Difference between revisions of "BGIOSGA022433"
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Revision as of 16:41, 22 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA022433 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA022433, complete gene. |
| LocusTag |
OS06G0184700 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA022433-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA022433-PA |
| Length |
13757 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:4842947..4856703 |
| Sequence Coding Region |
4842947..4842976,4844292..4844456,4844638..4844685,4844900..4845000,4845686..4845755 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:4842947..4856703 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:4842947..4856703 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGATTTCGTCTGCCCCGGCGATCCCGCGAATGTCAGGATGGGTTTTCTGGAGAAGTTGTTTGTTTTCGGTGTGCCTGGTTTTGCAGCCTGCCTTTCTTTTCTTGAAATAGTTATGCTTATAAAGAACAAAATTGAGGGGAAAGATGTTGCGAACTACGAGTCGTTCTTCAGGTCCTCCCAGTTTCTTGTGTGGATTCTTCTTGAGATACCTCATTTGCAGTACAAGCTCACAGTATTAAAGGCAGTGTTATATTTTAAGGAGATCATCTCATTCTCTATGGCAATTGTATTTGGCCTCTTTGTAGCTGTGTCTACTATAGTGGACCAACCACGCAATAAAAGAGAAATGAACTCTATTGAAGATCCCCTTGTTCCAGATGATGAAAAAGCTGAGGCTGAAGTGACCAACTTGGAAAATAACCAAAGTATCTGGGAGTTGTTGACCTTCAAGTTCGTTAATCCAATGATGGATATTGGGATCACAAGACAACTCGATTTCACTGATCTACTTGAATTGCCAGTTGAGCTTAGAGCTGCTTCCAGTTATGAGAAACTTCTGTCTTCATGGACTGTTGAACATCAACATCACCATGCTGATTCATCTCTACTTAGAGCCATGTCTAATGCTTATGGATGGACTTACTTCCGTTTGGGACTGTTAAAGGTGATAAATGACAGCATTGGTTTTGTTAGCCCACTTTTACTCAACAAGTTTATAAAATTTCTTCAACAAGGTTCTGGTGGTGCTGATGGATATATACTTGCCATTTCCCTAGGATTAACTTCCATTATCAAGTCGTTTTTAGATAGCCAGTACTCCTTTCGTCTAGCTAAGCTAAAGTTGATGTTACGATCAAGCATCATGGGAATAATTTATCGGAAGATAGGAGTTGCTCTCTATCTATTGTATACTCAAGTGAACTATGCATTTTTATCTGGATTGGCAATAACAGTCATACTAATACCAGTGAACAAATGGATCTCTACAAGAATAGCTCATGCGACAGAAGAGATGATGAAACATAAAGATGAGAGGATAAGTTGTGCAGGAGAACTGTTAGCACATATTAGAACAGTGAAGATGTACAGCTGGGAGAGATTATTCACTCAACGTTTGGTGGAAAGAAGAGAATTAGAAGTGAAGCATCTTGCGGTCTTCACTTGTGTTGCACTGTTCAACACATTGATATCACCATTAAACTCATTCCCATGGGTTATTAATGGAATGATTGATGCTGTTATCTCTAGCAGAAGGTTGAGCAAGTACTTATCCAGTCCAGAGAAGCGTTCTTCTGCAATACCTGCCTCAGCTGATCTTTTAAAGCATCACAATACTGAAACAAATGTCAATGCCATGGCTGTTATCCTACGTAACGTTTGTTGCTCTTGGTCTAGCAGTTCTATTGTTGAGTCGAGCATGATTTTGAGAGACGTATCTCTGGAGCTACAGAAAGGAATTTTTGTTGCAATCATAGGAGAGGTTGGTTGTGGCAAATCATCTTTGCTGAACTCTATCATTGGAGAAATTCATGTTACCAGTGGTTCCGTTACCTCTTATGGTTCAATTGCATATGTACCACAGGTGCCTTGGATACTGTCTGGTTCATTGCGTGATAATATTTTGCTTGGAGAAGAATTTGATCCAAGGAGGTACGAAGAAGTGATACATGCTTGTACCCTTGATGTTGATATCTCAGCAATGGTTGGGGGAGATATGTCACATATTGGAGAGAAAGGTCTTAACTTATCTGGCGGACAAAGAGCCCGTTTAGCCTTAGCAAGGGCTTTGTATCATGACTCTGATGTTTACTTGTTTGACGATGTACTTAGTTCAGTTGACTCACAAGTTGCTTCGTATATCTTGGAAAAAGCCATTATGGGGCCCCAAATGAAGAGAAAAACACGAATATTAAGCACCCACAATCTTCAGGCAATTTCCGCAGCAGATATGATAGTGGTCATGGCTAACGGGCTTGTTAAGTGGTTTGGGACGTTGGACTCTTTCTTAGCAACTCCATACTCGACACTGTCTAAGCCAGAGAGTTCAAGGGTTATCTCATCAACATTTTCTGAGAAAAACAAAGGAGTGAGCGTCGCCCATGAATCCGAGACTAATGGCCTGATTGACAATGACTCCGAGACTAATGGCCTGATTGACAATGACTCAGTAGTTGATCACGAGGAACAAAGAGAGCAGAATTCTGTAGAGGCCAGGAAAGAAGGCATGGTAGAGCTTAGTGTGTACAAAAAGTATGCAGCATTCGCGGGATGGTCGATTGCTTTTCTGATATGTCTAAGTGCGTTCTTAATGCAAGCATCTCGTAATGGCAATGATCTTTGGTTAACTTACTGGGTCGATACCAGCACAGGTTCCTCACGCACAATATTTTATCTTATTATCCTTGCTGCGTTTGGTGCATTGAACTCTTTTTTCACATTGGGAAGGGCATTCTCTTTTGCATATGGTGGTCTCTGCGCAGCAATTCAAATACATGCTGATCTTCTTAATAATCTAATAGGTGCACCAGTTTCATTTTTTGACCAAAATCCTAGTGGCCGGATACTGAACAGATTATCCTCAGACCTATATGCCATTGATGATTCTCTTCCGTTTATCCTCAACATATTCGTGGCAAACTTCTTCAGCTTGCTTGGTACTCTGGTTGTATTATCTTATTCACAGGTTTCATTCTTACTGATCTTAGTTCCTCTCTGGCTTATCTACAGAAAAGTACAGGTCGGCCTGGCGCTGTCATATGCCGCACCCGTTGTATCATTGTTGAATGGCTTCTTAACCACCTTTACAGAGACAGAAAAGGAAATGATTTCTGTTGAGAGAGTTGTTGAGTGTTGTTATCAGTATGTTGGCATACCTCAAGAAGAACTTCATGGATCGGAATCCCCTCACAGTGGCTGGCCAACAGAGGGGAACATTGAGTTTGAGCATGTTACTCTAAGGTACAAGGAGGATTTACCCCCGGCTTTGAATGATGTTTCGTTCTTTATTTCATCAGGCATGCAGGTTGGAATAATAGGGAGGACTGGAGCAGGCAAATCCAGTATACTGAATGCACTTCTTCGTTTAGCTCCAATCTGTAATGGCCGGATCTTAGTAGATGACTTTGATGTGGCCAAACTTGCTGTCCGAGATCTTCGTGGACATTTTGCAGTAGTCCCACAGAGCCCGTTTTTGTTCGATGGGTCTTTGAGGGAAAATCTAGACCCTTTTAATAGAACAACAGATCTCAGGATATGGGAAGCTCTTGATAAGTGTCATATGAAGACAGAGATTGAATCTATAGGTGGACTTGACATCCATGTGAAAGAAAGTGGTGCGTCTTTTTCAGTAGGTCAGAGACAGCTCCTGTGTCTTGCCCGTGCTATCCTTAAATCATCCAAGATACTCTGCCTTGATGAATGCACAGCTAATGTTGACAATCAGACAGCCTCCTTGTTGCAAAATACTATTTCTGCTGAATGCAAAGGCATGACAGTTCTGACGATAGCACATCGAATTTCAACAGTGATGAAGATGGACAGTATTCTAGTTCTTGATCAAGGAAAATTGGTTGAAGAAGGAAACCCAGAGGTTCTTGTGGATGACAAATTCTCAAGATTCTCACGATTTGCCAAGGCATCTAACATATGGTCATGGTCACGCGACGTAGATGTATTCGTCGGGGTCGACGCGGCGGCGGCGCTCGCGGTCGGGGTCGACGGAGACGATGACGTAGACGGCGTAGAGGACGCCGGGGAGGTAGCCGAGGATGGTGAGCAGCACGCTAATCCAGAACTCCATCTGCTCCCTCCCAACAACGCCAAGAGAAAAGAAAGAAATCATCAGAGGAATTTAATCAGCTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDFVCPGDPANVRMGFLEKLFVFGVPGFAACLSFLEIVMLIKNKIEGKDVANYESFFRSSQFLVWILLEIPHLQYKLTVLKAVLYFKEIISFSMAIVFGLFVAVSTIVDQPRNKREMNSIEDPLVPDDEKAEAEVTNLENNQSIWELLTFKFVNPMMDIGITRQLDFTDLLELPVELRAASSYEKLLSSWTVEHQHHHADSSLLRAMSNAYGWTYFRLGLLKVINDSIGFVSPLLLNKFIKFLQQGSGGADGYILAISLGLTSIIKSFLDSQYSFRLAKLKLMLRSSIMGIIYRKIGVALYLLYTQVNYAFLSGLAITVILIPVNKWISTRIAHATEEMMKHKDERISCAGELLAHIRTVKMYSWERLFTQRLVERRELEVKHLAVFTCVALFNTLISPLNSFPWVINGMIDAVISSRRLSKYLSSPEKRSSAIPASADLLKHHNTETNVNAMAVILRNVCCSWSSSSIVESSMILRDVSLELQKGIFVAIIGEVGCGKSSLLNSIIGEIHVTSGSVTSYGSIAYVPQVPWILSGSLRDNILLGEEFDPRRYEEVIHACTLDVDISAMVGGDMSHIGEKGLNLSGGQRARLALARALYHDSDVYLFDDVLSSVDSQVASYILEKAIMGPQMKRKTRILSTHNLQAISAADMIVVMANGLVKWFGTLDSFLATPYSTLSKPESSRVISSTFSEKNKGVSVAHESETNGLIDNDSETNGLIDNDSVVDHEEQREQNSVEARKEGMVELSVYKKYAAFAGWSIAFLICLSAFLMQASRNGNDLWLTYWVDTSTGSSRTIFYLIILAAFGALNSFFTLGRAFSFAYGGLCAAIQIHADLLNNLIGAPVSFFDQNPSGRILNRLSSDLYAIDDSLPFILNIFVANFFSLLGTLVVLSYSQVSFLLILVPLWLIYRKVQVGLALSYAAPVVSLLNGFLTTFTETEKEMISVERVVECCYQYVGIPQEELHGSESPHSGWPTEGNIEFEHVTLRYKEDLPPALNDVSFFISSGMQVGIIGRTGAGKSSILNALLRLAPICNGRILVDDFDVAKLAVRDLRGHFAVVPQSPFLFDGSLRENLDPFNRTTDLRIWEALDKCHMKTEIESIGGLDIHVKESGASFSVGQRQLLCLARAILKSSKILCLDECTANVDNQTASLLQNTISAECKGMTVLTIAHRISTVMKMDSILVLDQGKLVEEGNPEVLVDDKFSRFSRFAKASNIWSWSRDVDVFVGVDAAAALAVGVDGDDDVDGVEDAGEVAEDGEQHANPELHLLPPNNAKRKERNHQRNLIS</aaseq> |
| Gene Sequence |
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