaaagcaatcagaggctgaagtggaagcatggcccctgatgaataagaggcatttctcgtttgtgatgtaggggagagggggttttgtagagggaggagcctctggcctcttgtcacttgggcatgcagaggtggggttttcctttcagcccagttcgaagaagaaagccatgggttggccttaggctccttgtctccagaccctattctcctgcctcaGCTGAAGCTGATGTGTCTCTGATTCCAAAGCCTGAAAAATTTTCGTTATATTATACCAGCTTTGTTACTGAAAAGAACATTCAGGAATGTAGTTAATAACCACTGGTGTTCAAggacctgttttaattaataaaaatgatttacattaaacattaaattttaatttaaaataaatgcatttgaggcattgaaaataatttgttttctaaatatgacattcccacaagttttatacattatgaattgcctttaaatattctccctcttctagtccttagacactgaggagtatatgtcaacccatttgacaaggttcaaattaatgcatttcctgaattatccaatctaaattaatgaggttGTTCATATGGACCACAATAATTTCAGCAATTTCttctattttttttaatctgtgctgtggtttaaatcttttctcttgacctgtcttttaattcactatccctattttctggtgtgtttaatctgctgttaaatccatttattgagttcttaattgtggatattgtatttttcaagccaataactgccatttgattattccatatagatttcagctctccagtaaaataatttatcttctgctctattttcttcaacatagtaatcacagctattctaaagtcattgtctaataattctaatacctagttctccagtgagattgtttacattatcttttttatttttggtcttgggttttggttgtatagtcctatcatatcacaagacaagtcacttttgattggataatggacattgtttacaacaattgtaaaagctttggatgatgttatcattttcatcgaagttcattcttttctttgctagacaaagtgagagcaaatcctcttaactcaaggattgaaccaagtcaaggctggatgacttttagctaatgctcagtccatttctagcttgctattttacctatggttttgtgccccaggactttcagctgagaacataatttgttcaccatgaccccaaacccttgaaggtcctgaaatctaccttctgtgttctgtgaagctgaaaaattctgatctgcatttcagatgttttcagatattatttatggtcttctgcacagtgaaattttcaaatgtggaaaatgtcttgggaagaaaaatgatgtggttttgaaaatcctcaagaatctggttttgtctcttcggccagcttagactgacaaatggtatgatgcctttgtcctccagaaaggcccttatcctgggcaaagcttacctgttctcagccccttgtctgtgcccagaacaagcaagttctgggaacactggttacaggttgtcatctgctgacctctctattgctagatcctctctggaatcttagaccctgtatcctgatttcttcagtagctcaccgatgcctttaaatttagaagttttacattttgtctggatttttttgttatgtaaaagatcattagcctacagaaaactactccatcttatccaggtccagaagtcTCACATCTGTGGGCTCCTAAACAAGAGATTGATAGAATAAAATTTCTATTTGCCAGATGGATAAAAGAAAAGAAACTGGGCAAGATGCAACAGACCTTAACCATGTTGGCAGAGGCAGGAATTAACAGAAACATAGAACTCTGATAATGTTATTttcaatctttataacacctccaaggtagatattcttggcctccctttacaaatTAATTTACAAGATGTACATTATTGTATTTACTATCCCCAAAGCCTAGGTATCTTCTGTGTGGTATAgtggagctttgtccaaagtagctctgacatcactaagcctcaattactcggtctgtcaaatgagaataataatatttgtttcataattctgaccattgaaataaatacatatgaaagcaactcattaattacaaagagatatatattttaagggCAACTGGGATACATAAAAATGAATGTTATAAAGGGAGGCAttttgttgtttttctttttcttttaaaaaagagatagggtctcactgtgttaactaggctggtcttgaactcctgacctcaagccatcttcttggctcggcctcccaaagcactgggattataggGGGAAGAAGGGTCTTTAAAAAAAAAGTtcacagatccctggaaacaagaggcacaccacaccacacagggctacccagggaactaccagcatcagtcaggagacgagggagcaaggggaaaatgtagctaacagtctttattgtgatttcccagggaaggaacaagcaatgcagggttaacagatttagaattggcaagtttggataattttggcaggcactaggggcattgggccctttcctagttgtcaggaacctggccttcagatgattagggcagcaggatagtgggtcagagtgtgagagcctaataaactaggtggttaggggtatggactctgggtggtttggtttacaaatgacagatgcattgcctggaaaattgtttgccatctttaggaataggctaaccctaaaggaggtagtccctccagggtcaactagcctccaagatgcccaagcatccaaacacagcaaaaaaagacatgattaagacaGTATAGAAATATAAGTGGCAGTTATCTTTCTTAAGTACCAATATTCTACTAATTCTGA</dnaseq>| | ||
}} | }} | ||
− | [[Category:Intergenic]][[Category:NONHSAG052674]] | + | [[Category:Intergenic]][[Category:NONHSAG052674]][[Category:Transcripts]] |
Latest revision as of 07:20, 17 October 2014
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Transcriptomic Nomeclature
Please input transcriptomic nomeclature information here.
Function
Please input function information here.
Regulation
Please input regulation information here.
Expression
Please input expression information here.
Allelic Information and Variation
Please input allelic information and variation information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this lncRNA
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Basic Information
Transcript ID |
NONHSAT132727 |
Source |
NONCODE4.0 |
Same with |
, |
Classification |
intergenic |
Length |
2984 nt |
Genomic location |
chr9+:85436266..85439776 |
Exon number |
2 |
Exons |
85436266..85436376,85436904..85439776 |
Genome context |
|
Sequence |
000001 cactgcactc cagcttgggt gacagtgcga gactccatct caaaaaaaaa aaaaaaagaa aTTGTACTAT CCAAGTTCAT 000080 000081 AAAACCATCC TAATTCCaaa aaaaaaaaaa agcaatcaga ggctgaagtg gaagcatggc ccctgatgaa taagaggcat 000160 000161 ttctcgtttg tgatgtaggg gagagggggt tttgtagagg gaggagcctc tggcctcttg tcacttgggc atgcagaggt 000240 000241 ggggttttcc tttcagccca gttcgaagaa gaaagccatg ggttggcctt aggctccttg tctccagacc ctattctcct 000320 000321 gcctcaGCTG AAGCTGATGT GTCTCTGATT CCAAAGCCTG AAAAATTTTC GTTATATTAT ACCAGCTTTG TTACTGAAAA 000400 000401 GAACATTCAG GAATGTAGTT AATAACCACT GGTGTTCAAg gacctgtttt aattaataaa aatgatttac attaaacatt 000480 000481 aaattttaat ttaaaataaa tgcatttgag gcattgaaaa taatttgttt tctaaatatg acattcccac aagttttata 000560 000561 cattatgaat tgcctttaaa tattctccct cttctagtcc ttagacactg aggagtatat gtcaacccat ttgacaaggt 000640 000641 tcaaattaat gcatttcctg aattatccaa tctaaattaa tgaggttGTT CATATGGACC ACAATAATTT CAGCAATTTC 000720 000721 ttctattttt tttaatctgt gctgtggttt aaatcttttc tcttgacctg tcttttaatt cactatccct attttctggt 000800 000801 gtgtttaatc tgctgttaaa tccatttatt gagttcttaa ttgtggatat tgtatttttc aagccaataa ctgccatttg 000880 000881 attattccat atagatttca gctctccagt aaaataattt atcttctgct ctattttctt caacatagta atcacagcta 000960 000961 ttctaaagtc attgtctaat aattctaata cctagttctc cagtgagatt gtttacatta tcttttttat ttttggtctt 001040 001041 gggttttggt tgtatagtcc tatcatatca caagacaagt cacttttgat tggataatgg acattgttta caacaattgt 001120 001121 aaaagctttg gatgatgtta tcattttcat cgaagttcat tcttttcttt gctagacaaa gtgagagcaa atcctcttaa 001200 001201 ctcaaggatt gaaccaagtc aaggctggat gacttttagc taatgctcag tccatttcta gcttgctatt ttacctatgg 001280 001281 ttttgtgccc caggactttc agctgagaac ataatttgtt caccatgacc ccaaaccctt gaaggtcctg aaatctacct 001360 001361 tctgtgttct gtgaagctga aaaattctga tctgcatttc agatgttttc agatattatt tatggtcttc tgcacagtga 001440 001441 aattttcaaa tgtggaaaat gtcttgggaa gaaaaatgat gtggttttga aaatcctcaa gaatctggtt ttgtctcttc 001520 001521 ggccagctta gactgacaaa tggtatgatg cctttgtcct ccagaaaggc ccttatcctg ggcaaagctt acctgttctc 001600 001601 agccccttgt ctgtgcccag aacaagcaag ttctgggaac actggttaca ggttgtcatc tgctgacctc tctattgcta 001680 001681 gatcctctct ggaatcttag accctgtatc ctgatttctt cagtagctca ccgatgcctt taaatttaga agttttacat 001760 001761 tttgtctgga tttttttgtt atgtaaaaga tcattagcct acagaaaact actccatctt atccaggtcc agaagtcTCA 001840 001841 CATCTGTGGG CTCCTAAACA AGAGATTGAT AGA |