Difference between revisions of "BGIOSGA021465"
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Revision as of 16:36, 22 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA021465 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA021465, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_22505 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA021465-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA021465-PA |
| Length |
13921 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:10140345..10154265 |
| Sequence Coding Region |
10154139..10154265,10151962..10151984,10151701..10151796,10150807..10150978,10149749..10149864 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:10140345..10154265 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:10140345..10154265 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGCGGGCGCGGGGGACGGCGACCAGAGGTGGCTGGTGGAGTGCCTGACGGCGACGCTCGACACCGCCCGCGACGTCCGGGCCTTCGCCGAGGAGTCGCTCCGCCAGGCCTCCCTGCTCCCCGGATATGGAGCTGCCCTCACAAAATACCTTGCTGCTGTCTTGCTAAAGCAGTTCATCAAACAGCATTGGCAGGAAGACGAAGAGAATTTCATGCCTCCTGTTGTTTCTGCCTCGGAAAAGGTGATTATACGGCAACTCCTCCTTACATCGTTGGATGATTCTCACGGGAAGATTCGTACTGCTATTGGCATGGCTGTAGCAGCTATTGGGCAGCAAGATTGGCCTGAAGACTGGCCTGAGTTACTTCCCTATCTCTTAAAGTTAATTTCTGATCAAAGCAATGGTTGTGGAGTTCGTGGAGCATTAAGATGTCTAGCTCTTTTATCGGATGATTTGGATGATACATGCATTCCAAAATTGGTGCCAGAACTTTTCCCTTCATTGTACAGTATAATATCATCTCCTCATAGAGAAACAGTCAGTTTGATAAGTTCAATGCTTGATCCACTCATGGAGCAATTCTCTGCAATTTTGAATTCACCGGTGCAGTCCCATAATCCTGATGACTGGAACATGCAGATGGAGACCTTTGTCTCATCCTTCAAGGTCTATCAATTGTCAATGATTCAAGCCTCGGAAGATGTGGATTCTGTTGGGTATGATTCTGATGGTAGTGAAAGAAGTCTGGAGTCTTTTGGGATTCAGTTATTTGAGCTATGGATATCAATTGTGGGGAATTCACGGTTAGCAAAGATCATTGCTGGGAACATTAAAGAGCTAGCATATTATACTATAGCGTATCAACAGATAACTGAAGAACAGTTGCAAAACTGGTCACGTGATGCTAACCAATATGTTGCTGATGAGGACGATGTGACTTATAGCTGTCGCGTATCTGGATCTCTTTTGCTGGAAGAGATAGTTACTGCTTACGATGAATACGGAATAGAGTCAGTTTTGGAGGCTTCACAGATGCGTTTTCATGAATCACGTGAACTAAAGAAAGCGGGTTCTACTGACTGGTGGAGACTGCATGAAGCATCATTTTTTGCTCTAGGTTCACTTTCCGAACAGCTCTGTGAAGCACAGGATTCTGGTTACAACGTGCGAGATTTACTTGAGCAGATGGTAACTGACACTGTGGGAACAGAGGTGCACCAGTACCCGTTTCTTCATGCACGTGCATTCTCCATTCTGTCTAAGTTCTCTTCAGTGATAAGTAAGGAAATCTGCGAACAGTATCTATGCAGTGCTGCTCATGCAATTGCCTCAGATGTACCTCCCCCAGTTAAAGTTGGTGCTTGTAGGGCACTGGCGCAACTTCTGCCAGAATCTAACCAGAGCTTGAATGTGCCCAACATTATGGGCATACTCTCATCTCTTGTTGATCTTCTGGGGAAGGCATCTGATGAAACGCTGCATCTTGTTCTAGAAACCCTCCAATCAACCATCAAATCTTGTGGTGAACAGTCAACATTAATTGAGCCAGTCATCTCTCCTATCATCCTAGATGTTTGGGCCCAACATATTGCTGATCCATTCATCAGCATCGATGCTGTTGAAGTGCTAGAGGCCATCAAGAATGCTCCTGGATGTTTAGAACCACTTGTATCACGGATTCTGCCAACAATTGGGTCCATTTTAGAAAAGCCCAAGATCCAGCAGAACGGTCTTGCTGCAGGCTCACTGGACCTGTTGACGATGATACTGAAAAATGCTCCAACTACTGTGGTTAAGGCGATCTTTGATACATGTTTTACATCTATTATTCAAATCGTTCTTGAAAGTGATGACCATGGAGAGATGCAGAATGCGACAGAATGTTTGGCAGCATTTATATCGGGTGGGCGGCAAGAGTTGCTTCTCTGGGGTGGTGGACAAGGACGTACACTGAAGATGCTACTCGATGCAGCTTCAAGGCTTTTAGATCCTGTGTTGGAAAGTTCAGTATCACTATTTGTCGGGAGTTATATTTTACAACTTATTATACATCTGCCTTCACACCTATCTCCCCACTTTCCTGAGCTTATTGCTGCTATTGTGAGACGTATGCAATCCAGCAGCATTACTGGATTGAAGAGCTCTCTTGTTGTTATAGTAGCAAGACTTGTACATCTGAGTGCACCAAATGTTGATCAGTTTATCAACCTCTTACTTGCAATTCCTGCTCAGGGTTATAACAATTCACTTGCTTATATCATGTCTGAATGGTCACAGTTACAAAGTGAAATTCAAGGAGCCTATCAGATAAAGGTTACAACCACTGCATTAGCTCTTCTCATATCTACTCGTCATCCTGAGTTATCTAGGATTGAAGTCCAAGGGCATATTATTAAGACTAGCGCAGGTATAACTACACGGTCAAAAGCTAGGGTGGCTCCTGATCACTGGACCAAGATTCCACTCCCAGCTAAGATCTTCTCACTGTTAGCAGATACCTTAGCTGAAATTCAGGAACAAGTTGTTGGTGATGAAGACGATTGTGAAGAGGATAGTGACTGGGAAGAGATTCAGAATGGTGATTCTAGTATTCCACATGATATGATATACTCAGCATCAGTTCCTTCAAATGCTAAGCCATCAGTTGAGCATCTAAATGCAATGGCGAAAGTTTTTGATGAGGATGACGACGGAAGTTATGATGATGACCTGGCAAAAGCTGACTCTCTTAATGAGGTGAAGCTGTCGGACTTTCTAACAAACATCTTTGTCAAATTGTGGGAGAGTGATCGGCTGCTTTTTGAATATCTTTGCCAGGCCCTAACAGATTCACAGAGGACTGCTGTGGACAAAGTTTTGAGGAAATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAGAGDGDQRWLVECLTATLDTARDVRAFAEESLRQASLLPGYGAALTKYLAAVLLKQFIKQHWQEDEENFMPPVVSASEKVIIRQLLLTSLDDSHGKIRTAIGMAVAAIGQQDWPEDWPELLPYLLKLISDQSNGCGVRGALRCLALLSDDLDDTCIPKLVPELFPSLYSIISSPHRETVSLISSMLDPLMEQFSAILNSPVQSHNPDDWNMQMETFVSSFKVYQLSMIQASEDVDSVGYDSDGSERSLESFGIQLFELWISIVGNSRLAKIIAGNIKELAYYTIAYQQITEEQLQNWSRDANQYVADEDDVTYSCRVSGSLLLEEIVTAYDEYGIESVLEASQMRFHESRELKKAGSTDWWRLHEASFFALGSLSEQLCEAQDSGYNVRDLLEQMVTDTVGTEVHQYPFLHARAFSILSKFSSVISKEICEQYLCSAAHAIASDVPPPVKVGACRALAQLLPESNQSLNVPNIMGILSSLVDLLGKASDETLHLVLETLQSTIKSCGEQSTLIEPVISPIILDVWAQHIADPFISIDAVEVLEAIKNAPGCLEPLVSRILPTIGSILEKPKIQQNGLAAGSLDLLTMILKNAPTTVVKAIFDTCFTSIIQIVLESDDHGEMQNATECLAAFISGGRQELLLWGGGQGRTLKMLLDAASRLLDPVLESSVSLFVGSYILQLIIHLPSHLSPHFPELIAAIVRRMQSSSITGLKSSLVVIVARLVHLSAPNVDQFINLLLAIPAQGYNNSLAYIMSEWSQLQSEIQGAYQIKVTTTALALLISTRHPELSRIEVQGHIIKTSAGITTRSKARVAPDHWTKIPLPAKIFSLLADTLAEIQEQVVGDEDDCEEDSDWEEIQNGDSSIPHDMIYSASVPSNAKPSVEHLNAMAKVFDEDDDGSYDDDLAKADSLNEVKLSDFLTNIFVKLWESDRLLFEYLCQALTDSQRTAVDKVLRK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..127#2282..2304#2470..2565#3288..3459#4402..4517#4773..4889#5136..5255#5695..5742#6038..6106#6215..6290#6847..6977#7276..7335#8483..8543#8612..8676#8747..8808#8887..9010#9086..9143#9243..9355#9819..9896#9989..10051#10153..10248#10343..10452#11053..11242#12271..12385#12479..12591#12673..12750#13091..13165#13242..13373#13456..13509#13597..13677#13871..13921#ATGGCGGCGGGCGCGGGGGACGGCGACCAGAGGTGGCTGGTGGAGTGCCTGACGGCGACGCTCGACACCGCCCGCGACGTCCGGGCCTTCGCCGAGGAGTCGCTCCGCCAGGCCTCCCTGCTCCCCGGTTCGCCACCTCTCCCTCCACTCCCCTCTCCGTGTGTGTCTGGGCGTTTGATTATCGGGCTGAAGATGAATTTTGTTTCGAGTTGTTTCGGCCATCTCCTTCTCTTGAACTGTGTGCGCCTAATGGGCGCCGGTTGCGTGGTTGACGCCACTATTGCTCCAAAAATTCTGTTAGCAGATTGACATGAAGGGAGCTGAGCTCAATTTTAACTGAGACCGTTGTAGATGTTTGCAGTCCTTAATTGCTTTAGAGGATGTCAAAATGTTGTTTCTTTGTGGCAACGTGAAGGAATACATCCGCCTTTCTTTTTAAACCTGAAATGATCAGTGGTGTTCTTGTTGCTCTGTTGTCCTGGATAGGCTTCACTCTCTTTAGTGAAAGAACTATAGAGAACTACTGTTTTCCTTGCTGGATAAACAGAAAACAGTTTTTTAGCATAAACATTGTAAACTTGTTGGCTTGCTGTACATGTTAAAAGATTCATGCAACTTATTTGCACTAAACATCAATCTCATTGTAGCCTTTAACTATTTAGTACCCAATGCCAGATTTTTTTTTTGCTGGCCCGGCGAATATGCCAGCTGAACTTTTACTAAGAAGGAAGAGATAGTTTACAACAGGTTACCATACACACGCCAGCCAGGGTAAAGGAGCCCCTGGCGCCCACTACTGCTACAGGGGCCGAGTTACAGGGACAGAAACGTCGATACTCACAATGAACTTAGCAACTCTGCCGACTTCCATGAACTTAGCCACCATTCTTCTTCGATGGCTGCGCACAAGCACACGAAGTGATTGATGCTATTTTAGTTTTGGCGAAATTGGTTCTAGAGCATTGAAAGTTCACGTTTTTGTTTCTATAGTACCAAAAGTTACCGGTTCACTTTAATAGTACCGTAAGTTTTCGCCGTTTCCGTTTTTAGCACTTCCGTCAATTTTGTGCTGTTCTGCTGTTCACTTTGACCAGGATTGATTCTGCAAACTGCGCCAATTGAACTCCTTGCCCTTTTGTATGGCCTTCTTGCCTCCCAGTCCCAGCCTGTCCCCTCTGCTTGCTGCGATGCAGCCCTCGCCTACGTTACCACTGCCGCCGCTGCTCTATCGCGCCGAAGGTGTGGACGGCGGGAGGGTGTCTCTGGCGGCCTCACTCGCCCCGTCGACGCTACTGCCCCGTTCGTCGCTTCAGCCTCATGCTGTTGCCGCCACCCAGTCCATCAGCAGCACCTACGTCTCCAGCAACCTTGCCCTATCAACACGGCTCCTGCGTCCATGCCTAGCATGAGCCCCTCTTCCAACCAACAGCAATCTGGCGACATCATCCGTCAGTCGACAGCGTGCACCTCCTGCTAGCTAGCACCCCATCGATCACCAAACTCTTTTTTGAAATGTTTATTTCCTTCCTGCAACAGAATATAATTGCTGTTCAAATTGATAATTTGCTGGCTGCAAAAGAATGCCCTTATCGATTTTCCATGTGAGAGGAGATTAGACTAACTAGCAGATTAAGCTTCTTTTTGTTGCCGATTGTTCATGTGCACTTGAAAGTTGAAACCAGCACCGACGATTCAGGCGTACGGGCAGGCGGCGGTGCACACAAGCAATGCAAGAACGAACAGATGGCGACAGAAACAGAAGCTTGCTCGATTAACTCCCTCTGTTTTCTGCTTGCGTGCGTGGTTGAGTCAATCGTGGTCAAAGTGAACGGCAAACGACAGAAAAGTGACGAAAGTGTTAAAAGAGGAATGAAGGGAACTTTCGGTGCTATTAAAGTGAACCGGTAACTTTCGGTGCTAGAGAACCAAAAACGTGAACTTTCGATGCTTTGAAACCAATTTTTCCTAGTTTTGGCCACATCAGAAGTGATTGATCAGACCATTTTATTACATGCATGACAAAAACAGAACCATATAGTCTGGCTCTATAGCATCCAGTCCACATGCTCAATCTTGGTAGCGTCTTATGGGTTTTGCTCTATTGGTAATTGGCCTATCAGTTTAAAGCAAGTAAACTTTTGACCACCCAGCTGTTGGAGCAAATGCTTTAAATTGTTTGTTATTCTTCCATTTTTTTAATGGATAAAGTGCCTATTCCCACAGATTAATCTTATTATACAATCAGTTAACAAGGCCTGCTTTTATTGTAATTTTTACTCAGGATATGGAGCTGCCCTCACAAAAGTCACAACGAACAAGGAAATCCCATTTGGGTTACGTCAGATATCCTTAAACCATTTAATGAAGTTATTTTATGCCCAAAATTTGTAGCGCATACCCTTTCTCTGTTAGATTTGGCTTTCACACATTCTACTTCCAATTGTTGTTTGTTCGTCCTTCACTCCTCAGTACCTTGCTGCTGTCTTGCTAAAGCAGTTCATCAAACAGCATTGGCAGGAAGACGAAGAGAATTTCATGCCTCCTGTTGTTTCTGCCTCGGAAAAGGTACCATCATGCACTTTCAATCCTCTGGATAACACTAATTAGACTCAGTCCGTAACAGGCCCATGGTGCCATTCTTTTCTTTTCTCCCTTGGATTGTCAATACAAATTGTAATTCATGTGCGTGGTGTTATCTTCTCGCAGCAAGCACTATTTTCATGCTTGAAAACTTCTCATGTCAGAAGATTGTGAGTAATGATTAATGAGACAAGAGGTCCACATTATTACAACAAATATTCCACATGCATAGCTTGAATTGCTCATATTTTTTGATGCATGGTATCCCTTACTGTTCTAATCAATGAAAAAAAATTTAAAAAATGGTATAAATTGCAAGGACCATGGTGTCATGGCAATAGGGTGTCGCATGTCATGGTACAGCCAGCCTGCATGTCAGGCCCAGCAGCTTGTGGACAGGGAAGCTCCTACTTGCTATTTGTTTAGTTTGTTTCTTAGGCCTTAAGCCATTTCTGGATACGATCAGTTATTTGATTAATTAAGCATAATACTGTTTGGTAGGGCCATTCCATCTCTATTTCAGGTTGCTGACAGATCATTGTATGACAAACAAGAATTAACCAAAGACACATTAATCTAATTCTAATAGTTCACTGCAATCTAATTCTAGCATGTGACACTGACACATGGGCTTACTATGTAAATTATTGTTTTCTAATATGATATATTCTTATCGCATTATTTTGCTTCTCCTTATTTATCATTAGGTGATTATACGGCAACTCCTCCTTACATCGTTGGATGATTCTCACGGGAAGATTCGTACTGCTATTGGCATGGCTGTAGCAGCTATTGGGCAGCAAGATTGGCCTGAAGACTGGCCTGAGTTACTTCCCTATCTCTTAAAGTTAATTTCTGATCAAAGCAATGGTTGTGGAGGTATAGAGAATTCTTTTGCTTCCCAATATTTTTGAAACCAGGGTGTGCAGCTATTTTAGAGGCCTTTTTAGAGTCATTGAGCTTAAACTTAGAGCTGCTGGATTCCTTCCAGCATAGCTCTTCCAAATAAGCTGTTTTTGTCACAATTTCCTGGACAAGCTGTAGGCCCTGGCTGAGATTTCAGCAGGTTTAATTTCTTTAAATAGCTAGCTTCTAAGAGAAACTGGTGGAGAGGTGTAAGATTCCTTAAGAAACTGCCCCTTTTGTGAGGGTTTTGTCTTGCTATGTCTTTCATCTGAAGCTTAAGCAATAGGAAACAACCACAAACTTATTTGTCTAAAGAAGTTCAAATGGCATCCATTAAAGCGAACTATTCTATGTTGCATGGTACAAACATGGGTATGGTACGCAACAGGCTACTACATATATGTAGGATTGATAATAGTATGAGAATTCTTGTTTCTGGATTGACTTATATAAATGGTGTTCTATTCAACACTATCAGGAAAAGTTGTAATTTTTTAACAGTTTTGTCCCTCCACCAAAAACTACAGGTGTTTATAATAAAATGAAAATTGCACTCGTCTACTTTTGTTGTTGTTGTTATAGTGTTTCCTTCCTTTGAAAAGAATGGTTACGAATTGAACAAAAAGATCCACTTCTGGCATCTTCTTTAAGCTCTCCTGTTTTATGCTTCGCCATGTTGGTGGCTGTGTCAGTGTCTGACACTAGTACCTAGCTTACACTACTAGAATTCTAGTTTTAGTGCTACATAGTCTAAATAAGAAAAAAAACATCTTAGGATGCTCATATGGCCCTAACACTGACTACTAAGATGATGAAAATATTCTAATTTTGGAATTTGTACATTCTTTTTCTCTCTGAAATCAGTTACATGAATTTAGTAATTACCTATTACAACTTTCAACTTACTGTCTGTAGTTCGTGGAGCATTAAGATGTCTAGCTCTTTTATCGGATGATTTGGATGATACATGCATTCCAAAATTGGTGCCAGAACTTTTCCCTTCATTGTACAGTATAATATCATCTCCTCATGTAAGTCTCATACTGTTTAATGTCTGTTAAATTTCTTTTATCTAACTGCTATGGAGGCATTTATTTGTTTATCCAATTTTGAAAAGCAGCTGTACGAAAATTCTCTTCG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