Difference between revisions of "BGIOSGA025198"
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Revision as of 16:55, 22 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA025198 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA025198, complete gene. |
| LocusTag |
OS07G0163500 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA025198-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA025198-PA |
| Length |
11651 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:3280352..3292002 |
| Sequence Coding Region |
3280352..3280469,3280555..3280642,3281642..3281768,3282323..3282406,3282525..3282619 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:3280352..3292002 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:3280352..3292002 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGCTCGCGGGCGCCTCCTCGTCGGCCTGCCTCCGCCGCCTCAACCCGCTCCTCTTCTCCGCCCACCGCCGCCCCGCGTGGACCCCGCGCCGCGCCGCCCGCAGGTTCTGCGCAGCTGCAGTTGCCTCGGAGAGAGATGTGTTCACCTCCCCGGAGGTCGCCAAGTCGTTCGACTTCACCAATGAGGAGCGGATTTATAAGTGGTGGGAGTCTCAAGGATTCTTTAAGCCTAACTTTGATCGTGGAGGAGATCCATTTGTCATCCCAATGCCACCACCGAATGTTACCGGATCGCTGCATATGGGCCATGCTATGTTTGTCACCCTTGAGGATATAATGGTAAGGTATTTCCGTATGAAAGGAAGGCCTGCACTTTGGTTGCCTGGTACTGACCATGCAGGGATTGCCACTCAGTTGGTTGTGGAAAAGATGTTAGCTGCTGAAGGAATCAAAAGAACAGATCTGACCCGAGAGGAGTTCACTAAAAGAGTTTGGGAGTGGAAAGAAAAGTACGGGAGCACTATCACTAATCAGATTAAGCGATTGGGTGCATCTTGTGATTGGAGTCGTGAGCGTTTCACTCTTGATGAACAATTAAGTCGTGCAGTTATTGAAGCATTTGTTAGGCTTCATGAAAAAGGGCTTATATATCAAGGATCTTACTTGGTCAACTGGTCTCCAAACCTACAGACTGCAGTATCTGATTTAGAAGTGGAATACTCTGAAGAACCTGGTAATTTGTACTTCATCAAGTACCGTGTGGCAGGTGGATCAAGGGATGATTTTATGACTATTGCAACAACACGGCCTGAGACTCTCTTTGGCGATGTTGCAATTGCTGTAAACCCAGAGGATGAACGTTATGCAAAATATGTGGGCAAATTGGCTATTGTTCCCTTGACATTTGGGAGACATGTTCCTATTATTGCTGACCGGTATGTTGATCCAGAATTTGGAACAGGGGTGCTGAAGATTAGCCCTGGACATGATCATAACGATTATCATATTGCACGAAAACTTGGGTTGCCAATTCTCAATGTTATGAACAAAGATGGTACACTAAATGATGTTGCTGGATTATACAGTGGCATGGATCGTTTTGAGGCACGGGAGAAGTTGTGGTCTGACCTTGTTGAGACTAACTTGGCAGTAAAGAAGGAACCCTATACACTTCGAGTTCCTAGATCTCAACGGGGTGGTGAAGTAATAGAGCCATTGATTAGTAAACAGTGGTTTGTCACTATGGATCCATTAGCTGAAAAGGCCCTTCATGCTGTTGAAAAAGGGCAACTAACTATTCTTCCAGAGAGATTTGAAAAGATATATAATCATTGGTTGACAAACATAAAGGATTGGTGTATTAGTAGGCAACTGTGGTGGGGTCATCGGATCCCTGTTTGGTACATCGTTGGAAAGAAATGTGAGGAAGACTATATTGTTGCTAGAAGTGCAGAGGAGGCACTTGCAAAGGCTCAGGAAAAATATGGAAAATCAGTTGAAATATATCAAGATCCTGATGTTCTTGACACTTGGTTCTCAAGTGCTCTGTGGCCTTTCAGTACACTTGGTTGGCCAGACCTATCCAGTGAGGATTTTAAGCACTTTTATCCTGCAACTGTTCTTGAGACTGGCCATGACATTTTGTTCTTCTGGGTTGCACGAATGGTCATGATGGGAATTGAGTTTACAGGAACTGTGCCATTTTCTTATGTTTATCTTCATGGTCTCATCCGGGACTCTGAGGGACGAAAAATGTCTAAGACACTGGGGAATGTCATTGACCCTCTAGATACCATCAAAGAGTACGGGACAGATGCATTGAGATTTACACTTTCCATGGGTACCGCAGGCCAGGACCTTAATCTCTCTACAGAAAGATTGACATCAAACAAGGCTTTCACCAACAAACTCTGGAATGCAGGCAAATTTTTGTTGCAGAATTTGCCTGATAGAAGTGATGCCACTGCATGGGATGTCTTGTTAGCAAATAAGTTTGATACAGAAGCGTCACTTCAGAAACTACCACTGCCAGAATCCTGGGTGGTGACAGGATTACACGAACTCATCGATAGGGTCAGCACAAGCTACGACAAATTTTTCTTTGGCGATGCAGCTAGAGAAATCTACGATTTCTTTTGGGGGGACTTTGCTGATTGGTATATTGAAGCCAGCAAGACACGTCTTTACCACTCTGGTGATGATTCAGCTTCTTCTATGGCACAAAGTGTTCTGTTGTATGTGTTTGAAAACATACTGAAGCTATTGCACCCCTTCATGCCCTTTGTCACTGAAGAGTTATGGCAGGCATTGCCATACAGAAAACAAGCAATTATTGTTGCCCACTGGCCTGCGACTGATCTCCCTAAGAATTCTCTCTCGATCAAGAGATTTCAGAATTTGCAATCGTTGATAAGAGGTATCAGAAATGTTCGAGCAGAGTATTCTGTTGAGCCAGCCAAGCGAATATCTTCATCAGTTGTTGCTGCCGCAGATGTCCTAGATTACATATCGAAGGAGAAGCAGGTCCTGGCTTTACTTTCAAAGCTTGACATGCAGAGTATACATTTTAGCGAGTTGCCGCCAGGTGATGCAAATCAGTCGGTCCACATTGTTGCTGATGAGGGTCTGGAGGCCTATCTACCCCTGGCTGACATGGTGGATGTTTCTGAGGAAGTTAAGCGGCTGTCAAAGCGCCTCTCTAAGATGCAGTCGGAATATGATTCTTTGCTGGCCCGTCTCAATTCAGGAAGTTTTGTAGAGAAGGCCCCAGAAGAAATTGTTCGTGGAGTTCGTGAGAAAGCATCAGAAGCAGAAGAGAAGATCTCCCTCACCAAGAATCGGCTCGCTTTCCTGCAGTCAACAGTATCAAGTTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MALAGASSSACLRRLNPLLFSAHRRPAWTPRRAARRFCAAAVASERDVFTSPEVAKSFDFTNEERIYKWWESQGFFKPNFDRGGDPFVIPMPPPNVTGSLHMGHAMFVTLEDIMVRYFRMKGRPALWLPGTDHAGIATQLVVEKMLAAEGIKRTDLTREEFTKRVWEWKEKYGSTITNQIKRLGASCDWSRERFTLDEQLSRAVIEAFVRLHEKGLIYQGSYLVNWSPNLQTAVSDLEVEYSEEPGNLYFIKYRVAGGSRDDFMTIATTRPETLFGDVAIAVNPEDERYAKYVGKLAIVPLTFGRHVPIIADRYVDPEFGTGVLKISPGHDHNDYHIARKLGLPILNVMNKDGTLNDVAGLYSGMDRFEAREKLWSDLVETNLAVKKEPYTLRVPRSQRGGEVIEPLISKQWFVTMDPLAEKALHAVEKGQLTILPERFEKIYNHWLTNIKDWCISRQLWWGHRIPVWYIVGKKCEEDYIVARSAEEALAKAQEKYGKSVEIYQDPDVLDTWFSSALWPFSTLGWPDLSSEDFKHFYPATVLETGHDILFFWVARMVMMGIEFTGTVPFSYVYLHGLIRDSEGRKMSKTLGNVIDPLDTIKEYGTDALRFTLSMGTAGQDLNLSTERLTSNKAFTNKLWNAGKFLLQNLPDRSDATAWDVLLANKFDTEASLQKLPLPESWVVTGLHELIDRVSTSYDKFFFGDAAREIYDFFWGDFADWYIEASKTRLYHSGDDSASSMAQSVLLYVFENILKLLHPFMPFVTEELWQALPYRKQAIIVAHWPATDLPKNSLSIKRFQNLQSLIRGIRNVRAEYSVEPAKRISSSVVAAADVLDYISKEKQVLALLSKLDMQSIHFSELPPGDANQSVHIVADEGLEAYLPLADMVDVSEEVKRLSKRLSKMQSEYDSLLARLNSGSFVEKAPEEIVRGVREKASEAEEKISLTKNRLAFLQSTVSS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..118#204..291#1291..1417#1972..2055#2174..2268#2687..2778#2950..3003#3844..3896#4095..4162#4400..4475#4782..4865#5416..5564#5998..6115#6206..6322#6573..6793#7219..7308#7455..7566#8017..8127#8202..8339#8431..8481#8561..8673#10205..10352#10449..10553#10640..10741#11118..11190#11270..11436#11529..11651#ATGGCGCTCGCGGGCGCCTCCTCGTCGGCCTGCCTCCGCCGCCTCAACCCGCTCCTCTTCTCCGCCCACCGCCGCCCCGCGTGGACCCCGCGCCGCGCCGCCCGCAGGTTCTGCGCAGGTACCGGCCGTCTTCTGCTTCTACTGCCCTTTGTTTGGTCCGTTTGGTTGGTGTTGATTCGGTGAAGGGGTTGGTTCCGTTGCAGCTGCAGTTGCCTCGGAGAGAGATGTGTTCACCTCCCCGGAGGTCGCCAAGTCGTTCGACTTCACCAATGAGGAGCGGATTTATAAGTGGTAAGCTAGCATTTCTACCAGTTATCCACTATTTCCCCATTTTCATGAGGTAATGGAACTATGGCTGAGATGATTTTCCCAGTAATTAATTTGTCAATCTTAAACGTGTGTTACCTTACATTGGACACTCACCAGTAAGTTAATTTGTGATACTCATGATACAGCGAGCAGTTTAGTGCCATTTTTCCTTGCAGTTTTAGACTGTTCGGGTGATTTTATGGTATTTTTTGATATAGCTTCAACCATTAGATTGGCAATTGTATCTGGATGAGCAAAATTCTCCTTACACTCCCATGTAGTTGTGCCCTGTAGTATTTGAGAAGTAAGCTTCTCACAATGCTTCTACTTAATGCCTTTAAGCTAAACAATTTCAATTTCCAGAACTAAAAGTGAGTTCCAGTAACAGAAAAGGGTATGCTATAACAAGCTTTCTCGCAATTGATTTTCTATTATCCATGTTAGACTTGATCACTTACTAGTGAGTTAGTGACCTGCCTTTGAGCATTGCCTAATGTCAATGCAAGGTTTAGCATTACGACCGTATCAAGATTGACCGATTAATACTCTTATTACTTGACTCAAATATTGTGTTTTTAGTAGATTAATACTCTTATTACTTGACTCAGCTATTGTGTCGTCAGTTTTTTACTGAAATAGCATTCTAAATGCAAAGTACAACTCTAGGATCTAGGTTGAAGATAGTCTGTATAAAGGTATCATGATTTGGTCCAGTTCCATTTTTCTAAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATATGCTGTTGCATTAGATTACATTGATATGATTGTTTACCTGCTCTAGTTGACACATAAAAATGTAAAAACTGATGAATTGCATTTAACATATTTAAGTCAACAGGTCTAGTTTTATTTTGCTACTTGCTTTGTTTGCCTGTTTCACTTCAAGTTCATGAAGAAATGCACTTCGGTATTTTCTGGTCCTACAATAAATTTTCCTTATAACATATATGTTGTATCTTTGTAGGTGGGAGTCTCAAGGATTCTTTAAGCCTAACTTTGATCGTGGAGGAGATCCATTTGTCATCCCAATGCCACCACCGAATGTTACCGGATCGCTGCATATGGGCCATGCTATGTTTGTCACCCTTGAGGTAGGTATGATGATTGAAAATTTAAGATTTTTTTCCTCTTGTTGAATAACTATAGATTGATTATTTCTTTACTAGCAGATCATAATTGAGTACATTTCATGATTTATACGTTCACTTTGTTGAATCATGACATATGAGTTTCATCTTTTTTACCCATTTGAAGTGATTTGCATGTTAACATGAGCATAAGCTGCTATGGATGTACTTACCAAGGTGAATCTGTTTCTTAAAGACAAGAACATCATTTTTTTAATCACACTAGCAATTTAGTTCTCTTGCACTGGACCCATGAAACTGTGCCATGGATGGTAAACTGAATAGTACTTGCAATTGCTATATTAAGCAGAAGTGTTGGACAGCATCTGATAATATCCAGAGGTTCTGTGAACTGACATGTTTCAGTTAAACTAGCTTATTTTGTGGTCTGAATTCGTAGATAGTTATTGGTGACAGCACTATGTTGATAATGAGTTATTTTTGTCCCCCCCCCCCCCATTTTTTAGGCACTGTAATCTTTTTACTACTAAATTGTCCCTTTTTGTGTAAGTACTCAGGATATAATGGTAAGGTATTTCCGTATGAAAGGAAGGCCTGCACTTTGGTTGCCTGGTACTGACCATGCAGGGATTGCCACTCAGGTTTGTAGATCTTACTGCACATCTGATATGAAATGATAAATTCTATTTTGTGTTCAGCATGACTTTGTGAAGTGATGGGCTGATTTTTATTTACTTTTTTTTTGCATTTACATTTTAGTTGGTTGTGGAAAAGATGTTAGCTGCTGAAGGAATCAAAAGAACAGATCTGACCCGAGAGGAGTTCACTAAAAGAGTTTGGGAGTGGAAAGAAAAGTCAGCCCTTTTTCTGAAGCTAGATCAATTTTTCTTCATTGTTTCTTTATGCACCTGTAATTGCTATATTTGTTTTTCTAATATGAAGTGATCATTGCTAATAGTTACTTGGATTTACTATTAACCATATATACCCTTGCTCCTACCTCCATTTTTTTACGTGTTTGCCATGAAGGCTCATGTGCATTACAGTTTATTAACTATCTTCTGGTATCATTATCGTGTTGGGTGGTACCTGTCATAATAATTTGATCATCTAGATGACCAGCCTTTTGTTATTATTCTGAATTGCCAGTTAAACTATCATGAACTTGGGATGGAATAATAAATATTCTAGTTGATAAAAAAAATCATGATTCAAGAAGGTTACATATTTTATAAATTCTAGCAATCACTCCAAATGATGTTTCCTTTCCAGGTACGGGAGCACTATCACTAATCAGATTAAGCGATTGGGTGCATCTTGTGATTGGAGTCGTGAGCGTTTCACTCTTGATGAACAATTAAGTCGTAAGTGTAGCCTTTATTTTCCATTGCAAATGATGCAATTTGCATTTGTTAGTATATGTATCATTATAGTGATGGTAGTCGGTCGATCAACCCCTCAACCTCAAGCTTATCATCAGCGCTTGGTGGTTTGTACAACTGATGTCTCACTAGTTTTTTTCTTTCTACTTACAGGTGCAGTTATTGAAGCATTTGTTAGGCTTCATGAAAAAGGGCTTATATATCAAGGTAATTAATATAATCATTTACTCGCTCTATTACAAAGGAAGCAAATGTGCATAATCTTGTGCTGATATTATGTGTGATAGTTTTCAGTTTTTAATCTTTTCCCTATGTTTTTTCTGTCAGTGTAACCTAATTTTCTTGGTTGTAGTTTCAAATTGACTATGTTAACATATTTAGTGTTGATAGATTTAGTACTAACTGATTTTTTTTTAAAAAAATTCAGTGTCAATAGTTTGAACAGTAGTGAGAGGTACAAGAAGTTGGGGCATGTGGTAATAACTTTATTTTCTATGTAATGTATTATCACTTTATCAGTTACAGCACAAGTTTCAGAAGTTTCCCAGGGTCCTATTTGGAACAAACTTTAAACTTTTAGCCCCAAACTATATCAAGTGCATCCGTTTATTTTGCTGATAGGATAGGTCTGTGGTGTAATGTACATCATAAATTTTTGAATCAGAATTATAGGATTTGTTGGCTCTGAGCTTTTTTGTTGCTTACTGGAGACTAAGTTCTCTTATGACTGGAATTTACAAGCAGAGAGGAGCGGCAGCAAGATTTACTAAAATTATGTCCCAAGCAATTTGTTACTTCCATCGCTAGTATCAAGATGCCTTTTGCCGTACGTTTTTAATATGTTCTGGTACACACTTGGGTGTGTTCATGTCCATGATGCCCGTGCTTGTTATGGCATTTTCTATTGTGATAGTTGCGTCGTTGAACAGAAATTTAGGATTTTTTCTTCATTCAATTCTTGTGTTTTTCCTGAATTTGAGAGTCTAGTTTTGCCTTATGTGACCTTGATGGTAAATATTGGTTAATTTATTGTATTTTCGTTCACAGGATCTTACTTGGTCAACTGGTCTCCAAACCTACAGACTGCAGTATCTGATTTAGTATGTTACAATATTACCTCTCATTTTTTAAGAAATAGCTGCACACTTCTATCTGTGCAGATATATAATCTAAGCAAAAAATAAAAAATAAAACTTGAGAATAATTACATACAGAAGCTGACAAACTTCAATTACTTCTTCATGGATAGTTGCATGAGCCAACTCCAGATTTGATCCTGAAATGGTTTATCTAACCAGGAAGTGGAATACTCTGAAGAACCTGGTAATTTGTACTTCATCAAGTACCGTGTGGCAGGTGGATCAAGGTACTTCTTGACTTATCTTTAATCTTGTGGCTATATGTTTTATCATTATTCATTTTTTAATCGATGGTGATGTTATCATTGTCCATTTTTGTGATGTTTAAATGTGAATGAGTTTGGATGATGCGCGCTATAAAGTTTATGTTTTGCATTCTATTACAAGGAATCTAACAGCATGGTCGACACTGTATGTTGATGAAAATTACTTATATGTATTTAAAACTTAAGCCTCTGGTGCAGGGATGATTTTATGACTATTGCAACAACACGGCCTGAGACTCTCTTTGGCGATGTTGCAATTGCTGTAAACCCAGAGGTATCAGAAAAAGAAAGCATTCCTTGTGTCCTGTTACAACTTACTTCCCCCATCCCAAAATATAGCAACTTCTAGCATTCAAAAGTTGTCCTAAAATCAAAATGTAGCAACTTCTCCACCTACTCCCTCCTCTCAACCAACCACAACCATCCTCCATTTAATATCGCCACCTAGTATTCTTAATCTCTGCACAAAACCTAAAAAAGCC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