Difference between revisions of "BGIOSGA017047"

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA017047

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA017047, complete gene.

LocusTag

OS04G0599650

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA017047-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA017047-PA

Length

13863

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:29120764..29134626

Sequence Coding Region

29120764..29120844,29122131..29122667,29122783..29123820,29124026..29124350,29124871..29125126
,29125209..29125425,29126051..29126403,29126638..29127141,29128575..29129775
,29129922..29130278,29130566..29130803,29131391..29133957,29134039..29134163
,29134344..29134626

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGGGGAGAGGGATTTGGGCGACATCGTGCTCTCCTGGTCGCTCGGTGAGGTCATGGACGACGACCTCTACAGAGGAAAGGTTGAGGAAATTCCTCGCAGTTTCATGTCCCTTGATCACTATTTCAAAACATATGCTGCACCTCTGATTGAGGAAACAAGATCCGATCTGTGCTCATGTCTTGAGCTCATATCAGAAGCACCCATTTCTAAGATACTGTCTATGGAAGAAGCAGGAAAATCAGGATTGTATTTTATGGATGTGGACTTCTGGGATAACGGGGCTGGTTTTTCTTCCGAGGCTTATACTGCTAGGAATGGAGATATATTTATATTGTCTAGTATGAAACCTGAATCTGCAGATGACTTGAACCGCTATGGTGTGACATACTGCCTGGCTATGGTTACTGAAGTTTCTATGGATGATGAATTCCAGAAGGGTTTCCGAGTGAAAGTTGCAAAGGATGTAACTCTACAAGAAGGCTTCAACAGACTTAGACATGCGATATTTCTTAATAATATTATGACAAACTTACGGATATGGAAAGCAATTTGCTTTGACATGGGCATGAACAACAATTTCACAGTAATCAAGTCACTCTTTGCCCCCACATATATGGGTGATGACGTTTGTGATATCTGTGTTAAACAGGATGAGCACTGTTTGGCTTTATGTACTGAGCAATTACTGTCAATTAATCTTAATCAATCGCAAGTGGATGCTATTGAGTCTGTTATCTCAGCAGTGCAGTGTAGGCATTTGAATCTCATGAAACTTATATGGGGTCCACCAGGTACTGGAAAGACCAAGACAGTTAGTGCTTTGCTTTGGGCTTTGGCATGTTTGAAATGCAGAACTCTTACATGTGCACCCACAAATGTTGCTATTGTTGGAGTTTGTACTCGGTTCCTTCATATTTTGAGGGATTTCAACAAGAATGCCAATGAAAACTTTCTACCCTTTTCTCTTGGTGATGTCTTGTTATTTGGAAACAAGTATAATATGGACATCACTGAGGACCTTCAAGATGTTTTCTTAGATTGTCGTGCTGATGAACTTGTTGAATGCTTTTCATCGTTGTCTGGGTGGAGATACAGAATAGCTTCTATGGCTTCCTTTTTTGAGGATTGTGGTTCTCAGTATGATATGCTTCTTGAGGATGATGGAAGAAGCGATCCTATTTGTTTCCTGGACTTTATAAAGACACAATTTGATGTGACAGCCACAGCTTTAAAGAAATGCATAATGAACTTATTGATTCACCTTCCTAGGAAGTGCTTTTCACATGATAGCATCAGTAATATATCAATGCTCTTTGATTCACTGGAAAAAGTTGAAGCCCTTTTACATCATGAAAATTTAACTGATGATGGTGCAAAAAGGGGCTTTGGTTTTCTGTCTATTCAAGACATTTCTTGTGCAAAGTCTGCATTCATTATTGAGAAGGAACTGAATAGAGCAAAGTTATCATGCCTTCAATTGCTTGAAGATCTTGAGAGATCACTGGATCTACCTACTGGTAGAGACAGAAATTGGATTCAGAACTACTGCATGCGTAATGCAACACTTATTTTTTGTACCTCCTCTAGCTCGTATCGATTGCATCACATGGAAATTGCACCGCTTGATGTGTTAATTGTGGATGAGGCGGCTCAAGTATGCAAAGAAGCTGGATTTGGAATTAGTCTTTTTGAGAGATTGGTTGTACTGGATTTTGAAAAACATTTGCTGAATATACAATATCGCATGGATCCTCGTATCAGCTTGTTTCCTAATGTTCAATTTTATGGGAGGAAGATTTTAGATGGTCCAAATGTCATGTCCTCTGTCTATAACAAAGATTACACAAACCTCCCTTTTGGTACCTATGCTTTTATAAACATCAGTGATGGAAGGGAAGAAAAAGAGGGCACTGGAAACAGTTGGCGAAACCTGGTTGAAGTTGCTGTTGTTTTGCACCTGATCCAAACAATTTTTAAAACTTGGAAAAGGAAAGGACAAATGCTCAGCATTGGTGTGATCTCTCCGTACAGTTCTCAAGTTGATTCAATAGAAAGCAGACTTGGCAAATTGTATGACACGTGTGATGGCTTTCATGTGCGCGTAAAGTCTGTTGATGGTTTCCAAGGAGAAGAAGATGATATTATCATACTATCAACAGTTAGGTCTAATGTGAAAGGCATTGTTGGATTTCTTGCTGATGAACAAAGAACAAATGTTGCTCTTACAAGAGCAAGGCACTGCCTTTGGATTCTAGGTAATGCTAATACACTGTATAGTAGTGGGACAGTATGGAAAGACCTTATAGCTGATGCACAAAGACGTAAATGTATCATTGATGCTACTAATGACGCAGCCATATGTAAGTTGGTTTTGAAAGTCAAGAATGAACTTGATGAACTTGACGATCTACTTAATGCGGATTCAGCCGTTTTCAGCAATACTAGATGGAAAGTCGTTTTCAGTGACGAATTTAAGAAGTCCTTTGCAAAATTAAAATACCCACAGCTTAGGAGGGAAGTACTTCAAAAGCTTATCAAACTTGGTGTTGGCTGGAGGACAACAATGAAGAATTTGAATTTCAATGTAATTGATCCTTTCCAGCTTGCAAAAGTATACAAAGTCAGGGACCTTTATCTTGTTTGGAGTACCGATATAGAGAAAAGCGAAAGGTATGTTCAGATTATAAGAATTTGGGACCTGTTGTCTCACCAGAATGTTGCAAGAACTGTTCAACGTCTTGAAAATCTGTTTTCCATGTACACGGATGAGTACCTCGATAAGTGCAGAAGAGTAAAGACTGAGGGGAAACTGGAAGTGCCTGTTATTTGGGATGCCGAGCATGATATTATTCGCTATCGGAAGGTTCTGGAAGTTGATGCTCAGGAAGACCATGATCATGTGGACATATCATATGCTATGGAGAATTCAAAAGTCAGTGAAAGCTTCTTGCTAATGAAGTTCTACTCTCTATCATCTGGTGTGGCAAAACATTTGCTAACAGCTACTGATGGATCAGAAATTGATATTCCCTTTGAACTGACTGATGAAGAGCAGGCGATTATTCGATTCCCACTCACTAGTTTTATACTTGGAAGGTCAGGCACTGGTAAAACAACTGTGCTCACAATGAAGCTGATTCAAATATGGCAACAGTCTTTGATTGCATCACGTGGGCTAAATTTGGATGAAAGAAATAGTACAGCACAGAAGGATTTGAGTGAAGTAGAAACTTTTGTTAAACAAGTCTTTATCACTGTAAGCCCAAAGCTATGTTCAGCTATAAGGAATCAGATTTGCAAGCTTACAAGATATGGTTCTGGTGACGTCTCTGATCAGGCTAGCATTCTTCAAATGCCTGACATGGTTGATGATCTTGAAGACTTCACTGACATACCCGATAGTTTTATTGGTCTTCCTTGTGAGCACTATCCTCTTACTATCACGTTTCGGAAGTTTCTGATGATGCTTGATGGAACATGCAAAACTTCATTCTTTGGTACCTTTTGTGGTGAACTAAGGTCTTCCACGGAGAGAGGGTATTCAAAATCTCGAGCCCTGCAAGCTTTTATTGAAATGAAGGAAGTAACATATGAAAAATTTTCTGCTTCCTATTGGCCGCATTTTAACTCTGAACTGACAAAGAAACTTGATGCGTCCACTGTCTTCACTGAAATAATTTCTCATATAAAGGGTGGATATCAAGCGAACAAACCTTTTGGTGGCAAACTTGAAAGGCTTGATTATTTAAAGCTTTCTGAGAAGAGATTTTCGTCTCTGAACAGTCAGATGAGAGAAAGGGTATATGATATTTTTCTTGATTACGAAAGTATGAAATGCACAGCCAGGGAATTTGACTTGTCAGATTTTGTTAACAGTCTTCACAGAAACCTTCTTTCTGAGGGCTACAATGGTGATATTGTGGATTGTATTTACATAGATGAGGTGCAGGATCTTACAATGACACAGATAGCACTGCTCAAGTATGTCTGCAGGAACTTCGAGGAGGGCTTTGTTTTTGCTGGTGACACAGCACAGACGATAGCAAGAGGCATTGATTTTAGGTTTGAAGATATTCGCTCACTCTTCTATACCTATTTCCTTCCAGAAATGGAGCCATGTGGTCAAGGGATTAATCATGGAAAACAGCTTCGTATCACGGATATGTTCCAGCTTACCCAAAATTTTCGCACACACTGTGGAATCCTTCGTTTGGCTCACAGTATCATGAGTCTTCTGTACTACTTTTTCCCGTCATGTGTTGACAAACTTAACCCAGAGATTGGGCTTGTATATGGAGAAGCACCTGTGCTGCTTGAATCTGGTAATGATGAGAACGCAATTATGACTATCTTTGGAGAAAGCAAGAGTGACCCTGGTAACTTGCAAGGGTTTGGTGCCGAACAAGTTATATTAGTTCGTGATGATGCAACCAAGAAACAGGTTGTTGACCTTGTTGGTAAACAAGCTCTTGTTTTGACAATTGTTGAATGTAAGGGCCTTGAGTTCCAGGACGTGCTGCTGTACAATTTCTTTAGCTCATCACCTTTAAGAAATAAATGGAGAGTTGTGTATGACTACATGAAAGGCAAAAATGTTATAGAATCATCTGAAGAGATGTCCCACTCTTTTTTCGACAAAAACAAGCATTATCTTCTCTGTTCAGAGTTGAAGCAGCTCTATGTTGCAATTACACGAACTAGGCAAAGGCTGTGGATATGTGAGAATGCAGATGATAACTGCCGACCGATGTTTGACTACTGGAAGAAGTTGTGCCTTGTTGAAGTTAGAGTACTTGATTCTTCACTCATTGAAGCAATGCAGGCAGGAAGCAGCACAGAAGAAGATTGGAGGCAACGGGGTACCAAGCTATTCGCTGAGGGGCAATATGAAATGGCTACGATGTGCTTTGAAAAGGCAGGTGATGCTTACAGAGAAAAGTTAGCAAGAGCTGCTGGACTTCTAGCAACTGCTGACCGTGTCATCTCTAC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Protein Sequence

<aaseq>MGERDLGDIVLSWSLGEVMDDDLYRGKVEEIPRSFMSLDHYFKTYAAPLIEETRSDLCSCLELISEAPISKILSMEEAGKSGLYFMDVDFWDNGAGFSSEAYTARNGDIFILSSMKPESADDLNRYGVTYCLAMVTEVSMDDEFQKGFRVKVAKDVTLQEGFNRLRHAIFLNNIMTNLRIWKAICFDMGMNNNFTVIKSLFAPTYMGDDVCDICVKQDEHCLALCTEQLLSINLNQSQVDAIESVISAVQCRHLNLMKLIWGPPGTGKTKTVSALLWALACLKCRTLTCAPTNVAIVGVCTRFLHILRDFNKNANENFLPFSLGDVLLFGNKYNMDITEDLQDVFLDCRADELVECFSSLSGWRYRIASMASFFEDCGSQYDMLLEDDGRSDPICFLDFIKTQFDVTATALKKCIMNLLIHLPRKCFSHDSISNISMLFDSLEKVEALLHHENLTDDGAKRGFGFLSIQDISCAKSAFIIEKELNRAKLSCLQLLEDLERSLDLPTGRDRNWIQNYCMRNATLIFCTSSSSYRLHHMEIAPLDVLIVDEAAQVCKEAGFGISLFERLVVLDFEKHLLNIQYRMDPRISLFPNVQFYGRKILDGPNVMSSVYNKDYTNLPFGTYAFINISDGREEKEGTGNSWRNLVEVAVVLHLIQTIFKTWKRKGQMLSIGVISPYSSQVDSIESRLGKLYDTCDGFHVRVKSVDGFQGEEDDIIILSTVRSNVKGIVGFLADEQRTNVALTRARHCLWILGNANTLYSSGTVWKDLIADAQRRKCIIDATNDAAICKLVLKVKNELDELDDLLNADSAVFSNTRWKVVFSDEFKKSFAKLKYPQLRREVLQKLIKLGVGWRTTMKNLNFNVIDPFQLAKVYKVRDLYLVWSTDIEKSERYVQIIRIWDLLSHQNVARTVQRLENLFSMYTDEYLDKCRRVKTEGKLEVPVIWDAEHDIIRYRKVLEVDAQEDHDHVDISYAMENSKVSESFLLMKFYSLSSGVAKHLLTATDGSEIDIPFELTDEEQAIIRFPLTSFILGRSGTGKTTVLTMKLIQIWQQSLIASRGLNLDERNSTAQKDLSEVETFVKQVFITVSPKLCSAIRNQICKLTRYGSGDVSDQASILQMPDMVDDLEDFTDIPDSFIGLPCEHYPLTITFRKFLMMLDGTCKTSFFGTFCGELRSSTERGYSKSRALQAFIEMKEVTYEKFSASYWPHFNSELTKKLDASTVFTEIISHIKGGYQANKPFGGKLERLDYLKLSEKRFSSLNSQMRERVYDIFLDYESMKCTAREFDLSDFVNSLHRNLLSEGYNGDIVDCIYIDEVQDLTMTQIALLKYVCRNFEEGFVFAGDTAQTIARGIDFRFEDIRSLFYTYFLPEMEPCGQGINHGKQLRITDMFQLTQNFRTHCGILRLAHSIMSLLYYFFPSCVDKLNPEIGLVYGEAPVLLESGNDENAIMTIFGESKSDPGNLQGFGAEQVILVRDDATKKQVVDLVGKQALVLTIVECKGLEFQDVLLYNFFSSSPLRNKWRVVYDYMKGKNVIESSEEMSHSFFDKNKHYLLCSELKQLYVAITRTRQRLWICENADDNCRPMFDYWKKLCLVEVRVLDSSLIEAMQAGSSTEEDWRQRGTKLFAEGQYEMATMCFEKAGDAYREKLARAAGLLATADRVISTNFEMGQSSLQKASEIFESIGKHEKAATCYMKLGDYKKAGMVYMEKCGNSRLKDAGDCFELSACWSLAADAYFRAKCYAKCLSMCSKGKLFQKGLLLLQQLEEHLLENSSLVKVAAIRNTFLEDCALHYFECGDIKHMMPFVKSFSSMDHIRVFLNSKNLVDELLSVEMDMGNFVEAAGIAKHTGNILLEADLLEKAGFLENATQLILLQLFVNSLWASHSTGWPPKRFAEKEQLLAKAKEMSRNVSESFYCLVCSEADALSDEHKSLASITYNLIEGNKCGNLLVELIASRLILDVHLQAEASGYCFESEPGSHDGRHCKDMLVLNQISLETLVYDWNYWSSIIVKVLRHLDHPKDAESNDLAAICEDLCAKYFGWRKDGDYDRYVVLNTDSSWLSNTGRNYLQQDGRRCWLDTLHCHSCAKDFWINELYSVGLSVLKKLESIVQILPTSSCSLGRTILVIYEIAKFLKESEFGMPKNTIKYYSILCERRFFELVFLVWRDETPKSLLCILDSATTYNLLSDSICSYLGSRNNKMTHSQVGRITMLLLHAARLDDSLISQLVEYLDRGSEWATFFLSLKKYLDNGVSRDILLLDFKFALDCTYKANWRAEHYISPICYVDLIECLGFLATTHLVLNDYMFCTKSLLAKMMKCRTTKGYFETCMAPSTDIDLGYAGHSARCFIYLSVKDLLGSKRMIVEWVQNTSTPTSSYVPILLRLVITLYLVTVNQDDGDLYEVTAFLEKNHVFTDLPPEFSEKIRNALRMKSRTVKNFMRVFADALAAIGTRMVVMGDIKKAMAHKCQPDLNADMISSVDLSDAKKVMALLSTEKSSSLKQEPQLPEIKSVCNKICNATSGHFPLTSVGGSQKSTSNFNLSDVDHPLLEKFEAFQVNMPQKKNGSLISQILRSPLSWIEQRAPPVQMLELRHICKQVEEQHVREKRALSVKDLHSNREHGDGEKNIGKIVDVQGSQSNPDRASEWSGCSDDEQETGGSNVVQSTKEAPAAASSGPSSKNKPQKKKKSKKSKRSGRK</aaseq>

Gene Sequence

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