Difference between revisions of "NONHSAT143970"

From LncRNAWiki
Jump to: navigation, search
(Created page with "Please input one-sentence summary here. ==Annotated Information== ===Transcriptomic Nomeclature=== Please input transcriptomic nomeclature information here. ===Functio...")
 
Line 42: Line 42:
 
sequence = <dnaseq>AAATTCGATCTCAGAATCTTTTTGCCAGAAGTGTCTCATGGGACTTATCTATAGTGGAACACATTTGAAGACCTACTGCTCTATTAAGAAGGCAGCCGGACAACATGTTCTAATACTTCGTATGCTTTGTGACCTAGTTAAAATCTAAACTTAAGTCGCCATGGCCAGTGGCCTTTAGATTAAGCTAGCCTTACCCCTGGGAGTATACCAGAGCTTTCCAAGGAATACACAGACTCCAGTACTCTCAGGGGAGCAGTGTTCAGAGCCTCATCTTCCTGTTATATTCTTCTCTAAGATTCATCTGCCTGAGAAAATGCCCTTTTCTCACCTTACAAAAGAAAATATGGCTGTCTCCACCTCTAGTCTTACTGTAGAGCATGTCCCAAGGTGTAAAAATTCAAAATGTGGATATTTGGAAAGTGAAAGACTTATCAACAGGGCACAAATCTTTTTGCTAATGGATTTTCCAAGTTTTTCTGGTGGTTCCAAATTTTTTGCTTTCAACAAAGTGGGAGGAACAGCCTGTAGATTTCTGAGTCTCTTAGCATGTAACTACAAAGGGGTTGGAAGAATTCAGTGATTCTGCTATCATAAAGCTTCCGTTCCCATTGATGTATCTGTGTGAACAAGGATCAACATCTCCATAAATGAAATTGAAAACGGAAAATAGAATTGATGATGAACTTTGGCTCAATCTTAAGATGTTATCAATCTACATAGATGAAATAATTGTGGAGAAAAGCCCTCTTTATCTCATTAAGTGATACATTTCCAAAGAAGTTTTACTATGTTTAATAATTTAGTGAAATTTGGGCTATGTGTTTATTGATTCAGCTCAATCCAGAGGAAAATTTTAAAGGCTTACAGCCTTAGGATTATAGGATACTATATAATACTTTTGGTACAGAGATAGAATTAAATAACATAAAAATCAAAAATTTATTAGGCTAAAATTTTGAGGGAGAAGTGGTATGAAAATACAAATTCAAGGAGTAAAAGGAAAAGTGGGGCATTCCTTGCTACTAAAAATTGCCTTGTTCCAGGTAAGACTGATCATAAAAAAATGGCCCTGTTCATAAAATTTTTAAAAAGATCATAGTATCTATCAAATAACTTATATTAAGAACCTCCTGGGCTAAATTTAAAAAGTAATACAACAGTTTTATTTAAACATGTAGTGTCTACGGTATGCCAGCACTTTGCAGCTATTTATAATGAGAAATTTTAGATGTCAATATAGCAATGTGCAAGAAGATAGAGATTTTCAAAATTCACTTAAGAGTATCTGAGCATAAAATGTTAAGATTGCTGATCGGATGTGAGGGCGATCTGGCTGCGACATCTGTCACCCCATTGATCGCCAGGGTTGATTCGGCTGATCTGGCTGGCTAGGTGGGTGTCCCCTTCCTACCTCACCGCTCCATGTGCGTCCCTCCCGAAGCTGCGCGCTCCGTCGAAGAGGACGACCAACCCCGATAGAGGAGGACCGGTCTTCGGTCAAGGGTATACGAGTAGCTGCGCTCCCCTGCTGGAACCTCCAAACAAGCTCTCAAGATTGCTGATCTAGGGCCACTAAGTGATGAATTGTATTTGGAAGCAAAAAGGATGGCTAAAAAGGACCTCAACCCTTTTGACTTTAAAAGGAAAATAGCTTAACCTTCAACCTGTGTGACATTTAACTTTTTGAACCCAACCGTAAAAGCTATCTTCTAACCAACAAAAAGTTAATAATTAGATTTGGAATTATACAGAATTAGAAAATTGGCATTTAAAAATACTCAATAATTTGTCCCTGGTTTTTAATTTTCAAAATATTTTCTTTTTGAAGAGCCAGATTCCAGTGATCCTGCCTCTCAGAAATTTCCACATTTCTTATTTTTCATTAGGCCTTAAGAAGCTGCATTTGTAAACTTGTGTTTCATTATTAAAGCTTAATTTATTTTTTATATAAATAGTATGTGCTTTGTGTACATAGAGAATTAAGTGAATGAGTCACACAGATGTTGGCTGTTGTTAATGTGAAAATTAAACAGCTGTATCACATTTTGAAAAATAAAAGTTTCATCTGAATG</dnaseq>|
 
sequence = <dnaseq>AAATTCGATCTCAGAATCTTTTTGCCAGAAGTGTCTCATGGGACTTATCTATAGTGGAACACATTTGAAGACCTACTGCTCTATTAAGAAGGCAGCCGGACAACATGTTCTAATACTTCGTATGCTTTGTGACCTAGTTAAAATCTAAACTTAAGTCGCCATGGCCAGTGGCCTTTAGATTAAGCTAGCCTTACCCCTGGGAGTATACCAGAGCTTTCCAAGGAATACACAGACTCCAGTACTCTCAGGGGAGCAGTGTTCAGAGCCTCATCTTCCTGTTATATTCTTCTCTAAGATTCATCTGCCTGAGAAAATGCCCTTTTCTCACCTTACAAAAGAAAATATGGCTGTCTCCACCTCTAGTCTTACTGTAGAGCATGTCCCAAGGTGTAAAAATTCAAAATGTGGATATTTGGAAAGTGAAAGACTTATCAACAGGGCACAAATCTTTTTGCTAATGGATTTTCCAAGTTTTTCTGGTGGTTCCAAATTTTTTGCTTTCAACAAAGTGGGAGGAACAGCCTGTAGATTTCTGAGTCTCTTAGCATGTAACTACAAAGGGGTTGGAAGAATTCAGTGATTCTGCTATCATAAAGCTTCCGTTCCCATTGATGTATCTGTGTGAACAAGGATCAACATCTCCATAAATGAAATTGAAAACGGAAAATAGAATTGATGATGAACTTTGGCTCAATCTTAAGATGTTATCAATCTACATAGATGAAATAATTGTGGAGAAAAGCCCTCTTTATCTCATTAAGTGATACATTTCCAAAGAAGTTTTACTATGTTTAATAATTTAGTGAAATTTGGGCTATGTGTTTATTGATTCAGCTCAATCCAGAGGAAAATTTTAAAGGCTTACAGCCTTAGGATTATAGGATACTATATAATACTTTTGGTACAGAGATAGAATTAAATAACATAAAAATCAAAAATTTATTAGGCTAAAATTTTGAGGGAGAAGTGGTATGAAAATACAAATTCAAGGAGTAAAAGGAAAAGTGGGGCATTCCTTGCTACTAAAAATTGCCTTGTTCCAGGTAAGACTGATCATAAAAAAATGGCCCTGTTCATAAAATTTTTAAAAAGATCATAGTATCTATCAAATAACTTATATTAAGAACCTCCTGGGCTAAATTTAAAAAGTAATACAACAGTTTTATTTAAACATGTAGTGTCTACGGTATGCCAGCACTTTGCAGCTATTTATAATGAGAAATTTTAGATGTCAATATAGCAATGTGCAAGAAGATAGAGATTTTCAAAATTCACTTAAGAGTATCTGAGCATAAAATGTTAAGATTGCTGATCGGATGTGAGGGCGATCTGGCTGCGACATCTGTCACCCCATTGATCGCCAGGGTTGATTCGGCTGATCTGGCTGGCTAGGTGGGTGTCCCCTTCCTACCTCACCGCTCCATGTGCGTCCCTCCCGAAGCTGCGCGCTCCGTCGAAGAGGACGACCAACCCCGATAGAGGAGGACCGGTCTTCGGTCAAGGGTATACGAGTAGCTGCGCTCCCCTGCTGGAACCTCCAAACAAGCTCTCAAGATTGCTGATCTAGGGCCACTAAGTGATGAATTGTATTTGGAAGCAAAAAGGATGGCTAAAAAGGACCTCAACCCTTTTGACTTTAAAAGGAAAATAGCTTAACCTTCAACCTGTGTGACATTTAACTTTTTGAACCCAACCGTAAAAGCTATCTTCTAACCAACAAAAAGTTAATAATTAGATTTGGAATTATACAGAATTAGAAAATTGGCATTTAAAAATACTCAATAATTTGTCCCTGGTTTTTAATTTTCAAAATATTTTCTTTTTGAAGAGCCAGATTCCAGTGATCCTGCCTCTCAGAAATTTCCACATTTCTTATTTTTCATTAGGCCTTAAGAAGCTGCATTTGTAAACTTGTGTTTCATTATTAAAGCTTAATTTATTTTTTATATAAATAGTATGTGCTTTGTGTACATAGAGAATTAAGTGAATGAGTCACACAGATGTTGGCTGTTGTTAATGTGAAAATTAAACAGCTGTATCACATTTTGAAAAATAAAAGTTTCATCTGAATG</dnaseq>|
 
}}
 
}}
[[Category:Intergenic]]
+
[[Category:Intergenic]][[Category:NONHSAG020111]]

Revision as of 07:40, 13 October 2014

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Transcriptomic Nomeclature

Please input transcriptomic nomeclature information here.

Function

Please input function information here.

Regulation

Please input regulation information here.

Expression

Please input expression information here.

Allelic Information and Variation

Please input allelic information and variation information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this lncRNA

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Basic Information

Transcript ID

NONHSAT143970

Source

NONCODE4.0

Same with

,

Classification

intergenic

Length

2072 nt

Genomic location

chr16+:81994217..81996288

Exon number

1

Exons

81994217..81996288

Genome context

Sequence
000001 AAATTCGATC TCAGAATCTT TTTGCCAGAA GTGTCTCATG GGACTTATCT ATAGTGGAAC ACATTTGAAG ACCTACTGCT 000080
000081 CTATTAAGAA GGCAGCCGGA CAACATGTTC TAATACTTCG TATGCTTTGT GACCTAGTTA AAATCTAAAC TTAAGTCGCC 000160
000161 ATGGCCAGTG GCCTTTAGAT TAAGCTAGCC TTACCCCTGG GAGTATACCA GAGCTTTCCA AGGAATACAC AGACTCCAGT 000240
000241 ACTCTCAGGG GAGCAGTGTT CAGAGCCTCA TCTTCCTGTT ATATTCTTCT CTAAGATTCA TCTGCCTGAG AAAATGCCCT 000320
000321 TTTCTCACCT TACAAAAGAA AATATGGCTG TCTCCACCTC TAGTCTTACT GTAGAGCATG TCCCAAGGTG TAAAAATTCA 000400
000401 AAATGTGGAT ATTTGGAAAG TGAAAGACTT ATCAACAGGG CACAAATCTT TTTGCTAATG GATTTTCCAA GTTTTTCTGG 000480
000481 TGGTTCCAAA TTTTTTGCTT TCAACAAAGT GGGAGGAACA GCCTGTAGAT TTCTGAGTCT CTTAGCATGT AACTACAAAG 000560
000561 GGGTTGGAAG AATTCAGTGA TTCTGCTATC ATAAAGCTTC CGTTCCCATT GATGTATCTG TGTGAACAAG GATCAACATC 000640
000641 TCCATAAATG AAATTGAAAA CGGAAAATAG AATTGATGAT GAACTTTGGC TCAATCTTAA GATGTTATCA ATCTACATAG 000720
000721 ATGAAATAAT TGTGGAGAAA AGCCCTCTTT ATCTCATTAA GTGATACATT TCCAAAGAAG TTTTACTATG TTTAATAATT 000800
000801 TAGTGAAATT TGGGCTATGT GTTTATTGAT TCAGCTCAAT CCAGAGGAAA ATTTTAAAGG CTTACAGCCT TAGGATTATA 000880
000881 GGATACTATA TAATACTTTT GGTACAGAGA TAGAATTAAA TAACATAAAA ATCAAAAATT TATTAGGCTA AAATTTTGAG 000960
000961 GGAGAAGTGG TATGAAAATA CAAATTCAAG GAGTAAAAGG AAAAGTGGGG CATTCCTTGC TACTAAAAAT TGCCTTGTTC 001040
001041 CAGGTAAGAC TGATCATAAA AAAATGGCCC TGTTCATAAA ATTTTTAAAA AGATCATAGT ATCTATCAAA TAACTTATAT 001120
001121 TAAGAACCTC CTGGGCTAAA TTTAAAAAGT AATACAACAG TTTTATTTAA ACATGTAGTG TCTACGGTAT GCCAGCACTT 001200
001201 TGCAGCTATT TATAATGAGA AATTTTAGAT GTCAATATAG CAATGTGCAA GAAGATAGAG ATTTTCAAAA TTCACTTAAG 001280
001281 AGTATCTGAG CATAAAATGT TAAGATTGCT GATCGGATGT GAGGGCGATC TGGCTGCGAC ATCTGTCACC CCATTGATCG 001360
001361 CCAGGGTTGA TTCGGCTGAT CTGGCTGGCT AGGTGGGTGT CCCCTTCCTA CCTCACCGCT CCATGTGCGT CCCTCCCGAA 001440
001441 GCTGCGCGCT CCGTCGAAGA GGACGACCAA CCCCGATAGA GGAGGACCGG TCTTCGGTCA AGGGTATACG AGTAGCTGCG 001520
001521 CTCCCCTGCT GGAACCTCCA AACAAGCTCT CAAGATTGCT GATCTAGGGC CACTAAGTGA TGAATTGTAT TTGGAAGCAA 001600
001601 AAAGGATGGC TAAAAAGGAC CTCAACCCTT TTGACTTTAA AAGGAAAATA GCTTAACCTT CAACCTGTGT GACATTTAAC 001680
001681 TTTTTGAACC CAACCGTAAA AGCTATCTTC TAACCAACAA AAAGTTAATA ATTAGATTTG GAATTATACA GAATTAGAAA 001760
001761 ATTGGCATTT AAAAATACTC AATAATTTGT CCCTGGTTTT TAATTTTCAA AATATTTTCT TTTTGAAGAG CCAGATTCCA 001840
001841 GTGATCCTGC CTCTCAGAAA TTTCCACATT TCTTATTTTT CATTAGGCCT TAAGAAGCTG CATTTGTAAA CTTGTGTTTC 001920
001921 ATTATTAAAG CTTAATTTAT TTTTTATATA AATAGTATGT GCTTTGTGTA CATAGAGAAT TAAGTGAATG AGTCACACAG 002000
002001 ATGTTGGCTG TTGTTAATGT GAAAATTAAA CAGCTGTATC ACATTTTGAA AAATAAAAGT TTCATCTGAA TG
[back to top]