Difference between revisions of "BGIOSGA020494"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA020494

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA020494, complete gene.

LocusTag

OsI_24556

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA020494-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA020494-PA

Length

12471

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:32893971..32906441

Sequence Coding Region

32905169..32906441,32904694..32904766,32904047..32904104,32903385..32903507,32903100..32903157
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,32893971..32894080

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGGGATCTCCGCCGCAGCCAGAGGCAGCGGCGTTGGATCTTCCGTCCCTGAGGCTCCGGTGTTCCGCCCCACGGAGGAGGAGTTCGGCGACCCCCTGGCGTACGTGGCCCGTATCCGGCCCCTCGCCGAGCCATACGGCATCTGCCGCATCGTCCCGCCGCCCTCCTGGTCTCCTCCCCCGGCACTCGACGTCTGCACCCTCTCTTTCCCCACAAAGAGGCAGCCCATCCACCGCCTCCTCGCCCGCCTCGCCCCCGCTGATCCCGACACCTTCCTCCTCGATTACCGCCGTTTCCTCCACCGACACCGGGGCCGCAAGAAGCCAAAGCCAAAGTTGCCTGCCCTCTCCGACGGACGCCCGCTCGACCTCTGCCGCCTTTTCCACGCTGTCAAGCGCTTCGGCGGCTACGACGGCGCCTGCGCGGGGAAGCGCTGGGCCGACGTGCTCCGCCTCGTTGATGACAAGGCGCCGAGGCATGCCTCCTCCGTCTCCGAGCACGTCATCGCGCAGCTCTATTATGAGCATCTCTATCAATATGAGCACTTCACAAACAGATTGCCATCACAATCACATGATGATCAACCGCCGGTTTCTGCTTCCTCTGCTAATATTAGTATTAGGCGCCAGAAGAAAAGGCTTAGGAAAACCAGCAGCACAATGGGACACTGTGGAGGCAGCACTAGTGCCAAAACTGCAGCATCTGCTCCCAAGCAGAAAAGGAGAAAGGTTGATGCAACGGCTACTGTGGTCAATGAGGCAATGGATCAGGTCTGTGAGCAGTGTAATAGTGGCTTGCATGGGGAAGTCATGCTGCTCTGTGATCGCTGTGATAAGGGATGGCATCTATATTGCTTGTCTCCACCACTCGAGAGTGTGCCTCCGGGAAACTGGTATTGCTCAGAGTGCATGAACTCTGATAGGAATTGTTTTGGATTTGTCCACAGGAGGAAGACTTGCCAAGTTGAAACTTTCCGGAAATTTGAGGAGAGGGTGAGAAAAAGGTGGTTTGGACACAAGAATCCCAGTCGTGTTCAGGTTGAGAAGCAATTTTGGGAGATTGTAGAGGGAAAGGTAGGAGAGCTTGAGGTTATGTATGGGAGTGATTTGGACACTTCAATTTATGGAAGTGGGTTTCCTCGCCTTTGTGATCCCGTGCCATCGTCGGTGGACCCAGTTATGTGGCACAAGTATTGTTCGAGCCCATGGAATCTGAATAATTTCCCAAACCTACCAGGCTCAGTTCTTCAGACAGTCCGGGATAACATTGCTGGTCATCTGATGTCTAATCATAGAGCCGCTGTGAGTGCTAGTCTTTTTCACCTACACAGTTACTCCATGCACGTGGGTGAGCCGAAATGTTGGTATGGGGTACCTGGAGCAGAAGCAAATGCTTTTGAGAAGGTTATGCGCAATGCTTTGCCTGATCTATTTGATGCACAGCCTGACCTGCTTTTTCACCTTGTCACAATGCTGAGTCCATCGATTTTACAAGCAAATGGTGTTCCTGTTTATAGTGTGATACAGGAACCTGGTAACTTTGTGATTACTTTTCCTAGGTCATTCCATGGTGGTTTCAATTTTGGTTTAAATTGTGCTGAGGCTGTAAATTTTGCTCCTGCCGATTGGTTACCTCATGGTGGCATTGGTGCTGAACTATATCGCCTGTACCGTAAAGCACCTGTTTTGTCACATGAGGAGCTTTTGTATGTGGTTGCAAAGAACGGCGTGGACAATGAATCACTTCCCTACTTACAAGGAGAAATAGAGAGGCTATTTGTGAAGGAGAAAAAATGTCGTGAGGAGCTATGGATTACTGGGATTGTCAAATCCAATCTGATGCCACCGAAGAATAATCCAAACTTCATTGGAAGTGAAGAGGTAGATCTACTAGTATATCGCCATCTCATGTCATGGCTGTCTTCGTATGTTTGCCTTGAGCACTGGAAGCACCTTTGTGAATGCAGTCCAGAGAAACATCGCTTACTTTACCGCCATACCCTTGCAGAGTTGGGTGATTTAGTTTGTGAGGTCTCAAAGGCTAATCTACCAAGGGAGAATGTTAAGCAGAACTCCCTTTTACATAGTGATGTTTTTTTGCCAACGAGAAAGGACAAAGATCAGTATATGTCATATACACAACTTGCAGAAGACTGGCTTTCAAAAGCTGACCATATTCTCCATATGCCATTTTTAGATACTGCATATGCCACTGCCTTAGAAGATGCTGAACAGTTTCTTTGGGGTGATCATAATATGGATTCTGTGCGGAATATGTCAGCAAAATTAATAGAAGGTAGGAAATGGGCTTCCAGTGTTAGAAAATGCCTCTCTCAAATTGATGGCTTTCTTCATTGTAAAGAGAATTGTTCCGAGAAAGTAAATTATGTGGAAATCAAAGAATTAGCTGCTGTAAGATGCAAACCATGTTATGAACCAAGTCTTGCACAATTGCAGGTATATGTGGACAAAGGAGAAATAATGATTAATGAGATAAACAATGCATTATCATCTCGCTCAAAGGTTGATTACTTGGAAACACTGTACTCTAGGGCTTTAGAGTTCCCGGTTGAACTAACAGAAACATCAGCACTGTCTTGTGAGATTTCTTCTGCAAAGTCCTGGTTGAAGAAAGCATGTGATTGCCTTGAACAGAATAAACGGGGCATCGTCGACATAGATTTCCTAAATGAACTGAAATCTGAGATGGTGTGCCTTCGAGTGTTAGTTCCAGAAATTAATCTTGTTTCTGAGCTGTGGAAAGAAGCTGAAGCATGGAGAATACGTTGTCGATCCTACCTCCAAGACCCCCCCAGCCTTAAGGAGTTGGAGAGCTTCCTTCTTGTGGTGGATGGTGCCAACTTCAGTATTCCAGAGCTGAACATTCTGATGCAACGGTATTCAGGTGCTTGCTCATGGGTCAATCATGCTAATAACATAGTCGGCAAACTTCTTGAAAGGAATGATTATGACAACATTGTTGAGGAGTTGACTGGCATTCTGAAGGATGGAGAATCACTAGGAGTAAAAGGCATGTTGTTTGAGGAATTTTCCGTTGTTGAGGAAGAGCTAAAGAAATCCTTCTGCAGGAGGCAAGCATCCGAGGCTCTTGCAACACGAACATCTATGGAGGTGGTCAAAGAAGTGCTGAAAGAAGCTTCCATATTAACCATTGAAGAGGAGCAACCATTTGTTGATCTGTCCCATAACCTCAAAGCTGCCATCACTTGGGAAGAGAAGGCTAGCTTTATTCTTGAGCACTCAGCTGCTCTCCCTGAGTTTGAAAACCATATTCTGTGCTCAGAGAACATACATGTTATCCTTCCATCTGAACTGGATATGAAAGCAGAGGTTGCTACTGCTAAGTTGTGGATGGACAAATGTCAGGCCTATCTGAGGCCTAGAAGTGATAAACCTGCATCTGGAGGTTTTCTTAATGTTGATGACCTAAAGGATTTAATCGGCCAGCCTGCAAGTATGAAAGTCATTCTTGACACTTCTGCAATTAATTCTGTTCTCAACAATGTCATAGAATGGGAGCATAATTCACTAAGTCTGATACACAGTTCAAGATCCTTACTGGATTCAAATGTAATCGACTCTACTATTGATCCACTTAAAAGAAAACTAGAGGAGCTGCAAGATAAAATTAATGCAGAAATAGAAAAAGGACTATCTCTCGGTTTTGAATTTAAGGTTGTTCATGAGCTGAAGGATTCTTTTTTCACACTTGGATGGATATTGAATGCATTGTCTTTCTGCGGTGTGACTCCTTTGTTGCAGGATGCTGAAAAATTAATTCAACAAGCTGTCAACCTTCCTGCCTCATTGTCGGATTGTTCCTTAGCTGAACTATTGGAAATTGCTGTTCCTTATCCTATGATGATTGCCAAACTTGAGGATGCTATCAACAAGCACAATTCATGGGCAGAACAATGCAATGCCTTCTTCATGTTTCCTGATCATCAATCTTGGGATGGACTATTAAGCTTGAGGGACAGTGGTCAGTCTGTGGCATTCGATTGTACTGAGATGGATAAGGTGGTTGCTGAGATTAAAAAGATCGAGGAGTGGCTTACTCACTGCCACTGTACTCTGTTTCCTGATGGCAATAACAGTGATTCTTTGCTCTCCGCGCTTCTGAAGATTAGAGGATCAATGGACAATGCTTGTATGTTATATTCCGACTGTAACCAGAAAGGATTATGTGCCATCTGCTCTTGTGATGTGGGAGATCATATTACCCCTAGATGTATGATATGTCAAGCGAGGTATCATAGCTCCTGTGTCGAACCACTGCCTGCTTCTACACAAGTGACTCGTGAATGGACCTGTCCTTTTTGCTTTCATTTAGAAAGTGGGGACCCATTACAGAATAGACTACAGGAGAAGATATCTAAAGGGAATCGTCCAGCACTTCCTGCATTAATCGGGCTCCGCTCTTTTGCCAAGGGTTTCTATTCAGGGATTGAGGAGTTGGATTTATTAGAAGAAATTGCTGAGAAAGCTCATAAATTTAAGTCCTACCTTATGCAAATATTGCATGATGCAGACTCTTACCATGGAGAAGATCTTAGTGTCATGCACAGATCTCTTTTGATTGCTCTAAAGGCAACATCGGCTGCTGGCTTATATGATCACCAGATCAGTTGCAGAATTGAGTCAATGTTGAGCAGATATTCCTGGAAAAAACGAATACATATTCTCTTGTGTGGTGGAAAAAAGATACCGATCCAACAAGTACTGATGCTTGATAATGAGGGTTCAAGTTTAGAGATATGTGGTGAAGATTTCTTCAAGTTGGAGATTAATAAAATAAAGGAAACTAGTCTGCAGTGGCTGGCCAAAGCAGAAAAGACTACACTTGATTCTGGTAAGCTCGCCCTTGACCTTGTGTATGGACTTATTATTGAAGGCGAAAGTCTTACTGTGCATGTTGAGAAGGAACTGAAGTTACTACGAGACCGCAGTGTTCTATATTGCATTTGCCATCAACGACCGAAGCAGGACCTCACACCCCTCCGGCATCTTGTGAAGCAGCAGGAAGAGTGGGAGCTATCCAGTGCAACAGTAGTAGCCAATGGGAGAAAACACATGTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MGISAAARGSGVGSSVPEAPVFRPTEEEFGDPLAYVARIRPLAEPYGICRIVPPPSWSPPPALDVCTLSFPTKRQPIHRLLARLAPADPDTFLLDYRRFLHRHRGRKKPKPKLPALSDGRPLDLCRLFHAVKRFGGYDGACAGKRWADVLRLVDDKAPRHASSVSEHVIAQLYYEHLYQYEHFTNRLPSQSHDDQPPVSASSANISIRRQKKRLRKTSSTMGHCGGSTSAKTAASAPKQKRRKVDATATVVNEAMDQVCEQCNSGLHGEVMLLCDRCDKGWHLYCLSPPLESVPPGNWYCSECMNSDRNCFGFVHRRKTCQVETFRKFEERVRKRWFGHKNPSRVQVEKQFWEIVEGKVGELEVMYGSDLDTSIYGSGFPRLCDPVPSSVDPVMWHKYCSSPWNLNNFPNLPGSVLQTVRDNIAGHLMSNHRAAVSASLFHLHSYSMHVGEPKCWYGVPGAEANAFEKVMRNALPDLFDAQPDLLFHLVTMLSPSILQANGVPVYSVIQEPGNFVITFPRSFHGGFNFGLNCAEAVNFAPADWLPHGGIGAELYRLYRKAPVLSHEELLYVVAKNGVDNESLPYLQGEIERLFVKEKKCREELWITGIVKSNLMPPKNNPNFIGSEEVDLLVYRHLMSWLSSYVCLEHWKHLCECSPEKHRLLYRHTLAELGDLVCEVSKANLPRENVKQNSLLHSDVFLPTRKDKDQYMSYTQLAEDWLSKADHILHMPFLDTAYATALEDAEQFLWGDHNMDSVRNMSAKLIEGRKWASSVRKCLSQIDGFLHCKENCSEKVNYVEIKELAAVRCKPCYEPSLAQLQVYVDKGEIMINEINNALSSRSKVDYLETLYSRALEFPVELTETSALSCEISSAKSWLKKACDCLEQNKRGIVDIDFLNELKSEMVCLRVLVPEINLVSELWKEAEAWRIRCRSYLQDPPSLKELESFLLVVDGANFSIPELNILMQRYSGACSWVNHANNIVGKLLERNDYDNIVEELTGILKDGESLGVKGMLFEEFSVVEEELKKSFCRRQASEALATRTSMEVVKEVLKEASILTIEEEQPFVDLSHNLKAAITWEEKASFILEHSAALPEFENHILCSENIHVILPSELDMKAEVATAKLWMDKCQAYLRPRSDKPASGGFLNVDDLKDLIGQPASMKVILDTSAINSVLNNVIEWEHNSLSLIHSSRSLLDSNVIDSTIDPLKRKLEELQDKINAEIEKGLSLGFEFKVVHELKDSFFTLGWILNALSFCGVTPLLQDAEKLIQQAVNLPASLSDCSLAELLEIAVPYPMMIAKLEDAINKHNSWAEQCNAFFMFPDHQSWDGLLSLRDSGQSVAFDCTEMDKVVAEIKKIEEWLTHCHCTLFPDGNNSDSLLSALLKIRGSMDNACMLYSDCNQKGLCAICSCDVGDHITPRCMICQARYHSSCVEPLPASTQVTREWTCPFCFHLESGDPLQNRLQEKISKGNRPALPALIGLRSFAKGFYSGIEELDLLEEIAEKAHKFKSYLMQILHDADSYHGEDLSVMHRSLLIALKATSAAGLYDHQISCRIESMLSRYSWKKRIHILLCGGKKIPIQQVLMLDNEGSSLEICGEDFFKLEINKIKETSLQWLAKAEKTTLDSGKLALDLVYGLIIEGESLTVHVEKELKLLRDRSVLYCICHQRPKQDLTPLRHLVKQQEEWELSSATVVANGRKHM</aaseq>

Gene Sequence

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